MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_017278	CCGT	2	8	540582	540589	0 %	25 %	25 %	50 %	384438942
13503	NC_017278	AGG	2	6	540594	540599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438942
13504	NC_017278	TCC	2	6	540681	540686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13505	NC_017278	CAC	2	6	540794	540799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438942
13506	NC_017278	CGCC	2	8	540846	540853	0 %	0 %	25 %	75 %	384438942
13507	NC_017278	GCC	3	9	540870	540878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438942
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13509	NC_017278	TGG	2	6	540907	540912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438942
13510	NC_017278	CCT	2	6	540934	540939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13511	NC_017278	GATG	2	8	541048	541055	25 %	25 %	50 %	0 %	384438942
13512	NC_017278	GGA	2	6	541102	541107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438942
13513	NC_017278	C	6	6	541165	541170	0 %	0 %	0 %	100 %	384438942
13514	NC_017278	AGG	3	9	541215	541223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438942
13515	NC_017278	CCT	2	6	541225	541230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13516	NC_017278	G	8	8	541262	541269	0 %	0 %	100 %	0 %	384438942
13517	NC_017278	CCT	2	6	541291	541296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13518	NC_017278	TGC	2	6	541324	541329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438942
13519	NC_017278	GTA	2	6	541385	541390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438942
13520	NC_017278	GCG	2	6	541506	541511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438942
13521	NC_017278	GGT	2	6	541561	541566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438942
13522	NC_017278	GGA	2	6	541636	541641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438942
13523	NC_017278	TCC	3	9	541647	541655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13524	NC_017278	CTG	2	6	541679	541684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438942
13525	NC_017278	CGG	2	6	541714	541719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438942
13526	NC_017278	CCT	2	6	541750	541755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13527	NC_017278	CCT	2	6	541762	541767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13528	NC_017278	GGC	2	6	541774	541779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438942
13529	NC_017278	AGGCG	2	10	541783	541792	20 %	0 %	60 %	20 %	384438942
13530	NC_017278	TCC	3	9	541797	541805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
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13534	NC_017278	TGG	3	9	541960	541968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438942
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13536	NC_017278	GCACCC	2	12	541981	541992	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384438942
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13539	NC_017278	C	7	7	542039	542045	0 %	0 %	0 %	100 %	384438942
13540	NC_017278	TCC	2	6	542058	542063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13541	NC_017278	CACC	2	8	542087	542094	25 %	0 %	0 %	75 %	384438942
13542	NC_017278	CCT	2	6	542105	542110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438943
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13553	NC_017278	CTC	2	6	542446	542451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438943
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13555	NC_017278	GGC	2	6	542503	542508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438943
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13569	NC_017278	CCTT	2	8	543007	543014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13572	NC_017278	CGCCC	2	10	543121	543130	0 %	0 %	20 %	80 %	384438944
13573	NC_017278	GTA	2	6	543151	543156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438944
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13587	NC_017278	CTT	2	6	543613	543618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438944
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13593	NC_017278	C	6	6	543994	543999	0 %	0 %	0 %	100 %	384438944
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13597	NC_017278	GGGCC	2	10	544176	544185	0 %	0 %	60 %	40 %	384438944
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13601	NC_017278	CCT	2	6	544464	544469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438944
13602	NC_017278	C	7	7	544471	544477	0 %	0 %	0 %	100 %	384438944
13603	NC_017278	TGG	2	6	544496	544501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438944
13604	NC_017278	C	7	7	544528	544534	0 %	0 %	0 %	100 %	384438944
13605	NC_017278	TCC	2	6	544586	544591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438944
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13609	NC_017278	CAC	3	9	544630	544638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438944
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13613	NC_017278	C	6	6	544749	544754	0 %	0 %	0 %	100 %	384438944
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