MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017278	TCC	2	6	521250	521255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438918
13002	NC_017278	GCC	2	6	521336	521341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438918
13003	NC_017278	GGA	2	6	521368	521373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438918
13004	NC_017278	CCT	2	6	521458	521463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438918
13005	NC_017278	CGGG	2	8	521486	521493	0 %	0 %	75 %	25 %	384438918
13006	NC_017278	CCT	2	6	521500	521505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438918
13007	NC_017278	AGG	2	6	521529	521534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438918
13008	NC_017278	CGCT	2	8	521541	521548	0 %	25 %	25 %	50 %	384438918
13009	NC_017278	CCT	2	6	521563	521568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438918
13010	NC_017278	GAG	2	6	521588	521593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438918
13011	NC_017278	G	7	7	521639	521645	0 %	0 %	100 %	0 %	384438918
13012	NC_017278	AGG	2	6	521646	521651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438918
13013	NC_017278	GAG	2	6	521684	521689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438918
13014	NC_017278	GGC	2	6	521696	521701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438918
13015	NC_017278	CCT	3	9	521734	521742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438918
13016	NC_017278	CAC	2	6	521759	521764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438918
13017	NC_017278	ACCC	2	8	521795	521802	25 %	0 %	0 %	75 %	384438918
13018	NC_017278	GAA	2	6	521825	521830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438918
13019	NC_017278	AGG	2	6	521841	521846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438918
13020	NC_017278	AGG	3	9	521889	521897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438918
13021	NC_017278	CCA	2	6	521908	521913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438918
13022	NC_017278	GGC	2	6	521990	521995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438918
13023	NC_017278	GGGCCA	2	12	522073	522084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438919
13024	NC_017278	GGC	2	6	522085	522090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438919
13025	NC_017278	CCT	2	6	522094	522099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438919
13026	NC_017278	GTG	2	6	522186	522191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438919
13027	NC_017278	G	7	7	522229	522235	0 %	0 %	100 %	0 %	384438919
13028	NC_017278	TCC	2	6	522294	522299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438919
13029	NC_017278	CCT	2	6	522301	522306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438919
13030	NC_017278	CCA	2	6	522334	522339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438919
13031	NC_017278	CGG	2	6	522397	522402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438919
13032	NC_017278	CAC	2	6	522422	522427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438919
13033	NC_017278	GGC	2	6	522430	522435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438919
13034	NC_017278	AAG	2	6	522468	522473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438919
13035	NC_017278	GCC	2	6	522509	522514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438919
13036	NC_017278	TCT	2	6	522544	522549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438919
13037	NC_017278	GCC	2	6	522581	522586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438919
13038	NC_017278	GTG	2	6	522612	522617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438919
13039	NC_017278	CAC	2	6	522623	522628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438919
13040	NC_017278	TGGGGT	2	12	522643	522654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438919
13041	NC_017278	CCA	2	6	522667	522672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438919
13042	NC_017278	CCA	3	9	522694	522702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438919
13043	NC_017278	TCG	2	6	522717	522722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438919
13044	NC_017278	GCT	2	6	522767	522772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438919
13045	NC_017278	GGC	2	6	522811	522816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438919
13046	NC_017278	CCT	2	6	522820	522825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438919
13047	NC_017278	ACC	2	6	522867	522872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438919
13048	NC_017278	C	6	6	522920	522925	0 %	0 %	0 %	100 %	384438919
13049	NC_017278	GGC	2	6	522926	522931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438919
13050	NC_017278	C	6	6	523094	523099	0 %	0 %	0 %	100 %	384438919
13051	NC_017278	GTA	2	6	523100	523105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438919
13052	NC_017278	TTG	2	6	523134	523139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384438919
13053	NC_017278	TTC	2	6	523226	523231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438919
13054	NC_017278	GGCCCT	2	12	523295	523306	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_017278	GGC	2	6	523361	523366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438920
13056	NC_017278	TGGC	2	8	523490	523497	0 %	25 %	50 %	25 %	384438920
13057	NC_017278	GCCTTC	2	12	523521	523532	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384438920
13058	NC_017278	TCC	2	6	523546	523551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438920
13059	NC_017278	GGGGC	2	10	523560	523569	0 %	0 %	80 %	20 %	384438920
13060	NC_017278	TCC	2	6	523573	523578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438920
13061	NC_017278	GGC	2	6	523585	523590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438920
13062	NC_017278	CAGGC	2	10	523659	523668	20 %	0 %	40 %	40 %	384438921
13063	NC_017278	C	6	6	523676	523681	0 %	0 %	0 %	100 %	384438921
13064	NC_017278	CGC	2	6	523689	523694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438921
13065	NC_017278	CTC	2	6	523700	523705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438921
13066	NC_017278	TCC	2	6	523749	523754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438921
13067	NC_017278	GCGG	2	8	523784	523791	0 %	0 %	75 %	25 %	384438921
13068	NC_017278	GTA	2	6	523805	523810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438921
13069	NC_017278	G	7	7	523826	523832	0 %	0 %	100 %	0 %	384438921
13070	NC_017278	CCT	2	6	523867	523872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438921
13071	NC_017278	TGG	2	6	523897	523902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438921
13072	NC_017278	GTC	2	6	523919	523924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438921
13073	NC_017278	CAC	2	6	523931	523936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438921
13074	NC_017278	CCG	2	6	523951	523956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438921
13075	NC_017278	TGGG	2	8	524001	524008	0 %	25 %	75 %	0 %	384438921
13076	NC_017278	CCG	2	6	524089	524094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438921
13077	NC_017278	CAC	2	6	524120	524125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438921
13078	NC_017278	CTC	2	6	524159	524164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438921
13079	NC_017278	AGG	2	6	524205	524210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438921
13080	NC_017278	CGGGC	2	10	524215	524224	0 %	0 %	60 %	40 %	384438921
13081	NC_017278	CTC	2	6	524294	524299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438921
13082	NC_017278	AGGGCC	2	12	524352	524363	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438921
13083	NC_017278	GGC	2	6	524398	524403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438921
13084	NC_017278	AGG	2	6	524445	524450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438921
13085	NC_017278	GTG	2	6	524451	524456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438921
13086	NC_017278	GAG	2	6	524465	524470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438921
13087	NC_017278	C	7	7	524480	524486	0 %	0 %	0 %	100 %	384438921
13088	NC_017278	CGG	2	6	524506	524511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438921
13089	NC_017278	GGCG	2	8	524539	524546	0 %	0 %	75 %	25 %	384438921
13090	NC_017278	AGG	2	6	524604	524609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438921
13091	NC_017278	GTG	2	6	524721	524726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438921
13092	NC_017278	CTC	2	6	524786	524791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438921
13093	NC_017278	CCA	2	6	524827	524832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438921
13094	NC_017278	CCT	2	6	524869	524874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438921
13095	NC_017278	TGC	2	6	524883	524888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438921
13096	NC_017278	CGC	2	6	524918	524923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438921
13097	NC_017278	CTC	2	6	524963	524968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438921
13098	NC_017278	ATCC	2	8	524978	524985	25 %	25 %	0 %	50 %	384438921
13099	NC_017278	GGC	2	6	525012	525017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438922
13100	NC_017278	C	8	8	525077	525084	0 %	0 %	0 %	100 %	384438922
13101	NC_017278	GAG	2	6	525165	525170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438922
13102	NC_017278	CCA	2	6	525269	525274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438922
13103	NC_017278	GCC	2	6	525279	525284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438922
13104	NC_017278	GCGGTG	2	12	525301	525312	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384438922
13105	NC_017278	CCT	2	6	525341	525346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438922
13106	NC_017278	GAG	2	6	525405	525410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438922
13107	NC_017278	AAG	2	6	525414	525419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438922
13108	NC_017278	C	6	6	525437	525442	0 %	0 %	0 %	100 %	384438922
13109	NC_017278	AGG	3	9	525454	525462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438922
13110	NC_017278	GCC	2	6	525476	525481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438922
13111	NC_017278	CCGC	2	8	525494	525501	0 %	0 %	25 %	75 %	384438922
13112	NC_017278	CAC	2	6	525522	525527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438922
13113	NC_017278	CCA	2	6	525530	525535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438922
13114	NC_017278	G	7	7	525543	525549	0 %	0 %	100 %	0 %	384438922
13115	NC_017278	CCT	2	6	525623	525628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438922
13116	NC_017278	CAC	2	6	525726	525731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438922
13117	NC_017278	GGC	2	6	525788	525793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438922
13118	NC_017278	GCC	2	6	525820	525825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438922
13119	NC_017278	C	6	6	525866	525871	0 %	0 %	0 %	100 %	384438922
13120	NC_017278	GCA	2	6	525878	525883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438922
13121	NC_017278	TGG	2	6	525904	525909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438922
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13243	NC_017278	CGG	2	6	530898	530903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438928
13244	NC_017278	CCCCTC	2	12	530908	530919	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384438928
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13246	NC_017278	G	6	6	531001	531006	0 %	0 %	100 %	0 %	384438928
13247	NC_017278	CCT	2	6	531030	531035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438928
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13250	NC_017278	C	7	7	531249	531255	0 %	0 %	0 %	100 %	384438928
13251	NC_017278	CCCT	2	8	531317	531324	0 %	25 %	0 %	75 %	384438928
13252	NC_017278	C	6	6	531395	531400	0 %	0 %	0 %	100 %	384438928
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13255	NC_017278	CCT	2	6	531459	531464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438929
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13259	NC_017278	CCTCCC	2	12	531602	531613	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384438929
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13264	NC_017278	CCG	2	6	531780	531785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438929
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13271	NC_017278	CAG	2	6	532037	532042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13349	NC_017278	CCT	2	6	535055	535060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438934
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13351	NC_017278	CTC	2	6	535071	535076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438934
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13353	NC_017278	GGCC	2	8	535126	535133	0 %	0 %	50 %	50 %	384438934
13354	NC_017278	CTG	2	6	535143	535148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438934
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13359	NC_017278	CTC	2	6	535305	535310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438934
13360	NC_017278	G	7	7	535314	535320	0 %	0 %	100 %	0 %	384438934
13361	NC_017278	TGG	2	6	535327	535332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438934
13362	NC_017278	CCTGGC	2	12	535337	535348	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438934
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13364	NC_017278	GCTG	2	8	535390	535397	0 %	25 %	50 %	25 %	384438934
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13485	NC_017278	C	6	6	540091	540096	0 %	0 %	0 %	100 %	384438942
13486	NC_017278	C	7	7	540104	540110	0 %	0 %	0 %	100 %	384438942
13487	NC_017278	CTC	2	6	540140	540145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13488	NC_017278	TCC	2	6	540195	540200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13489	NC_017278	AGG	2	6	540228	540233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438942
13490	NC_017278	CCT	2	6	540238	540243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13491	NC_017278	GTA	2	6	540257	540262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438942
13492	NC_017278	C	6	6	540271	540276	0 %	0 %	0 %	100 %	384438942
13493	NC_017278	CCAGC	2	10	540278	540287	20 %	0 %	20 %	60 %	384438942
13494	NC_017278	TCC	2	6	540297	540302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
13495	NC_017278	GCCC	2	8	540319	540326	0 %	0 %	25 %	75 %	384438942
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13498	NC_017278	GGC	3	9	540392	540400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438942
13499	NC_017278	CCT	2	6	540469	540474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438942
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