MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017278	G	6	6	502660	502665	0 %	0 %	100 %	0 %	384438899
12503	NC_017278	TCC	2	6	502702	502707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438899
12504	NC_017278	ACC	2	6	502741	502746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438899
12505	NC_017278	GAG	2	6	502755	502760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438899
12506	NC_017278	GGC	2	6	502793	502798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438899
12507	NC_017278	GGC	2	6	502859	502864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438899
12508	NC_017278	CGAGGC	2	12	502883	502894	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438899
12509	NC_017278	CCT	2	6	502898	502903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438899
12510	NC_017278	TGG	2	6	502918	502923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438899
12511	NC_017278	CCT	2	6	502931	502936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438899
12512	NC_017278	CGGGGG	2	12	502940	502951	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	384438899
12513	NC_017278	TTC	2	6	502995	503000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438899
12514	NC_017278	CGG	2	6	503214	503219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438900
12515	NC_017278	GAC	2	6	503344	503349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438900
12516	NC_017278	CAC	2	6	503383	503388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438900
12517	NC_017278	CCGC	2	8	503393	503400	0 %	0 %	25 %	75 %	384438900
12518	NC_017278	ACC	2	6	503426	503431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438900
12519	NC_017278	GGC	2	6	503463	503468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438900
12520	NC_017278	CGC	2	6	503487	503492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438900
12521	NC_017278	G	8	8	503509	503516	0 %	0 %	100 %	0 %	384438900
12522	NC_017278	GGC	2	6	503521	503526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438900
12523	NC_017278	C	6	6	503552	503557	0 %	0 %	0 %	100 %	384438900
12524	NC_017278	CGC	2	6	503578	503583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438900
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12526	NC_017278	GAT	2	6	503670	503675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438900
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12528	NC_017278	G	6	6	503742	503747	0 %	0 %	100 %	0 %	384438900
12529	NC_017278	GCG	2	6	503757	503762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438900
12530	NC_017278	CGGGG	2	10	503771	503780	0 %	0 %	80 %	20 %	384438900
12531	NC_017278	G	6	6	503777	503782	0 %	0 %	100 %	0 %	384438900
12532	NC_017278	CGG	5	15	503795	503809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438900
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12537	NC_017278	CCT	2	6	503973	503978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438900
12538	NC_017278	G	7	7	503998	504004	0 %	0 %	100 %	0 %	384438900
12539	NC_017278	CGC	2	6	504078	504083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438900
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12543	NC_017278	TGG	2	6	504203	504208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438900
12544	NC_017278	CGG	2	6	504231	504236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438900
12545	NC_017278	GAG	3	9	504292	504300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438900
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12550	NC_017278	C	6	6	504627	504632	0 %	0 %	0 %	100 %	384438901
12551	NC_017278	GCG	2	6	504667	504672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438901
12552	NC_017278	GAG	2	6	504752	504757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438901
12553	NC_017278	GCC	2	6	504827	504832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438901
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12555	NC_017278	GAG	2	6	505020	505025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438902
12556	NC_017278	CCT	2	6	505034	505039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438902
12557	NC_017278	TCC	2	6	505099	505104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438902
12558	NC_017278	C	7	7	505103	505109	0 %	0 %	0 %	100 %	384438902
12559	NC_017278	AGG	3	9	505117	505125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438902
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12562	NC_017278	C	6	6	505208	505213	0 %	0 %	0 %	100 %	384438902
12563	NC_017278	GGT	2	6	505217	505222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438902
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12566	NC_017278	CTT	2	6	505281	505286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438902
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12585	NC_017278	G	7	7	506074	506080	0 %	0 %	100 %	0 %	384438903
12586	NC_017278	G	6	6	506125	506130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12588	NC_017278	AAG	2	6	506174	506179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438904
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12593	NC_017278	TGG	2	6	506406	506411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438904
12594	NC_017278	CTT	2	6	506452	506457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438904
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12599	NC_017278	GAG	2	6	506711	506716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438904
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12602	NC_017278	CAC	2	6	506863	506868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438904
12603	NC_017278	G	6	6	506884	506889	0 %	0 %	100 %	0 %	384438904
12604	NC_017278	GTG	2	6	506921	506926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438904
12605	NC_017278	GCC	2	6	506927	506932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438904
12606	NC_017278	CCA	2	6	506944	506949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438904
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12609	NC_017278	CCT	2	6	507111	507116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438904
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12611	NC_017278	GCCTGG	3	18	507208	507225	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_017278	G	6	6	507423	507428	0 %	0 %	100 %	0 %	384438905
12613	NC_017278	G	6	6	507482	507487	0 %	0 %	100 %	0 %	384438905
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12617	NC_017278	CTGGG	2	10	507706	507715	0 %	20 %	60 %	20 %	384438905
12618	NC_017278	GGA	2	6	507717	507722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438905
12619	NC_017278	CTCC	2	8	507730	507737	0 %	25 %	0 %	75 %	384438905
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12985	NC_017278	GGC	2	6	520820	520825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438918
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12987	NC_017278	G	6	6	520838	520843	0 %	0 %	100 %	0 %	384438918
12988	NC_017278	CCT	2	6	520876	520881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438918
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