MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11004	NC_017278	AGG	2	6	444045	444050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438823
11005	NC_017278	AGG	2	6	444096	444101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438823
11006	NC_017278	GGC	2	6	444151	444156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438824
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11008	NC_017278	GTA	2	6	444235	444240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438824
11009	NC_017278	GAG	2	6	444250	444255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438824
11010	NC_017278	GGC	2	6	444277	444282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438824
11011	NC_017278	GGAA	2	8	444288	444295	50 %	0 %	50 %	0 %	384438824
11012	NC_017278	CCAGG	2	10	444316	444325	20 %	0 %	40 %	40 %	384438824
11013	NC_017278	C	7	7	444331	444337	0 %	0 %	0 %	100 %	384438824
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11017	NC_017278	CCA	2	6	444594	444599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438824
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11019	NC_017278	GTA	2	6	444652	444657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438824
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11021	NC_017278	GCT	2	6	444684	444689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438824
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11053	NC_017278	GGA	2	6	445695	445700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_017278	AAG	2	6	445749	445754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_017278	GCC	2	6	445769	445774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_017278	GCGG	2	8	445776	445783	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11057	NC_017278	TGG	2	6	445816	445821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438826
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11105	NC_017278	G	6	6	447858	447863	0 %	0 %	100 %	0 %	384438829
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11123	NC_017278	AGG	2	6	448382	448387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438829
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11223	NC_017278	GTGGC	2	10	451720	451729	0 %	20 %	60 %	20 %	384438830
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11226	NC_017278	CGG	2	6	451905	451910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438831
11227	NC_017278	ATG	2	6	452013	452018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11228	NC_017278	CCT	2	6	452050	452055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438832
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11230	NC_017278	TGG	2	6	452094	452099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438832
11231	NC_017278	TCC	2	6	452125	452130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438832
11232	NC_017278	G	6	6	452151	452156	0 %	0 %	100 %	0 %	384438832
11233	NC_017278	TCC	2	6	452172	452177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438832
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11235	NC_017278	T	7	7	452199	452205	0 %	100 %	0 %	0 %	384438832
11236	NC_017278	AGG	2	6	452223	452228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438832
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11239	NC_017278	G	6	6	452278	452283	0 %	0 %	100 %	0 %	384438832
11240	NC_017278	C	7	7	452323	452329	0 %	0 %	0 %	100 %	384438832
11241	NC_017278	CCT	2	6	452359	452364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438832
11242	NC_017278	TCC	2	6	452382	452387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438832
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11244	NC_017278	GTA	2	6	452487	452492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438833
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11353	NC_017278	AGGT	2	8	457587	457594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11355	NC_017278	GCT	2	6	457647	457652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11363	NC_017278	CTA	2	6	457843	457848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11364	NC_017278	CAG	2	6	457980	457985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11490	NC_017278	CCT	2	6	462572	462577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438840
11491	NC_017278	GGT	2	6	462596	462601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438840
11492	NC_017278	GAG	3	9	462642	462650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438840
11493	NC_017278	GAG	2	6	462666	462671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438840
11494	NC_017278	GAGC	2	8	462690	462697	25 %	0 %	50 %	25 %	384438840
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11498	NC_017278	GAG	2	6	462933	462938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438840
11499	NC_017278	CCG	2	6	462950	462955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438840
11500	NC_017278	G	6	6	462966	462971	0 %	0 %	100 %	0 %	384438840

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