MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017278	GGGGC	2	10	17979	17988	0 %	0 %	80 %	20 %	384438419
502	NC_017278	GCC	2	6	18003	18008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438419
503	NC_017278	GCGG	2	8	18030	18037	0 %	0 %	75 %	25 %	384438419
504	NC_017278	CCG	2	6	18097	18102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438419
505	NC_017278	CGC	2	6	18120	18125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438419
506	NC_017278	GGT	3	9	18135	18143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438419
507	NC_017278	G	7	7	18162	18168	0 %	0 %	100 %	0 %	384438419
508	NC_017278	GAG	2	6	18175	18180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438419
509	NC_017278	CCA	2	6	18219	18224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438419
510	NC_017278	C	7	7	18232	18238	0 %	0 %	0 %	100 %	384438419
511	NC_017278	GGC	2	6	18262	18267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438419
512	NC_017278	AAG	2	6	18390	18395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438420
513	NC_017278	C	7	7	18473	18479	0 %	0 %	0 %	100 %	384438420
514	NC_017278	TGG	2	6	18486	18491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438420
515	NC_017278	TCC	2	6	18492	18497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438420
516	NC_017278	GAG	2	6	18503	18508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438420
517	NC_017278	GGC	2	6	18515	18520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438420
518	NC_017278	GCA	2	6	18529	18534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438420
519	NC_017278	CAC	2	6	18569	18574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438420
520	NC_017278	GTC	2	6	18587	18592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438420
521	NC_017278	CGG	2	6	18595	18600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438420
522	NC_017278	ACC	2	6	18663	18668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438420
523	NC_017278	C	7	7	18752	18758	0 %	0 %	0 %	100 %	384438420
524	NC_017278	GCG	2	6	18810	18815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438420
525	NC_017278	GTG	2	6	18863	18868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438420
526	NC_017278	CCCG	2	8	18894	18901	0 %	0 %	25 %	75 %	384438420
527	NC_017278	CGT	2	6	18940	18945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438420
528	NC_017278	AAG	2	6	18972	18977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438420
529	NC_017278	CCA	2	6	18991	18996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438420
530	NC_017278	CGG	2	6	19024	19029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438420
531	NC_017278	TGA	2	6	19132	19137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438420
532	NC_017278	G	6	6	19245	19250	0 %	0 %	100 %	0 %	384438420
533	NC_017278	TCGGCC	2	12	19269	19280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438420
534	NC_017278	GCCCTT	2	12	19289	19300	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384438420
535	NC_017278	GCC	2	6	19452	19457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438420
536	NC_017278	CCA	2	6	19471	19476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438420
537	NC_017278	TGC	2	6	19500	19505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438420
538	NC_017278	TTG	2	6	19572	19577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384438420
539	NC_017278	TCGTTG	2	12	19608	19619	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384438420
540	NC_017278	TTG	2	6	19656	19661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384438420
541	NC_017278	GCC	2	6	19665	19670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438420
542	NC_017278	C	6	6	19679	19684	0 %	0 %	0 %	100 %	384438420
543	NC_017278	CCA	2	6	19711	19716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438420
544	NC_017278	GTG	2	6	19718	19723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438420
545	NC_017278	TCC	2	6	19725	19730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438420
546	NC_017278	C	6	6	19729	19734	0 %	0 %	0 %	100 %	384438420
547	NC_017278	GGGCCA	2	12	19744	19755	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438420
548	NC_017278	AGG	2	6	19774	19779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438420
549	NC_017278	CGT	2	6	19804	19809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438420
550	NC_017278	TCCC	2	8	19843	19850	0 %	25 %	0 %	75 %	384438420
551	NC_017278	TGG	2	6	19911	19916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438420
552	NC_017278	GCC	2	6	20009	20014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438420
553	NC_017278	GAT	2	6	20033	20038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438420
554	NC_017278	CTC	2	6	20072	20077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438420
555	NC_017278	GTTCC	2	10	20146	20155	0 %	40 %	20 %	40 %	384438421
556	NC_017278	G	6	6	20196	20201	0 %	0 %	100 %	0 %	384438421
557	NC_017278	CCTGGC	2	12	20223	20234	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438421
558	NC_017278	CGG	2	6	20277	20282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438421
559	NC_017278	CTC	2	6	20299	20304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438421
560	NC_017278	C	6	6	20353	20358	0 %	0 %	0 %	100 %	384438421
561	NC_017278	GAG	2	6	20365	20370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438421
562	NC_017278	GAG	2	6	20416	20421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438421
563	NC_017278	G	7	7	20428	20434	0 %	0 %	100 %	0 %	384438421
564	NC_017278	AGG	2	6	20441	20446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438421
565	NC_017278	ACC	2	6	20459	20464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438421
566	NC_017278	AGG	2	6	20489	20494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438421
567	NC_017278	GTA	2	6	20521	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438421
568	NC_017278	TCC	2	6	20534	20539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438421
569	NC_017278	C	6	6	20538	20543	0 %	0 %	0 %	100 %	384438421
570	NC_017278	CCG	2	6	20586	20591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438421
571	NC_017278	G	8	8	20614	20621	0 %	0 %	100 %	0 %	384438421
572	NC_017278	GTG	2	6	20666	20671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438421
573	NC_017278	CCT	2	6	20688	20693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438421
574	NC_017278	G	6	6	20730	20735	0 %	0 %	100 %	0 %	384438421
575	NC_017278	GGC	2	6	20740	20745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438421
576	NC_017278	TTC	2	6	20846	20851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438422
577	NC_017278	GGC	2	6	20854	20859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438422
578	NC_017278	CCT	2	6	20863	20868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438422
579	NC_017278	C	7	7	20872	20878	0 %	0 %	0 %	100 %	384438422
580	NC_017278	AAG	2	6	20921	20926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438422
581	NC_017278	GCC	2	6	20929	20934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438422
582	NC_017278	GAG	2	6	20987	20992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438422
583	NC_017278	CCT	2	6	21010	21015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438422
584	NC_017278	GCC	2	6	21051	21056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438422
585	NC_017278	CCA	2	6	21073	21078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438422
586	NC_017278	CCGGGC	2	12	21089	21100	0 %	0 %	50 %	50 %	384438422
587	NC_017278	CCAGG	2	10	21101	21110	20 %	0 %	40 %	40 %	384438422
588	NC_017278	AGG	2	6	21141	21146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438422
589	NC_017278	AGGGCC	2	12	21150	21161	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438422
590	NC_017278	AGG	2	6	21165	21170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438422
591	NC_017278	TCC	2	6	21235	21240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438423
592	NC_017278	CCT	2	6	21245	21250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438423
593	NC_017278	CGG	2	6	21254	21259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438423
594	NC_017278	GGC	2	6	21264	21269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438423
595	NC_017278	TCC	2	6	21322	21327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438423
596	NC_017278	CAGGG	2	10	21366	21375	20 %	0 %	60 %	20 %	384438423
597	NC_017278	CGG	2	6	21413	21418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438423
598	NC_017278	T	6	6	21429	21434	0 %	100 %	0 %	0 %	384438423
599	NC_017278	TCG	2	6	21469	21474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438423
600	NC_017278	AGG	2	6	21505	21510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438423
601	NC_017278	CGCT	2	8	21511	21518	0 %	25 %	25 %	50 %	384438423
602	NC_017278	GCT	2	6	21539	21544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438423
603	NC_017278	CCG	2	6	21579	21584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438423
604	NC_017278	CCT	2	6	21593	21598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438423
605	NC_017278	GCCC	2	8	21615	21622	0 %	0 %	25 %	75 %	384438423
606	NC_017278	TCC	2	6	21643	21648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438423
607	NC_017278	CCT	2	6	21659	21664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438423
608	NC_017278	GCC	2	6	21715	21720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438423
609	NC_017278	CCT	2	6	21734	21739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438423
610	NC_017278	CCT	2	6	21746	21751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438423
611	NC_017278	TCT	2	6	21779	21784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438423
612	NC_017278	AGG	2	6	21805	21810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438423
613	NC_017278	GCCG	2	8	21833	21840	0 %	0 %	50 %	50 %	384438423
614	NC_017278	GGC	2	6	21981	21986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438424
615	NC_017278	G	6	6	22016	22021	0 %	0 %	100 %	0 %	384438424
616	NC_017278	CCA	3	9	22022	22030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438424
617	NC_017278	AGG	2	6	22031	22036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438424
618	NC_017278	CGG	2	6	22042	22047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438424
619	NC_017278	CCG	2	6	22074	22079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438424
620	NC_017278	AGG	2	6	22091	22096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438424
621	NC_017278	CCG	2	6	22104	22109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438424
622	NC_017278	C	6	6	22128	22133	0 %	0 %	0 %	100 %	384438424
623	NC_017278	GGA	2	6	22173	22178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438424
624	NC_017278	AGG	2	6	22280	22285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438424
625	NC_017278	C	7	7	22290	22296	0 %	0 %	0 %	100 %	384438424
626	NC_017278	GCGG	2	8	22305	22312	0 %	0 %	75 %	25 %	384438424
627	NC_017278	GTG	2	6	22324	22329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438424
628	NC_017278	CTT	2	6	22332	22337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438424
629	NC_017278	CCA	2	6	22344	22349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438424
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734	NC_017278	CCTC	2	8	26471	26478	0 %	25 %	0 %	75 %	384438429
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739	NC_017278	AGG	2	6	26835	26840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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741	NC_017278	GGC	2	6	26950	26955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438430
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745	NC_017278	AGG	2	6	27062	27067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438430
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747	NC_017278	GCGG	2	8	27154	27161	0 %	0 %	75 %	25 %	384438430
748	NC_017278	C	6	6	27229	27234	0 %	0 %	0 %	100 %	384438430
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754	NC_017278	GGGC	2	8	27480	27487	0 %	0 %	75 %	25 %	384438430
755	NC_017278	GGC	2	6	27517	27522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438430
756	NC_017278	TGG	2	6	27555	27560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438430
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