MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_017278	GGT	2	6	291532	291537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438661
7003	NC_017278	GAA	2	6	291643	291648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438661
7004	NC_017278	CCGA	2	8	291667	291674	25 %	0 %	25 %	50 %	384438661
7005	NC_017278	AGG	2	6	291680	291685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438661
7006	NC_017278	CCA	2	6	291690	291695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438661
7007	NC_017278	GAG	2	6	291709	291714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438661
7008	NC_017278	GGCG	2	8	291744	291751	0 %	0 %	75 %	25 %	384438661
7009	NC_017278	CCT	3	9	291855	291863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438661
7010	NC_017278	GC	3	6	291883	291888	0 %	0 %	50 %	50 %	384438661
7011	NC_017278	CCA	2	6	291927	291932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438661
7012	NC_017278	GGA	2	6	291939	291944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438661
7013	NC_017278	CCT	2	6	291984	291989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438661
7014	NC_017278	GGCCCA	2	12	292036	292047	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384438661
7015	NC_017278	TCA	2	6	292056	292061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438661
7016	NC_017278	CCT	2	6	292127	292132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7102	NC_017278	GTGTA	2	10	295702	295711	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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7207	NC_017278	CGG	2	6	299469	299474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438668
7208	NC_017278	TCC	2	6	299573	299578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438668
7209	NC_017278	ACC	2	6	299612	299617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438668
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7211	NC_017278	GCC	2	6	299651	299656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438668
7212	NC_017278	GCC	2	6	299662	299667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438668
7213	NC_017278	GGA	2	6	299673	299678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438668
7214	NC_017278	GTA	2	6	299724	299729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7215	NC_017278	GTG	2	6	299751	299756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438669
7216	NC_017278	GCCCTG	2	12	299772	299783	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438669
7217	NC_017278	GGTG	2	8	299794	299801	0 %	25 %	75 %	0 %	384438669
7218	NC_017278	G	6	6	299863	299868	0 %	0 %	100 %	0 %	384438669
7219	NC_017278	AGG	2	6	299917	299922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438669
7220	NC_017278	GAG	2	6	299979	299984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438669
7221	NC_017278	CGC	2	6	300002	300007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438669
7222	NC_017278	GGC	2	6	300016	300021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438669
7223	NC_017278	GGA	2	6	300065	300070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438669
7224	NC_017278	GGT	2	6	300086	300091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438669
7225	NC_017278	TGG	2	6	300145	300150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438669
7226	NC_017278	GGC	2	6	300185	300190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438669
7227	NC_017278	ACG	2	6	300208	300213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438669
7228	NC_017278	GGC	3	9	300224	300232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438669
7229	NC_017278	GGA	2	6	300353	300358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438669
7230	NC_017278	CCA	3	9	300374	300382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438669
7231	NC_017278	CCT	2	6	300385	300390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438669
7232	NC_017278	GCGG	2	8	300401	300408	0 %	0 %	75 %	25 %	384438669
7233	NC_017278	CTC	2	6	300489	300494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438669
7234	NC_017278	CTC	2	6	300507	300512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438669
7235	NC_017278	CCGAGG	2	12	300562	300573	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438669
7236	NC_017278	G	7	7	300611	300617	0 %	0 %	100 %	0 %	384438669
7237	NC_017278	GGT	2	6	300719	300724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438670
7238	NC_017278	ACC	2	6	300739	300744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438670
7239	NC_017278	CGC	2	6	300749	300754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438670
7240	NC_017278	AGG	2	6	300766	300771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438670
7241	NC_017278	GGT	2	6	300779	300784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438670
7242	NC_017278	TGG	2	6	300829	300834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438670
7243	NC_017278	AGG	2	6	300835	300840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438670
7244	NC_017278	ACG	2	6	300883	300888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438670
7245	NC_017278	CCACCT	2	12	300902	300913	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384438670
7246	NC_017278	AGG	2	6	300982	300987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438670
7247	NC_017278	GGAGGT	2	12	301010	301021	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384438670
7248	NC_017278	GGC	2	6	301052	301057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438670
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7495	NC_017278	CTT	2	6	310114	310119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438679
7496	NC_017278	GCC	2	6	310142	310147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438679
7497	NC_017278	CAG	2	6	310172	310177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438679
7498	NC_017278	CCA	2	6	310247	310252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438680
7499	NC_017278	AGGGCC	2	12	310267	310278	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438680
7500	NC_017278	GGC	2	6	310298	310303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438680

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