MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017278	GCCC	2	8	269285	269292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6502	NC_017278	C	6	6	269290	269295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6503	NC_017278	C	6	6	269356	269361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6504	NC_017278	ACA	2	6	269565	269570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_017278	ATC	2	6	269580	269585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_017278	GAGG	2	8	269712	269719	25 %	0 %	75 %	0 %	384438645
6507	NC_017278	CCTA	2	8	269732	269739	25 %	25 %	0 %	50 %	384438645
6508	NC_017278	AGT	2	6	269798	269803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_017278	CCT	2	6	269814	269819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6510	NC_017278	TGGGG	2	10	269828	269837	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_017278	GA	3	6	269950	269955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_017278	AAAG	2	8	270031	270038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_017278	CGG	3	9	270122	270130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_017278	TGGAC	2	10	270161	270170	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6515	NC_017278	GAG	2	6	270196	270201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017278	G	6	6	270266	270271	0 %	0 %	100 %	0 %	384438646
6517	NC_017278	GAG	2	6	270285	270290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438646
6518	NC_017278	CTT	2	6	270393	270398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438646
6519	NC_017278	CTA	2	6	270426	270431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438646
6520	NC_017278	ACC	2	6	270448	270453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438646
6521	NC_017278	CCG	2	6	270528	270533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438646
6522	NC_017278	TGG	2	6	270536	270541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438646
6523	NC_017278	CGC	2	6	270570	270575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438646
6524	NC_017278	GTCA	2	8	270580	270587	25 %	25 %	25 %	25 %	384438646
6525	NC_017278	GGC	2	6	270594	270599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438646
6526	NC_017278	GACG	2	8	270657	270664	25 %	0 %	50 %	25 %	384438646
6527	NC_017278	GGC	2	6	270675	270680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438646
6528	NC_017278	GAG	2	6	270709	270714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438646
6529	NC_017278	TGGGA	2	10	270866	270875	20 %	20 %	60 %	0 %	384438646
6530	NC_017278	GCG	2	6	270909	270914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438646
6531	NC_017278	TCA	2	6	270926	270931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438646
6532	NC_017278	GTG	2	6	271000	271005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438646
6533	NC_017278	CTG	2	6	271054	271059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438646
6534	NC_017278	GGA	2	6	271062	271067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438646
6535	NC_017278	GAA	2	6	271099	271104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438646
6536	NC_017278	GGA	2	6	271119	271124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438646
6537	NC_017278	GCC	2	6	271132	271137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438646
6538	NC_017278	GTG	2	6	271159	271164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438646
6539	NC_017278	GCG	2	6	271275	271280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438646
6540	NC_017278	CTT	2	6	271333	271338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438646
6541	NC_017278	AGG	2	6	271406	271411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438646
6542	NC_017278	C	6	6	271442	271447	0 %	0 %	0 %	100 %	384438646
6543	NC_017278	CGC	2	6	271486	271491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6544	NC_017278	ACG	2	6	271497	271502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_017278	ACC	2	6	271651	271656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_017278	AGG	2	6	271701	271706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_017278	TCA	2	6	271734	271739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438647
6548	NC_017278	GCC	2	6	271790	271795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438647
6549	NC_017278	CCGC	2	8	271815	271822	0 %	0 %	25 %	75 %	384438647
6550	NC_017278	AGCC	2	8	271864	271871	25 %	0 %	25 %	50 %	384438647
6551	NC_017278	TGGCC	2	10	271911	271920	0 %	20 %	40 %	40 %	384438647
6552	NC_017278	CTC	2	6	271961	271966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438647
6553	NC_017278	CTC	2	6	271979	271984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438647
6554	NC_017278	GGACC	2	10	271993	272002	20 %	0 %	40 %	40 %	384438647
6555	NC_017278	CCT	2	6	272032	272037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438647
6556	NC_017278	CTTC	2	8	272086	272093	0 %	50 %	0 %	50 %	384438647
6557	NC_017278	ACG	2	6	272097	272102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438647
6558	NC_017278	CTC	2	6	272107	272112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438647
6559	NC_017278	GGA	2	6	272239	272244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438647
6560	NC_017278	GA	3	6	272346	272351	50 %	0 %	50 %	0 %	384438647
6561	NC_017278	GGC	2	6	272364	272369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438647
6562	NC_017278	GCG	2	6	272386	272391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438647
6563	NC_017278	GTG	2	6	272399	272404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438647
6564	NC_017278	CACG	2	8	272545	272552	25 %	0 %	25 %	50 %	384438647
6565	NC_017278	G	6	6	272559	272564	0 %	0 %	100 %	0 %	384438647
6566	NC_017278	TGC	2	6	272631	272636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438647
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6569	NC_017278	GGA	2	6	272747	272752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438647
6570	NC_017278	GGA	2	6	272862	272867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_017278	CCG	2	6	272889	272894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_017278	GTT	2	6	272926	272931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_017278	GAGAG	2	10	272976	272985	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_017278	AT	3	6	273054	273059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_017278	AAG	2	6	273099	273104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_017278	TTG	2	6	273335	273340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384438648
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6579	NC_017278	AT	3	6	273598	273603	50 %	50 %	0 %	0 %	384438648
6580	NC_017278	AAG	2	6	273674	273679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438648
6581	NC_017278	CAG	2	6	273693	273698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438648
6582	NC_017278	ATA	2	6	273735	273740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384438648
6583	NC_017278	CGCT	2	8	273768	273775	0 %	25 %	25 %	50 %	384438648
6584	NC_017278	TAG	2	6	273791	273796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438648
6585	NC_017278	GCT	2	6	273858	273863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438648
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6587	NC_017278	CGAT	2	8	274049	274056	25 %	25 %	25 %	25 %	384438648
6588	NC_017278	CGTT	2	8	274095	274102	0 %	50 %	25 %	25 %	384438648
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6591	NC_017278	CCT	2	6	274188	274193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438648
6592	NC_017278	TTTC	2	8	274221	274228	0 %	75 %	0 %	25 %	384438648
6593	NC_017278	CTG	2	6	274245	274250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438648
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6596	NC_017278	CTC	2	6	274480	274485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438648
6597	NC_017278	TAA	2	6	274500	274505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384438648
6598	NC_017278	GGC	2	6	274516	274521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438648
6599	NC_017278	GGTT	2	8	274534	274541	0 %	50 %	50 %	0 %	384438648
6600	NC_017278	AACTCT	2	12	274550	274561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438648
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6603	NC_017278	ACC	2	6	274871	274876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438648
6604	NC_017278	CTTT	2	8	274950	274957	0 %	75 %	0 %	25 %	384438648
6605	NC_017278	G	6	6	275047	275052	0 %	0 %	100 %	0 %	384438648
6606	NC_017278	TCT	2	6	275071	275076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438649
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6608	NC_017278	AAG	2	6	275156	275161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438649
6609	NC_017278	CGC	2	6	275214	275219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438649
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6615	NC_017278	CAG	2	6	275435	275440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438649
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6619	NC_017278	TCCCA	2	10	275619	275628	20 %	20 %	0 %	60 %	384438649
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6622	NC_017278	GCC	2	6	275895	275900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438649
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6995	NC_017278	CCA	2	6	291249	291254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438661
6996	NC_017278	GCC	2	6	291269	291274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438661
6997	NC_017278	CCA	2	6	291297	291302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438661
6998	NC_017278	GGAAGC	2	12	291336	291347	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384438661
6999	NC_017278	GCC	2	6	291419	291424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438661
7000	NC_017278	ACC	2	6	291425	291430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438661

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