MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017278	GTG	2	6	224674	224679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438599
5502	NC_017278	TGG	2	6	224750	224755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438599
5503	NC_017278	GGA	2	6	224805	224810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438599
5504	NC_017278	GAG	2	6	224842	224847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438599
5505	NC_017278	AGG	2	6	224915	224920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438599
5506	NC_017278	TCT	2	6	224957	224962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438599
5507	NC_017278	GGA	2	6	225058	225063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438600
5508	NC_017278	CCTC	2	8	225198	225205	0 %	25 %	0 %	75 %	384438600
5509	NC_017278	CCG	2	6	225214	225219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438600
5510	NC_017278	AGGGG	2	10	225238	225247	20 %	0 %	80 %	0 %	384438600
5511	NC_017278	CTGG	2	8	225365	225372	0 %	25 %	50 %	25 %	384438600
5512	NC_017278	GGA	2	6	225412	225417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438600
5513	NC_017278	TCC	2	6	225438	225443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438600
5514	NC_017278	GTG	2	6	225470	225475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438600
5515	NC_017278	GTG	3	9	225542	225550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438600
5516	NC_017278	TGC	2	6	225576	225581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438600
5517	NC_017278	GGA	2	6	225586	225591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438600
5518	NC_017278	GCTTTT	2	12	225627	225638	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384438601
5519	NC_017278	GCCCAG	2	12	225652	225663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384438601
5520	NC_017278	CAC	2	6	225741	225746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438601
5521	NC_017278	GGT	2	6	225780	225785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438601
5522	NC_017278	GAT	2	6	225793	225798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438601
5523	NC_017278	CTA	2	6	225804	225809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438601
5524	NC_017278	GGT	2	6	225927	225932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438601
5525	NC_017278	G	6	6	225944	225949	0 %	0 %	100 %	0 %	384438601
5526	NC_017278	ACC	2	6	226165	226170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438601
5527	NC_017278	GGGGA	2	10	226180	226189	20 %	0 %	80 %	0 %	384438601
5528	NC_017278	GAT	2	6	226203	226208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438601
5529	NC_017278	GTG	2	6	226276	226281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438601
5530	NC_017278	TGG	2	6	226301	226306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438601
5531	NC_017278	GTGG	2	8	226330	226337	0 %	25 %	75 %	0 %	384438601
5532	NC_017278	GGT	2	6	226398	226403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438601
5533	NC_017278	GAC	2	6	226411	226416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438601
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5536	NC_017278	G	6	6	226608	226613	0 %	0 %	100 %	0 %	384438602
5537	NC_017278	AGG	2	6	226615	226620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438602
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5539	NC_017278	GGGC	2	8	226719	226726	0 %	0 %	75 %	25 %	384438603
5540	NC_017278	G	6	6	226776	226781	0 %	0 %	100 %	0 %	384438603
5541	NC_017278	GGC	2	6	226834	226839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438603
5542	NC_017278	TGG	2	6	226902	226907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438603
5543	NC_017278	TGG	2	6	227124	227129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438603
5544	NC_017278	G	6	6	227128	227133	0 %	0 %	100 %	0 %	384438603
5545	NC_017278	GCC	2	6	227237	227242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438603
5546	NC_017278	CCT	2	6	227269	227274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438603
5547	NC_017278	GCCCTG	2	12	227300	227311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438603
5548	NC_017278	TGGGGG	2	12	227385	227396	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384438603
5549	NC_017278	TGG	2	6	227436	227441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438603
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5551	NC_017278	GGACC	2	10	227468	227477	20 %	0 %	40 %	40 %	384438603
5552	NC_017278	CTG	2	6	227486	227491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438603
5553	NC_017278	GGC	2	6	227554	227559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438603
5554	NC_017278	G	6	6	227599	227604	0 %	0 %	100 %	0 %	384438603
5555	NC_017278	CTT	2	6	227608	227613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438603
5556	NC_017278	TGC	2	6	227625	227630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438603
5557	NC_017278	AGGA	2	8	227679	227686	50 %	0 %	50 %	0 %	384438604
5558	NC_017278	G	6	6	227704	227709	0 %	0 %	100 %	0 %	384438604
5559	NC_017278	ACC	2	6	227772	227777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438604
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5562	NC_017278	C	6	6	227857	227862	0 %	0 %	0 %	100 %	384438604
5563	NC_017278	GCC	2	6	227947	227952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438604
5564	NC_017278	TACCC	2	10	228048	228057	20 %	20 %	0 %	60 %	384438604
5565	NC_017278	G	7	7	228063	228069	0 %	0 %	100 %	0 %	384438604
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5567	NC_017278	ACCA	2	8	228138	228145	50 %	0 %	0 %	50 %	384438604
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5569	NC_017278	GAGGG	2	10	228201	228210	20 %	0 %	80 %	0 %	384438604
5570	NC_017278	G	6	6	228208	228213	0 %	0 %	100 %	0 %	384438604
5571	NC_017278	TCT	2	6	228263	228268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438604
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5573	NC_017278	GGA	2	6	228335	228340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438604
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5575	NC_017278	CCTG	2	8	228392	228399	0 %	25 %	25 %	50 %	384438604
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5579	NC_017278	AGG	2	6	228539	228544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438605
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5587	NC_017278	TGA	2	6	228727	228732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438605
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5596	NC_017278	CTT	2	6	229114	229119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438606
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5602	NC_017278	TCCCA	2	10	229344	229353	20 %	20 %	0 %	60 %	384438606
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5605	NC_017278	GCC	2	6	229620	229625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438606
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5619	NC_017278	CCTGA	2	10	230306	230315	20 %	20 %	20 %	40 %	384438607
5620	NC_017278	TGC	2	6	230413	230418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438607
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5631	NC_017278	TGG	2	6	231085	231090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438608
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5743	NC_017278	AGG	2	6	235292	235297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438612
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5745	NC_017278	G	6	6	235333	235338	0 %	0 %	100 %	0 %	384438612
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5852	NC_017278	TCT	2	6	239894	239899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5866	NC_017278	GGAA	2	8	240419	240426	50 %	0 %	50 %	0 %	384438617
5867	NC_017278	GAG	3	9	240433	240441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438617
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5995	NC_017278	G	6	6	245011	245016	0 %	0 %	100 %	0 %	384438622
5996	NC_017278	CTC	2	6	245106	245111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438622
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5998	NC_017278	G	7	7	245141	245147	0 %	0 %	100 %	0 %	384438622
5999	NC_017278	C	6	6	245164	245169	0 %	0 %	0 %	100 %	384438622
6000	NC_017278	GTG	2	6	245208	245213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438622

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