MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_017278	GCC	2	6	2218150	2218155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440620
58002	NC_017278	AGGTGG	2	12	2218235	2218246	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384440620
58003	NC_017278	G	6	6	2218276	2218281	0 %	0 %	100 %	0 %	384440620
58004	NC_017278	CTC	2	6	2218282	2218287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440620
58005	NC_017278	TCC	3	9	2218292	2218300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440620
58006	NC_017278	CTT	2	6	2218302	2218307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440620
58007	NC_017278	TGG	2	6	2218310	2218315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440620
58008	NC_017278	GGT	2	6	2218338	2218343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440620
58009	NC_017278	CCG	2	6	2218358	2218363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440620
58010	NC_017278	GAGAAG	2	12	2218366	2218377	50 %	0 %	50 %	0 %	384440620
58011	NC_017278	CTC	2	6	2218462	2218467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440620
58012	NC_017278	G	6	6	2218524	2218529	0 %	0 %	100 %	0 %	384440620
58013	NC_017278	CCT	3	9	2218533	2218541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440620
58014	NC_017278	GGGC	2	8	2218566	2218573	0 %	0 %	75 %	25 %	384440620
58015	NC_017278	GGT	2	6	2218575	2218580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440620
58016	NC_017278	CTG	2	6	2218624	2218629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440620
58017	NC_017278	AGG	2	6	2218685	2218690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440620
58018	NC_017278	C	6	6	2218706	2218711	0 %	0 %	0 %	100 %	384440620
58019	NC_017278	TCC	2	6	2218742	2218747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440620
58020	NC_017278	CTT	2	6	2218758	2218763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440620
58021	NC_017278	CAC	2	6	2218780	2218785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440620
58022	NC_017278	CTC	2	6	2218810	2218815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440620
58023	NC_017278	CTC	2	6	2218825	2218830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440620
58024	NC_017278	CTC	2	6	2218900	2218905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440620
58025	NC_017278	GGT	2	6	2218935	2218940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440620
58026	NC_017278	AGG	2	6	2218955	2218960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58027	NC_017278	GGCGT	2	10	2218988	2218997	0 %	20 %	60 %	20 %	384440621
58028	NC_017278	CTT	2	6	2219006	2219011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440621
58029	NC_017278	CTC	2	6	2219037	2219042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440621
58030	NC_017278	GGCTG	2	10	2219044	2219053	0 %	20 %	60 %	20 %	384440621
58031	NC_017278	GCTG	2	8	2219065	2219072	0 %	25 %	50 %	25 %	384440621
58032	NC_017278	CCT	2	6	2219102	2219107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440621
58033	NC_017278	GCC	2	6	2219109	2219114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440621
58034	NC_017278	GCG	2	6	2219136	2219141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440621
58035	NC_017278	ACG	2	6	2219305	2219310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440621
58036	NC_017278	GGT	2	6	2219339	2219344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440621
58037	NC_017278	GTG	2	6	2219355	2219360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440621
58038	NC_017278	GCC	2	6	2219424	2219429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440621
58039	NC_017278	CCG	2	6	2219470	2219475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440621
58040	NC_017278	GAG	2	6	2219514	2219519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440621
58041	NC_017278	CACC	2	8	2219582	2219589	25 %	0 %	0 %	75 %	384440621
58042	NC_017278	CCG	2	6	2219624	2219629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440621
58043	NC_017278	CAG	2	6	2219631	2219636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440621
58044	NC_017278	GGT	2	6	2219645	2219650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440621
58045	NC_017278	GGC	2	6	2219651	2219656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440621
58046	NC_017278	GGC	2	6	2219675	2219680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440621
58047	NC_017278	GAG	2	6	2219739	2219744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440621
58048	NC_017278	CGG	2	6	2219745	2219750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440621
58049	NC_017278	CAA	2	6	2219762	2219767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440621
58050	NC_017278	TGG	2	6	2219773	2219778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440621
58051	NC_017278	AGGCCC	2	12	2219791	2219802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384440621
58052	NC_017278	GGT	2	6	2219807	2219812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440621
58053	NC_017278	GGC	2	6	2219839	2219844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58054	NC_017278	GAA	2	6	2219856	2219861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440622
58055	NC_017278	CTG	2	6	2219869	2219874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440622
58056	NC_017278	AGG	2	6	2219963	2219968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440622
58057	NC_017278	GAG	2	6	2220010	2220015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440622
58058	NC_017278	G	6	6	2220073	2220078	0 %	0 %	100 %	0 %	384440623
58059	NC_017278	CTC	2	6	2220089	2220094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440623
58060	NC_017278	G	6	6	2220105	2220110	0 %	0 %	100 %	0 %	384440623
58061	NC_017278	CCT	2	6	2220115	2220120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440623
58062	NC_017278	CCT	3	9	2220133	2220141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440623
58063	NC_017278	CTT	2	6	2220149	2220154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440623
58064	NC_017278	TCC	2	6	2220156	2220161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440623
58065	NC_017278	GAG	2	6	2220194	2220199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440623
58066	NC_017278	AGG	2	6	2220270	2220275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440623
58067	NC_017278	TGG	2	6	2220276	2220281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440623
58068	NC_017278	G	6	6	2220324	2220329	0 %	0 %	100 %	0 %	384440623
58069	NC_017278	GGC	2	6	2220331	2220336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440623
58070	NC_017278	ACC	2	6	2220348	2220353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440623
58071	NC_017278	GCC	2	6	2220354	2220359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440623
58072	NC_017278	G	6	6	2220408	2220413	0 %	0 %	100 %	0 %	384440623
58073	NC_017278	AGG	2	6	2220435	2220440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440623
58074	NC_017278	CCTGG	2	10	2220481	2220490	0 %	20 %	40 %	40 %	384440623
58075	NC_017278	AGG	2	6	2220492	2220497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440623
58076	NC_017278	GGGA	2	8	2220589	2220596	25 %	0 %	75 %	0 %	384440624
58077	NC_017278	CCCCT	2	10	2220598	2220607	0 %	20 %	0 %	80 %	384440624
58078	NC_017278	CGCC	2	8	2220660	2220667	0 %	0 %	25 %	75 %	384440624
58079	NC_017278	CCTGG	2	10	2220717	2220726	0 %	20 %	40 %	40 %	384440624
58080	NC_017278	CTC	2	6	2220748	2220753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440624
58081	NC_017278	CCTT	2	8	2220848	2220855	0 %	50 %	0 %	50 %	384440624
58082	NC_017278	CCT	2	6	2220858	2220863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440624
58083	NC_017278	TGG	2	6	2220905	2220910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440624
58084	NC_017278	GGA	2	6	2220921	2220926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440624
58085	NC_017278	C	6	6	2221058	2221063	0 %	0 %	0 %	100 %	384440624
58086	NC_017278	ATG	2	6	2221078	2221083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440624
58087	NC_017278	CTC	3	9	2221096	2221104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440624
58088	NC_017278	CCT	2	6	2221113	2221118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440624
58089	NC_017278	GGC	3	9	2221149	2221157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440624
58090	NC_017278	CCT	2	6	2221158	2221163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440624
58091	NC_017278	G	7	7	2221185	2221191	0 %	0 %	100 %	0 %	384440624
58092	NC_017278	CTC	2	6	2221198	2221203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440624
58093	NC_017278	TGG	2	6	2221205	2221210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440624
58094	NC_017278	CCT	2	6	2221224	2221229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440624
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58096	NC_017278	TCC	2	6	2221259	2221264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440624
58097	NC_017278	ACC	2	6	2221354	2221359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440625
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58099	NC_017278	GTG	2	6	2221393	2221398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440625
58100	NC_017278	C	6	6	2221407	2221412	0 %	0 %	0 %	100 %	384440625
58101	NC_017278	GGAAG	2	10	2221443	2221452	40 %	0 %	60 %	0 %	384440625
58102	NC_017278	GTG	2	6	2221456	2221461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440625
58103	NC_017278	CGGG	2	8	2221462	2221469	0 %	0 %	75 %	25 %	384440625
58104	NC_017278	GGT	2	6	2221470	2221475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440625
58105	NC_017278	CTT	2	6	2221497	2221502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440625
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58107	NC_017278	GGT	3	9	2221539	2221547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440625
58108	NC_017278	GCCC	2	8	2221558	2221565	0 %	0 %	25 %	75 %	384440625
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58110	NC_017278	CGC	2	6	2221597	2221602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440625
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58112	NC_017278	GGA	2	6	2221644	2221649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440625
58113	NC_017278	CGGGCC	2	12	2221672	2221683	0 %	0 %	50 %	50 %	384440625
58114	NC_017278	GGA	2	6	2221752	2221757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440625
58115	NC_017278	TCC	2	6	2221769	2221774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440625
58116	NC_017278	CCT	2	6	2221776	2221781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440625
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58118	NC_017278	GAG	2	6	2221921	2221926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440625
58119	NC_017278	CTA	2	6	2221935	2221940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440625
58120	NC_017278	CCT	2	6	2221947	2221952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440625
58121	NC_017278	GGC	2	6	2221968	2221973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440625
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58123	NC_017278	CCGTGG	2	12	2222009	2222020	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384440625
58124	NC_017278	G	6	6	2222029	2222034	0 %	0 %	100 %	0 %	384440625
58125	NC_017278	CGTGGC	2	12	2222046	2222057	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384440625
58126	NC_017278	GGA	2	6	2222070	2222075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440625
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58131	NC_017278	CCT	2	6	2222200	2222205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440626
58132	NC_017278	GGCCTG	2	12	2222222	2222233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384440626
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58228	NC_017278	AGG	2	6	2225523	2225528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440630
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58230	NC_017278	CGGGGG	2	12	2225596	2225607	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	384440630
58231	NC_017278	CCTCCC	2	12	2225620	2225631	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384440630
58232	NC_017278	GCC	2	6	2225667	2225672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440630
58233	NC_017278	CTC	2	6	2225684	2225689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440630
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58473	NC_017278	CCG	2	6	2233915	2233920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440636
58474	NC_017278	GCCC	2	8	2233926	2233933	0 %	0 %	25 %	75 %	384440636
58475	NC_017278	CTC	2	6	2233934	2233939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440636
58476	NC_017278	GAG	2	6	2233967	2233972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440636
58477	NC_017278	C	7	7	2233980	2233986	0 %	0 %	0 %	100 %	384440636
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58479	NC_017278	CAC	2	6	2234102	2234107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440636
58480	NC_017278	GGC	2	6	2234117	2234122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440636
58481	NC_017278	CGC	3	9	2234140	2234148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440636
58482	NC_017278	TCC	3	9	2234174	2234182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440637
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58499	NC_017278	GGCCC	2	10	2234791	2234800	0 %	0 %	40 %	60 %	384440637
58500	NC_017278	GGA	2	6	2234850	2234855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440637

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