MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017278	GCG	2	6	205693	205698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438581
5003	NC_017278	CCG	2	6	205712	205717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438581
5004	NC_017278	GGC	2	6	205762	205767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438581
5005	NC_017278	CAC	2	6	205795	205800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438581
5006	NC_017278	G	6	6	205805	205810	0 %	0 %	100 %	0 %	384438581
5007	NC_017278	GCC	2	6	205826	205831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438581
5008	NC_017278	GCA	2	6	205842	205847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438581
5009	NC_017278	CCG	2	6	205900	205905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438581
5010	NC_017278	GGGC	2	8	205932	205939	0 %	0 %	75 %	25 %	384438581
5011	NC_017278	CGC	2	6	206008	206013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438581
5012	NC_017278	CAC	2	6	206014	206019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438581
5013	NC_017278	AAG	2	6	206026	206031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438581
5014	NC_017278	GGC	2	6	206104	206109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017278	CTGG	2	8	206127	206134	0 %	25 %	50 %	25 %	384438582
5016	NC_017278	CAGGC	2	10	206137	206146	20 %	0 %	40 %	40 %	384438582
5017	NC_017278	AAG	2	6	206166	206171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438582
5018	NC_017278	CAG	2	6	206212	206217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438582
5019	NC_017278	CGG	2	6	206219	206224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438582
5020	NC_017278	GGC	2	6	206226	206231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438582
5021	NC_017278	C	6	6	206320	206325	0 %	0 %	0 %	100 %	384438582
5022	NC_017278	TAC	2	6	206362	206367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438582
5023	NC_017278	ACCC	2	8	206370	206377	25 %	0 %	0 %	75 %	384438582
5024	NC_017278	CGC	2	6	206406	206411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438582
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5027	NC_017278	CTTCG	2	10	206467	206476	0 %	40 %	20 %	40 %	384438582
5028	NC_017278	GGA	2	6	206528	206533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438583
5029	NC_017278	CGG	2	6	206538	206543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438583
5030	NC_017278	GTG	2	6	206583	206588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438583
5031	NC_017278	G	6	6	206608	206613	0 %	0 %	100 %	0 %	384438583
5032	NC_017278	CCT	2	6	206639	206644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438583
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5035	NC_017278	G	6	6	206713	206718	0 %	0 %	100 %	0 %	384438583
5036	NC_017278	GGA	2	6	206741	206746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438583
5037	NC_017278	G	6	6	206764	206769	0 %	0 %	100 %	0 %	384438583
5038	NC_017278	AGG	2	6	206882	206887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438583
5039	NC_017278	CGGGC	2	10	206916	206925	0 %	0 %	60 %	40 %	384438584
5040	NC_017278	C	6	6	206946	206951	0 %	0 %	0 %	100 %	384438584
5041	NC_017278	C	6	6	206979	206984	0 %	0 %	0 %	100 %	384438584
5042	NC_017278	CCG	2	6	206992	206997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438584
5043	NC_017278	CCTCC	2	10	207018	207027	0 %	20 %	0 %	80 %	384438584
5044	NC_017278	AGG	2	6	207077	207082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438584
5045	NC_017278	GGCCC	2	10	207085	207094	0 %	0 %	40 %	60 %	384438584
5046	NC_017278	GCC	2	6	207107	207112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438584
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5048	NC_017278	GGA	2	6	207156	207161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438584
5049	NC_017278	CCTCC	2	10	207163	207172	0 %	20 %	0 %	80 %	384438584
5050	NC_017278	CCT	2	6	207207	207212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438584
5051	NC_017278	GAG	2	6	207256	207261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438584
5052	NC_017278	TCC	2	6	207284	207289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438584
5053	NC_017278	GCA	2	6	207291	207296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438584
5054	NC_017278	CAG	2	6	207325	207330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438584
5055	NC_017278	CGCTGC	2	12	207374	207385	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438584
5056	NC_017278	C	6	6	207385	207390	0 %	0 %	0 %	100 %	384438584
5057	NC_017278	AGG	2	6	207443	207448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438584
5058	NC_017278	AGG	3	9	207485	207493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438584
5059	NC_017278	GGTG	2	8	207570	207577	0 %	25 %	75 %	0 %	384438584
5060	NC_017278	CCT	2	6	207579	207584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438584
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5062	NC_017278	GAG	3	9	207616	207624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438584
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5074	NC_017278	CCCGC	2	10	208031	208040	0 %	0 %	20 %	80 %	384438585
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5095	NC_017278	G	7	7	208730	208736	0 %	0 %	100 %	0 %	384438585
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5101	NC_017278	CCAGG	2	10	208872	208881	20 %	0 %	40 %	40 %	384438585
5102	NC_017278	G	7	7	208956	208962	0 %	0 %	100 %	0 %	384438585
5103	NC_017278	AGG	3	9	208975	208983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438585
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5249	NC_017278	G	6	6	214838	214843	0 %	0 %	100 %	0 %	384438590
5250	NC_017278	G	6	6	214880	214885	0 %	0 %	100 %	0 %	384438590
5251	NC_017278	CTT	2	6	214896	214901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438590
5252	NC_017278	CTT	2	6	214917	214922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438590
5253	NC_017278	G	6	6	214937	214942	0 %	0 %	100 %	0 %	384438590
5254	NC_017278	CTA	2	6	214977	214982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438590
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5260	NC_017278	TGG	2	6	215429	215434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438590
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5277	NC_017278	G	7	7	215968	215974	0 %	0 %	100 %	0 %	384438590
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5301	NC_017278	GCTTC	2	10	216794	216803	0 %	40 %	20 %	40 %	384438590
5302	NC_017278	AGGGCC	2	12	216818	216829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438590
5303	NC_017278	ACA	2	6	216905	216910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438590
5304	NC_017278	AGCA	2	8	217080	217087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5305	NC_017278	CTG	2	6	217144	217149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438591
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5310	NC_017278	AGG	2	6	217343	217348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438591
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5323	NC_017278	GGA	2	6	217797	217802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438591
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5326	NC_017278	GGC	2	6	217951	217956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438592
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5330	NC_017278	G	6	6	218091	218096	0 %	0 %	100 %	0 %	384438592
5331	NC_017278	CCA	2	6	218142	218147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438592
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5335	NC_017278	CCG	2	6	218257	218262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438592
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5351	NC_017278	ACG	2	6	218888	218893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438593
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5353	NC_017278	ACG	2	6	218930	218935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438593
5354	NC_017278	CAG	2	6	219019	219024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438593
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5358	NC_017278	CTGG	2	8	219195	219202	0 %	25 %	50 %	25 %	384438593
5359	NC_017278	GGC	2	6	219291	219296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438593
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5362	NC_017278	GGGCG	2	10	219408	219417	0 %	0 %	80 %	20 %	384438593
5363	NC_017278	CCA	2	6	219518	219523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438593
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5365	NC_017278	GGGGT	2	10	219565	219574	0 %	20 %	80 %	0 %	384438593
5366	NC_017278	CGGAGG	2	12	219590	219601	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384438593
5367	NC_017278	C	7	7	219606	219612	0 %	0 %	0 %	100 %	384438593
5368	NC_017278	TGG	2	6	219626	219631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438593
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5370	NC_017278	GGT	2	6	219690	219695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438593
5371	NC_017278	CCT	2	6	219738	219743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438593
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5374	NC_017278	GGA	2	6	219854	219859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438593
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5480	NC_017278	AGG	2	6	223930	223935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438598
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5483	NC_017278	GCGG	2	8	224051	224058	0 %	0 %	75 %	25 %	384438598
5484	NC_017278	GGAC	2	8	224107	224114	25 %	0 %	50 %	25 %	384438598
5485	NC_017278	GGAGG	2	10	224162	224171	20 %	0 %	80 %	0 %	384438598
5486	NC_017278	CCG	2	6	224174	224179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438598
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5488	NC_017278	AGG	2	6	224278	224283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438598
5489	NC_017278	GAG	2	6	224298	224303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438598
5490	NC_017278	CTT	2	6	224312	224317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438598
5491	NC_017278	ACG	2	6	224437	224442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438598
5492	NC_017278	ACCTGC	2	12	224452	224463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384438598
5493	NC_017278	CGCCC	2	10	224464	224473	0 %	0 %	20 %	80 %	384438598
5494	NC_017278	TGG	2	6	224515	224520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438598
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5496	NC_017278	G	6	6	224533	224538	0 %	0 %	100 %	0 %	384438598
5497	NC_017278	TGG	2	6	224557	224562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438598
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5499	NC_017278	TCC	2	6	224627	224632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5500	NC_017278	C	7	7	224631	224637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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