MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 58781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_017278	CGG	2	6	1911310	1911315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440294
50003	NC_017278	CTC	2	6	1911319	1911324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440294
50004	NC_017278	CTC	2	6	1911328	1911333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440294
50005	NC_017278	CTT	2	6	1911346	1911351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440294
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50011	NC_017278	GTG	2	6	1911598	1911603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440294
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50013	NC_017278	C	7	7	1911678	1911684	0 %	0 %	0 %	100 %	384440294
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50017	NC_017278	AGG	4	12	1911830	1911841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440294
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50028	NC_017278	GGC	2	6	1912137	1912142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440295
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50032	NC_017278	GGC	2	6	1912266	1912271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440295
50033	NC_017278	CAGGGC	2	12	1912272	1912283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440295
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50035	NC_017278	GGA	2	6	1912304	1912309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440295
50036	NC_017278	G	7	7	1912345	1912351	0 %	0 %	100 %	0 %	384440295
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50043	NC_017278	CCACGG	2	12	1912511	1912522	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384440295
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50051	NC_017278	G	6	6	1912736	1912741	0 %	0 %	100 %	0 %	384440295
50052	NC_017278	AGG	2	6	1912840	1912845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440295
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50055	NC_017278	GCCC	2	8	1912958	1912965	0 %	0 %	25 %	75 %	384440295
50056	NC_017278	GCCCC	2	10	1913015	1913024	0 %	0 %	20 %	80 %	384440295
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50088	NC_017278	G	6	6	1914161	1914166	0 %	0 %	100 %	0 %	384440296
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50102	NC_017278	G	6	6	1914902	1914907	0 %	0 %	100 %	0 %	384440297
50103	NC_017278	CCAC	2	8	1914986	1914993	25 %	0 %	0 %	75 %	384440297
50104	NC_017278	G	6	6	1915013	1915018	0 %	0 %	100 %	0 %	384440297
50105	NC_017278	CGC	2	6	1915113	1915118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440297
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50110	NC_017278	CCA	2	6	1915214	1915219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440297
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50112	NC_017278	GGCCAG	2	12	1915272	1915283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440297
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50114	NC_017278	CTC	2	6	1915395	1915400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440297
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50116	NC_017278	GGGC	2	8	1915457	1915464	0 %	0 %	75 %	25 %	384440297
50117	NC_017278	GC	4	8	1915463	1915470	0 %	0 %	50 %	50 %	384440297
50118	NC_017278	TCC	2	6	1915483	1915488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440297
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50120	NC_017278	GGA	2	6	1915639	1915644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440298
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50148	NC_017278	G	6	6	1916403	1916408	0 %	0 %	100 %	0 %	384440300
50149	NC_017278	CCT	2	6	1916430	1916435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440300
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50155	NC_017278	GTGG	2	8	1916599	1916606	0 %	25 %	75 %	0 %	384440300
50156	NC_017278	GGC	2	6	1916620	1916625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440300
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50163	NC_017278	CAC	2	6	1917091	1917096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
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50187	NC_017278	TCT	2	6	1918155	1918160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440300
50188	NC_017278	GGA	2	6	1918173	1918178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440300
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50190	NC_017278	TCG	2	6	1918256	1918261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440300
50191	NC_017278	TCG	2	6	1918391	1918396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440300
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50211	NC_017278	CAC	2	6	1919035	1919040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
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50219	NC_017278	TGA	2	6	1919289	1919294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440300
50220	NC_017278	GGC	2	6	1919295	1919300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440300
50221	NC_017278	TGG	2	6	1919322	1919327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440300
50222	NC_017278	G	6	6	1919368	1919373	0 %	0 %	100 %	0 %	384440300
50223	NC_017278	GGACGG	2	12	1919376	1919387	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384440300
50224	NC_017278	ATC	2	6	1919396	1919401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440300
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50226	NC_017278	CCTTG	2	10	1919455	1919464	0 %	40 %	20 %	40 %	384440300
50227	NC_017278	CCG	2	6	1919467	1919472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440300
50228	NC_017278	TCC	2	6	1919495	1919500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440300
50229	NC_017278	GAG	2	6	1919539	1919544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440300
50230	NC_017278	CCA	2	6	1919592	1919597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
50231	NC_017278	CAC	2	6	1919602	1919607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
50232	NC_017278	TCCACC	2	12	1919621	1919632	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384440300
50233	NC_017278	GGT	2	6	1919701	1919706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440300
50234	NC_017278	CGT	2	6	1919715	1919720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440300
50235	NC_017278	TCA	2	6	1919745	1919750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440300
50236	NC_017278	ACC	2	6	1919780	1919785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
50237	NC_017278	CTCGGC	2	12	1919788	1919799	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384440300
50238	NC_017278	CCT	3	9	1919805	1919813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440300
50239	NC_017278	GGC	2	6	1919824	1919829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440300
50240	NC_017278	CAC	2	6	1919830	1919835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
50241	NC_017278	C	6	6	1919858	1919863	0 %	0 %	0 %	100 %	384440300
50242	NC_017278	CAC	3	9	1919869	1919877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
50243	NC_017278	G	6	6	1919886	1919891	0 %	0 %	100 %	0 %	384440300
50244	NC_017278	TCC	2	6	1919954	1919959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440300
50245	NC_017278	CCT	2	6	1919970	1919975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440300
50246	NC_017278	GGA	2	6	1920000	1920005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440300
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50248	NC_017278	G	6	6	1920063	1920068	0 %	0 %	100 %	0 %	384440300
50249	NC_017278	GGA	2	6	1920081	1920086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440300
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50253	NC_017278	CCA	2	6	1920156	1920161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
50254	NC_017278	CTC	3	9	1920166	1920174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440300
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50256	NC_017278	CCT	2	6	1920231	1920236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440300
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50259	NC_017278	CACCCG	2	12	1920295	1920306	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384440300
50260	NC_017278	CAC	2	6	1920346	1920351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
50261	NC_017278	CAC	2	6	1920376	1920381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440300
50262	NC_017278	CTC	2	6	1920382	1920387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440300
50263	NC_017278	CTC	2	6	1920463	1920468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440300
50264	NC_017278	GAG	2	6	1920475	1920480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440300
50265	NC_017278	GCG	2	6	1920673	1920678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440300
50266	NC_017278	TGG	2	6	1920774	1920779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440300
50267	NC_017278	CCCGT	2	10	1920805	1920814	0 %	20 %	20 %	60 %	384440300
50268	NC_017278	TCT	2	6	1920882	1920887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440300
50269	NC_017278	CTT	2	6	1920921	1920926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440300
50270	NC_017278	T	6	6	1920925	1920930	0 %	100 %	0 %	0 %	384440300
50271	NC_017278	TTC	2	6	1920933	1920938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440300
50272	NC_017278	TC	3	6	1920970	1920975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50273	NC_017278	AGCC	2	8	1921000	1921007	25 %	0 %	25 %	50 %	384440301
50274	NC_017278	CCAGGG	2	12	1921056	1921067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440301
50275	NC_017278	TCC	2	6	1921124	1921129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440301
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50279	NC_017278	GCC	2	6	1921211	1921216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440301
50280	NC_017278	C	6	6	1921280	1921285	0 %	0 %	0 %	100 %	384440301
50281	NC_017278	GCT	2	6	1921290	1921295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440301
50282	NC_017278	TGA	2	6	1921299	1921304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440301
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50294	NC_017278	CAC	2	6	1921945	1921950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440301
50295	NC_017278	GCC	2	6	1921954	1921959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440301
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50301	NC_017278	CAC	2	6	1922119	1922124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440301
50302	NC_017278	CTC	2	6	1922128	1922133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440301
50303	NC_017278	GGC	2	6	1922149	1922154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440301
50304	NC_017278	TGGA	2	8	1922237	1922244	25 %	25 %	50 %	0 %	384440301
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50314	NC_017278	GCC	2	6	1922520	1922525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440301
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50320	NC_017278	CGT	2	6	1922685	1922690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440301
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50322	NC_017278	CCA	2	6	1922805	1922810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440301
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50325	NC_017278	TCC	3	9	1922873	1922881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440301
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50330	NC_017278	CCCG	2	8	1923077	1923084	0 %	0 %	25 %	75 %	384440301
50331	NC_017278	GAG	2	6	1923140	1923145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440301
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50337	NC_017278	GTC	2	6	1923376	1923381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440301
50338	NC_017278	GGA	2	6	1923435	1923440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440301
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50340	NC_017278	TCC	2	6	1923512	1923517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440301
50341	NC_017278	CTT	2	6	1923598	1923603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440301
50342	NC_017278	GCA	2	6	1923621	1923626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440301
50343	NC_017278	CCT	2	6	1923648	1923653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440301
50344	NC_017278	C	7	7	1923688	1923694	0 %	0 %	0 %	100 %	384440301
50345	NC_017278	GGA	4	12	1923756	1923767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440301
50346	NC_017278	TTG	2	6	1923785	1923790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440301
50347	NC_017278	GAT	2	6	1923859	1923864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440301
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50349	NC_017278	TGA	3	9	1923960	1923968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440301
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50468	NC_017278	CTC	2	6	1928242	1928247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440305
50469	NC_017278	CGC	2	6	1928251	1928256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440305
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