MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 11058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017273	CCG	2	6	161925	161930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432284
4002	NC_017273	CAC	2	6	161952	161957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432284
4003	NC_017273	CAC	2	6	161973	161978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432284
4004	NC_017273	CAC	2	6	162063	162068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432284
4005	NC_017273	GCC	2	6	162098	162103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432284
4006	NC_017273	TCC	2	6	162106	162111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432284
4007	NC_017273	CAG	2	6	162141	162146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432284
4008	NC_017273	C	6	6	162182	162187	0 %	0 %	0 %	100 %	384432284
4009	NC_017273	CCA	2	6	162193	162198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432284
4010	NC_017273	CAC	2	6	162239	162244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432284
4011	NC_017273	TCC	2	6	162303	162308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432284
4012	NC_017273	GGT	2	6	162335	162340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432284
4013	NC_017273	CCA	3	9	162421	162429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432284
4014	NC_017273	CCT	2	6	162472	162477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432284
4015	NC_017273	CTT	2	6	162482	162487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432284
4016	NC_017273	AGG	3	9	162504	162512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432284
4017	NC_017273	G	6	6	162531	162536	0 %	0 %	100 %	0 %	384432284
4018	NC_017273	CGC	2	6	162592	162597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432284
4019	NC_017273	CCA	2	6	162625	162630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432284
4020	NC_017273	CAA	2	6	162641	162646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432284
4021	NC_017273	CCG	2	6	162662	162667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432284
4022	NC_017273	AGG	2	6	162817	162822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017273	CGC	2	6	162899	162904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432285
4024	NC_017273	GGC	2	6	162914	162919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432285
4025	NC_017273	GGCCCA	2	12	162923	162934	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384432285
4026	NC_017273	CG	3	6	162957	162962	0 %	0 %	50 %	50 %	384432285
4027	NC_017273	CAC	2	6	163028	163033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432285
4028	NC_017273	CTA	2	6	163058	163063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432285
4029	NC_017273	CGG	2	6	163141	163146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432285
4030	NC_017273	C	6	6	163174	163179	0 %	0 %	0 %	100 %	384432285
4031	NC_017273	ATCCAC	2	12	163188	163199	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384432285
4032	NC_017273	GGC	2	6	163205	163210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432285
4033	NC_017273	GAC	2	6	163239	163244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432285
4034	NC_017273	ACGG	2	8	163267	163274	25 %	0 %	50 %	25 %	384432285
4035	NC_017273	GGC	2	6	163394	163399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432285
4036	NC_017273	GCGGGA	2	12	163412	163423	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384432285
4037	NC_017273	CGGGG	2	10	163503	163512	0 %	0 %	80 %	20 %	384432285
4038	NC_017273	C	6	6	163552	163557	0 %	0 %	0 %	100 %	384432285
4039	NC_017273	GGGC	2	8	163578	163585	0 %	0 %	75 %	25 %	384432285
4040	NC_017273	CGG	2	6	163605	163610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432285
4041	NC_017273	GCGG	2	8	163617	163624	0 %	0 %	75 %	25 %	384432285
4042	NC_017273	GGA	2	6	163658	163663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432285
4043	NC_017273	CCG	2	6	163715	163720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432285
4044	NC_017273	TGG	2	6	163750	163755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432285
4045	NC_017273	CAC	2	6	163782	163787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432285
4046	NC_017273	GAG	2	6	163797	163802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432285
4047	NC_017273	CAT	2	6	163844	163849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432285
4048	NC_017273	GCC	2	6	163854	163859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432285
4049	NC_017273	CTC	2	6	163893	163898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432285
4050	NC_017273	TAC	2	6	163929	163934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432285
4051	NC_017273	TGG	2	6	164037	164042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432286
4052	NC_017273	CCT	2	6	164068	164073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432286
4053	NC_017273	CCT	2	6	164089	164094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432286
4054	NC_017273	CAG	2	6	164171	164176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432286
4055	NC_017273	TCC	2	6	164184	164189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432286
4056	NC_017273	GCCCT	2	10	164216	164225	0 %	20 %	20 %	60 %	384432286
4057	NC_017273	G	6	6	164247	164252	0 %	0 %	100 %	0 %	384432286
4058	NC_017273	CGGGCC	2	12	164264	164275	0 %	0 %	50 %	50 %	384432286
4059	NC_017273	CCA	2	6	164320	164325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432286
4060	NC_017273	G	6	6	164333	164338	0 %	0 %	100 %	0 %	384432286
4061	NC_017273	CTC	3	9	164387	164395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432286
4062	NC_017273	GAAC	2	8	164446	164453	50 %	0 %	25 %	25 %	384432286
4063	NC_017273	AGG	2	6	164469	164474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432286
4064	NC_017273	GGA	2	6	164509	164514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432286
4065	NC_017273	GTG	3	9	164537	164545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432286
4066	NC_017273	CTTCCT	2	12	164744	164755	0 %	50 %	0 %	50 %	384432287
4067	NC_017273	CTT	3	9	164792	164800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432287
4068	NC_017273	CTCC	2	8	164801	164808	0 %	25 %	0 %	75 %	384432287
4069	NC_017273	GA	3	6	164851	164856	50 %	0 %	50 %	0 %	384432287
4070	NC_017273	CAC	2	6	164876	164881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432287
4071	NC_017273	CTC	2	6	164916	164921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432287
4072	NC_017273	GGT	2	6	164924	164929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432287
4073	NC_017273	CTCGCC	2	12	164943	164954	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384432287
4074	NC_017273	GCC	2	6	164964	164969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432287
4075	NC_017273	GGT	2	6	165011	165016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432287
4076	NC_017273	TCT	2	6	165088	165093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432287
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4080	NC_017273	CGG	3	9	165208	165216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432287
4081	NC_017273	GGT	2	6	165272	165277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432287
4082	NC_017273	GCC	2	6	165297	165302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432287
4083	NC_017273	TGG	2	6	165367	165372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432287
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4085	NC_017273	TGG	2	6	165415	165420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432287
4086	NC_017273	GAG	2	6	165457	165462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432287
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4088	NC_017273	G	6	6	165547	165552	0 %	0 %	100 %	0 %	384432288
4089	NC_017273	GGT	2	6	165562	165567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432288
4090	NC_017273	GTG	2	6	165584	165589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432288
4091	NC_017273	GTG	2	6	165626	165631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432288
4092	NC_017273	G	6	6	165676	165681	0 %	0 %	100 %	0 %	384432288
4093	NC_017273	GGT	2	6	165691	165696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432288
4094	NC_017273	CTA	2	6	165703	165708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432288
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4097	NC_017273	CCT	2	6	165898	165903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432288
4098	NC_017273	GGC	2	6	165970	165975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432288
4099	NC_017273	AACA	2	8	165983	165990	75 %	0 %	0 %	25 %	384432288
4100	NC_017273	TCA	2	6	166047	166052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432288
4101	NC_017273	CAC	2	6	166072	166077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432288
4102	NC_017273	G	6	6	166099	166104	0 %	0 %	100 %	0 %	384432288
4103	NC_017273	GCC	2	6	166115	166120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432288
4104	NC_017273	CTGG	2	8	166141	166148	0 %	25 %	50 %	25 %	384432288
4105	NC_017273	GAG	2	6	166226	166231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432288
4106	NC_017273	TCC	2	6	166242	166247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432288
4107	NC_017273	GAG	2	6	166250	166255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432288
4108	NC_017273	AGG	2	6	166481	166486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017273	TGAA	2	8	166490	166497	50 %	25 %	25 %	0 %	384432289
4110	NC_017273	GGA	2	6	166621	166626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432289
4111	NC_017273	G	6	6	166633	166638	0 %	0 %	100 %	0 %	384432289
4112	NC_017273	CGG	2	6	166663	166668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432289
4113	NC_017273	CCCCCA	2	12	166678	166689	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	384432289
4114	NC_017273	TCC	2	6	166692	166697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432289
4115	NC_017273	CTC	2	6	166745	166750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432289
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4117	NC_017273	C	7	7	166901	166907	0 %	0 %	0 %	100 %	384432289
4118	NC_017273	AAG	2	6	166922	166927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432289
4119	NC_017273	CAC	2	6	167092	167097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432289
4120	NC_017273	ACG	2	6	167139	167144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432289
4121	NC_017273	TGG	2	6	167169	167174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432289
4122	NC_017273	C	6	6	167205	167210	0 %	0 %	0 %	100 %	384432289
4123	NC_017273	CTC	2	6	167225	167230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432289
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4238	NC_017273	CTC	3	9	171913	171921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432294
4239	NC_017273	G	7	7	171925	171931	0 %	0 %	100 %	0 %	384432294
4240	NC_017273	TGG	2	6	171947	171952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432294
4241	NC_017273	GTG	2	6	171958	171963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432294
4242	NC_017273	GCC	2	6	171964	171969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432294
4243	NC_017273	GTG	2	6	171972	171977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432294
4244	NC_017273	CGTG	2	8	172019	172026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4246	NC_017273	GCC	2	6	172096	172101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4493	NC_017273	C	7	7	183619	183625	0 %	0 %	0 %	100 %	384432304
4494	NC_017273	TGG	2	6	183682	183687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432304
4495	NC_017273	CTTCC	2	10	183717	183726	0 %	40 %	0 %	60 %	384432304
4496	NC_017273	TGG	2	6	183727	183732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432304
4497	NC_017273	CCTCG	2	10	183758	183767	0 %	20 %	20 %	60 %	384432304
4498	NC_017273	GGAGG	2	10	183791	183800	20 %	0 %	80 %	0 %	384432304
4499	NC_017273	GGC	2	6	183818	183823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432304
4500	NC_017273	CTC	2	6	183831	183836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432304

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