MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 11058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017273	CGG	2	6	39416	39421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432172
1002	NC_017273	CCA	2	6	39422	39427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432172
1003	NC_017273	C	6	6	39440	39445	0 %	0 %	0 %	100 %	384432172
1004	NC_017273	GCC	2	6	39508	39513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432172
1005	NC_017273	AGG	3	9	39517	39525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432172
1006	NC_017273	CCTC	2	8	39559	39566	0 %	25 %	0 %	75 %	384432173
1007	NC_017273	AGG	2	6	39570	39575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432173
1008	NC_017273	GAG	2	6	39611	39616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432173
1009	NC_017273	AGG	2	6	39636	39641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432173
1010	NC_017273	GCCCC	2	10	39649	39658	0 %	0 %	20 %	80 %	384432173
1011	NC_017273	GGA	2	6	39679	39684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432173
1012	NC_017273	GAG	2	6	39689	39694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432173
1013	NC_017273	CCT	2	6	39758	39763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432174
1014	NC_017273	TCC	2	6	39800	39805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432174
1015	NC_017273	C	6	6	39819	39824	0 %	0 %	0 %	100 %	384432174
1016	NC_017273	GGA	2	6	39825	39830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432174
1017	NC_017273	CCA	2	6	39849	39854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432174
1018	NC_017273	GGA	2	6	39900	39905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432174
1019	NC_017273	CCT	2	6	39915	39920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432174
1020	NC_017273	CCA	3	9	39927	39935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432174
1021	NC_017273	G	6	6	39954	39959	0 %	0 %	100 %	0 %	384432174
1022	NC_017273	CAC	2	6	39967	39972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432174
1023	NC_017273	GCCAGG	2	12	39980	39991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384432174
1024	NC_017273	GGGT	2	8	40010	40017	0 %	25 %	75 %	0 %	384432174
1025	NC_017273	GTG	2	6	40031	40036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432174
1026	NC_017273	CCCT	2	8	40054	40061	0 %	25 %	0 %	75 %	384432174
1027	NC_017273	CCTC	2	8	40071	40078	0 %	25 %	0 %	75 %	384432175
1028	NC_017273	CGC	2	6	40111	40116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432175
1029	NC_017273	CCG	2	6	40155	40160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432175
1030	NC_017273	GCC	2	6	40199	40204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432175
1031	NC_017273	TCT	2	6	40236	40241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432175
1032	NC_017273	CGC	2	6	40258	40263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432175
1033	NC_017273	TCC	2	6	40293	40298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432175
1034	NC_017273	CTT	2	6	40343	40348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432175
1035	NC_017273	CCA	2	6	40357	40362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432175
1036	NC_017273	CAC	2	6	40368	40373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432175
1037	NC_017273	C	6	6	40405	40410	0 %	0 %	0 %	100 %	384432175
1038	NC_017273	GTA	2	6	40556	40561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432175
1039	NC_017273	CCG	2	6	40580	40585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432175
1040	NC_017273	AGG	3	9	40605	40613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432175
1041	NC_017273	GGGC	2	8	40645	40652	0 %	0 %	75 %	25 %	384432175
1042	NC_017273	GAGGCG	2	12	40665	40676	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384432175
1043	NC_017273	GGGGAA	2	12	40702	40713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432175
1044	NC_017273	CCT	2	6	40720	40725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432175
1045	NC_017273	CTT	2	6	40745	40750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432175
1046	NC_017273	GGA	2	6	40762	40767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432175
1047	NC_017273	CAG	2	6	40823	40828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432175
1048	NC_017273	ACC	2	6	40830	40835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432175
1049	NC_017273	TCC	2	6	40863	40868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432175
1050	NC_017273	GAG	2	6	40874	40879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432175
1051	NC_017273	TGGGGA	2	12	40918	40929	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384432175
1052	NC_017273	C	6	6	40948	40953	0 %	0 %	0 %	100 %	384432175
1053	NC_017273	CCT	2	6	40957	40962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432175
1054	NC_017273	GGCG	2	8	40996	41003	0 %	0 %	75 %	25 %	384432175
1055	NC_017273	CGT	2	6	41005	41010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432175
1056	NC_017273	CTC	2	6	41072	41077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432175
1057	NC_017273	GCCC	2	8	41091	41098	0 %	0 %	25 %	75 %	384432175
1058	NC_017273	GGA	2	6	41176	41181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432175
1059	NC_017273	GAG	2	6	41294	41299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432175
1060	NC_017273	GGC	3	9	41411	41419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432175
1061	NC_017273	CCAG	2	8	41431	41438	25 %	0 %	25 %	50 %	384432175
1062	NC_017273	C	6	6	41779	41784	0 %	0 %	0 %	100 %	384432175
1063	NC_017273	GCCC	2	8	41805	41812	0 %	0 %	25 %	75 %	384432175
1064	NC_017273	GTG	2	6	41813	41818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432175
1065	NC_017273	GTA	2	6	41822	41827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432175
1066	NC_017273	AGG	3	9	41907	41915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432175
1067	NC_017273	GTA	2	6	41924	41929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432175
1068	NC_017273	CAC	2	6	41960	41965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432175
1069	NC_017273	C	6	6	42141	42146	0 %	0 %	0 %	100 %	384432175
1070	NC_017273	GGA	2	6	42172	42177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432175
1071	NC_017273	GTC	2	6	42195	42200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432175
1072	NC_017273	CGC	2	6	42326	42331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432175
1073	NC_017273	C	6	6	42340	42345	0 %	0 %	0 %	100 %	384432175
1074	NC_017273	AGA	2	6	42358	42363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432175
1075	NC_017273	AGG	2	6	42387	42392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432175
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1081	NC_017273	GTG	2	6	42689	42694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432177
1082	NC_017273	CGGT	2	8	42731	42738	0 %	25 %	50 %	25 %	384432177
1083	NC_017273	CAC	2	6	42832	42837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
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1085	NC_017273	GGGC	2	8	42955	42962	0 %	0 %	75 %	25 %	384432177
1086	NC_017273	CCA	2	6	42964	42969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
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1088	NC_017273	GCC	2	6	43003	43008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432177
1089	NC_017273	CCG	2	6	43023	43028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432177
1090	NC_017273	AGGCC	2	10	43050	43059	20 %	0 %	40 %	40 %	384432177
1091	NC_017273	CGC	2	6	43063	43068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432177
1092	NC_017273	TGG	2	6	43116	43121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432177
1093	NC_017273	CCG	4	12	43131	43142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432177
1094	NC_017273	GAA	2	6	43165	43170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432177
1095	NC_017273	CCA	2	6	43176	43181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
1096	NC_017273	GA	3	6	43187	43192	50 %	0 %	50 %	0 %	384432177
1097	NC_017273	GAG	2	6	43204	43209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432177
1098	NC_017273	GCC	3	9	43211	43219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432177
1099	NC_017273	TCA	2	6	43233	43238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432177
1100	NC_017273	CCT	2	6	43332	43337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432177
1101	NC_017273	CCGT	2	8	43412	43419	0 %	25 %	25 %	50 %	384432177
1102	NC_017273	GCG	2	6	43501	43506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432177
1103	NC_017273	CCA	2	6	43524	43529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
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1105	NC_017273	C	7	7	43610	43616	0 %	0 %	0 %	100 %	384432177
1106	NC_017273	CAC	2	6	43618	43623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
1107	NC_017273	CAC	3	9	43657	43665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
1108	NC_017273	TGA	2	6	43767	43772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432177
1109	NC_017273	CAC	2	6	43795	43800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
1110	NC_017273	GAG	3	9	43810	43818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432177
1111	NC_017273	GCC	3	9	43841	43849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432177
1112	NC_017273	CGCC	2	8	43854	43861	0 %	0 %	25 %	75 %	384432177
1113	NC_017273	CTG	2	6	43867	43872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432177
1114	NC_017273	TGA	2	6	43965	43970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432177
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1116	NC_017273	GTA	2	6	44050	44055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432177
1117	NC_017273	CCG	2	6	44069	44074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432177
1118	NC_017273	C	7	7	44110	44116	0 %	0 %	0 %	100 %	384432177
1119	NC_017273	ACC	2	6	44123	44128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
1120	NC_017273	GTA	2	6	44164	44169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432177
1121	NC_017273	CAC	2	6	44200	44205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
1122	NC_017273	GTTGAG	2	12	44281	44292	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384432177
1123	NC_017273	GCG	2	6	44352	44357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432177
1124	NC_017273	CCA	2	6	44376	44381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432177
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1255	NC_017273	AAG	2	6	49253	49258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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