MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 11058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017273	CTC	3	9	437909	437917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432548
11002	NC_017273	TCT	2	6	437991	437996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432548
11003	NC_017273	CCCT	2	8	438012	438019	0 %	25 %	0 %	75 %	384432548
11004	NC_017273	CTC	2	6	438038	438043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432548
11005	NC_017273	TGG	2	6	438075	438080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432548
11006	NC_017273	ACC	2	6	438111	438116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432548
11007	NC_017273	GGA	2	6	438200	438205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432548
11008	NC_017273	CTC	2	6	438229	438234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432548
11009	NC_017273	CTT	2	6	438289	438294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432548
11010	NC_017273	CCCTT	2	10	438318	438327	0 %	40 %	0 %	60 %	384432548
11011	NC_017273	C	6	6	438354	438359	0 %	0 %	0 %	100 %	384432548
11012	NC_017273	C	6	6	438369	438374	0 %	0 %	0 %	100 %	384432548
11013	NC_017273	GGCG	2	8	438376	438383	0 %	0 %	75 %	25 %	384432548
11014	NC_017273	CGC	2	6	438415	438420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432548
11015	NC_017273	TCG	2	6	438435	438440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432548
11016	NC_017273	TCC	2	6	438441	438446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432548
11017	NC_017273	CGCC	2	8	438472	438479	0 %	0 %	25 %	75 %	384432548
11018	NC_017273	TCC	2	6	438507	438512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432548
11019	NC_017273	TCCC	2	8	438515	438522	0 %	25 %	0 %	75 %	384432548
11020	NC_017273	GA	3	6	438562	438567	50 %	0 %	50 %	0 %	384432548
11021	NC_017273	CTC	2	6	438641	438646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432548
11022	NC_017273	AAG	2	6	438660	438665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432548
11023	NC_017273	TGG	2	6	438669	438674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432548
11024	NC_017273	CG	3	6	438822	438827	0 %	0 %	50 %	50 %	384432548
11025	NC_017273	AGG	2	6	438834	438839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432548
11026	NC_017273	TCA	2	6	438872	438877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432548
11027	NC_017273	G	6	6	438915	438920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_017273	CCA	2	6	438951	438956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_017273	CCA	2	6	438975	438980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11030	NC_017273	CTC	2	6	439039	439044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11031	NC_017273	C	6	6	439088	439093	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11032	NC_017273	GCC	2	6	439112	439117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_017273	TCC	2	6	439136	439141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11034	NC_017273	CCT	2	6	439182	439187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11035	NC_017273	CTC	2	6	439192	439197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_017273	C	6	6	439199	439204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11037	NC_017273	CCT	2	6	439221	439226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11038	NC_017273	TGG	2	6	439235	439240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_017273	AC	3	6	439246	439251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11040	NC_017273	GGA	2	6	439254	439259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_017273	TGG	2	6	439277	439282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_017273	TGG	2	6	439348	439353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_017273	AGGG	2	8	439361	439368	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_017273	G	6	6	439366	439371	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_017273	GCTTT	2	10	439382	439391	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11046	NC_017273	GAG	2	6	439484	439489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_017273	TGGCTT	2	12	439565	439576	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11048	NC_017273	TGG	2	6	439590	439595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_017273	GTG	2	6	439633	439638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_017273	GGT	2	6	439645	439650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_017273	GGT	2	6	439726	439731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_017273	CTT	2	6	439751	439756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_017273	AGG	2	6	439772	439777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_017273	TGA	2	6	439784	439789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_017273	AGG	2	6	439854	439859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_017273	TAG	2	6	439894	439899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_017273	ACA	2	6	439900	439905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_017273	GCG	2	6	440005	440010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.