MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 11058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_017273	AGGCC	2	10	378031	378040	20 %	0 %	40 %	40 %	384432485
9502	NC_017273	TGA	2	6	378042	378047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432485
9503	NC_017273	CTT	2	6	378113	378118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432485
9504	NC_017273	GCC	2	6	378251	378256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432485
9505	NC_017273	GAG	2	6	378281	378286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432485
9506	NC_017273	GTG	2	6	378290	378295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432485
9507	NC_017273	TTC	2	6	378353	378358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432485
9508	NC_017273	CG	3	6	378384	378389	0 %	0 %	50 %	50 %	384432485
9509	NC_017273	GCT	2	6	378431	378436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432485
9510	NC_017273	CCT	2	6	378503	378508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432485
9511	NC_017273	TCGC	2	8	378798	378805	0 %	25 %	25 %	50 %	384432485
9512	NC_017273	CT	3	6	378887	378892	0 %	50 %	0 %	50 %	384432485
9513	NC_017273	ATG	2	6	378987	378992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432485
9514	NC_017273	CTC	3	9	379108	379116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432486
9515	NC_017273	CTGGCC	2	12	379126	379137	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384432486
9516	NC_017273	GCC	2	6	379212	379217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432486
9517	NC_017273	CCT	2	6	379236	379241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432486
9518	NC_017273	C	6	6	379250	379255	0 %	0 %	0 %	100 %	384432486
9519	NC_017273	CGA	3	9	379260	379268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432486
9520	NC_017273	TGC	2	6	379276	379281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432486
9521	NC_017273	G	6	6	379282	379287	0 %	0 %	100 %	0 %	384432486
9522	NC_017273	GGCCCT	2	12	379413	379424	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384432486
9523	NC_017273	GCC	2	6	379450	379455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432486
9524	NC_017273	ACC	2	6	379478	379483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432486
9525	NC_017273	TCT	2	6	379484	379489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432486
9526	NC_017273	GCT	2	6	379589	379594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432486
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9528	NC_017273	ACC	2	6	379709	379714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432486
9529	NC_017273	G	6	6	379783	379788	0 %	0 %	100 %	0 %	384432486
9530	NC_017273	ACC	2	6	379814	379819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432486
9531	NC_017273	GGC	3	9	379865	379873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432486
9532	NC_017273	GCC	2	6	379881	379886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432486
9533	NC_017273	CCG	2	6	379889	379894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432486
9534	NC_017273	AGG	2	6	379895	379900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432486
9535	NC_017273	CCT	2	6	379914	379919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432486
9536	NC_017273	CCA	2	6	379923	379928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432486
9537	NC_017273	CAG	2	6	379933	379938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432486
9538	NC_017273	CCT	2	6	379941	379946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432486
9539	NC_017273	CGC	2	6	379972	379977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432486
9540	NC_017273	GGA	2	6	380095	380100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432487
9541	NC_017273	CTG	2	6	380108	380113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432487
9542	NC_017273	GAG	2	6	380135	380140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432487
9543	NC_017273	CCT	2	6	380143	380148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432487
9544	NC_017273	CCG	2	6	380158	380163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432487
9545	NC_017273	TCC	2	6	380199	380204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432487
9546	NC_017273	GTG	2	6	380228	380233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432487
9547	NC_017273	CTT	2	6	380242	380247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432487
9548	NC_017273	GGCC	2	8	380288	380295	0 %	0 %	50 %	50 %	384432487
9549	NC_017273	CTT	2	6	380362	380367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432487
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9551	NC_017273	GGA	2	6	380383	380388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432487
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9553	NC_017273	AGGAA	2	10	380457	380466	60 %	0 %	40 %	0 %	384432487
9554	NC_017273	CCG	2	6	380557	380562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432487
9555	NC_017273	ACCC	2	8	380596	380603	25 %	0 %	0 %	75 %	384432487
9556	NC_017273	CGA	2	6	380610	380615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432488
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9558	NC_017273	CCT	2	6	380637	380642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432488
9559	NC_017273	GGGC	2	8	380657	380664	0 %	0 %	75 %	25 %	384432488
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9572	NC_017273	CCGGG	2	10	381043	381052	0 %	0 %	60 %	40 %	384432488
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9578	NC_017273	GCCCC	2	10	381182	381191	0 %	0 %	20 %	80 %	384432488
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9582	NC_017273	ACC	2	6	381540	381545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9583	NC_017273	C	6	6	381644	381649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9584	NC_017273	CGG	2	6	381917	381922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9585	NC_017273	CTT	2	6	381954	381959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9586	NC_017273	ACGT	2	8	382013	382020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9587	NC_017273	GCG	2	6	382023	382028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9588	NC_017273	GCC	2	6	382181	382186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9589	NC_017273	ACA	2	6	382292	382297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9590	NC_017273	CGG	2	6	382325	382330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9591	NC_017273	CCA	2	6	382332	382337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9592	NC_017273	ACC	2	6	382388	382393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9593	NC_017273	CCA	2	6	382403	382408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9594	NC_017273	GAT	2	6	382492	382497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_017273	CA	3	6	382502	382507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9596	NC_017273	CAG	2	6	382619	382624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9597	NC_017273	GGC	2	6	382715	382720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9598	NC_017273	TCA	3	9	382799	382807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9599	NC_017273	GCC	2	6	382809	382814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9600	NC_017273	CTCCA	2	10	382856	382865	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9601	NC_017273	GCT	2	6	382881	382886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432489
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9603	NC_017273	GCCC	2	8	382976	382983	0 %	0 %	25 %	75 %	384432489
9604	NC_017273	CCAA	2	8	382997	383004	50 %	0 %	0 %	50 %	384432489
9605	NC_017273	CCA	2	6	383081	383086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432489
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9607	NC_017273	CGC	2	6	383202	383207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432489
9608	NC_017273	CAG	2	6	383211	383216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432489
9609	NC_017273	GCG	2	6	383260	383265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432489
9610	NC_017273	CAG	2	6	383274	383279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432489
9611	NC_017273	AG	3	6	383363	383368	50 %	0 %	50 %	0 %	384432489
9612	NC_017273	CCA	2	6	383384	383389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432489
9613	NC_017273	TCA	2	6	383399	383404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432489
9614	NC_017273	CCGG	2	8	383423	383430	0 %	0 %	50 %	50 %	384432489
9615	NC_017273	GCC	2	6	383459	383464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432489
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