MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 11058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017273	CTTCGC	2	12	183845	183856	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384432304
4502	NC_017273	GGA	2	6	183860	183865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432304
4503	NC_017273	G	6	6	183869	183874	0 %	0 %	100 %	0 %	384432304
4504	NC_017273	CGG	2	6	183892	183897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432304
4505	NC_017273	AGG	2	6	183898	183903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432304
4506	NC_017273	C	6	6	183917	183922	0 %	0 %	0 %	100 %	384432304
4507	NC_017273	GCCC	2	8	183955	183962	0 %	0 %	25 %	75 %	384432304
4508	NC_017273	GAG	2	6	183978	183983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432304
4509	NC_017273	ACG	2	6	184006	184011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432304
4510	NC_017273	CTC	2	6	184014	184019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432304
4511	NC_017273	G	6	6	184026	184031	0 %	0 %	100 %	0 %	384432304
4512	NC_017273	CCT	2	6	184052	184057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432304
4513	NC_017273	ACT	2	6	184069	184074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432304
4514	NC_017273	GCG	2	6	184090	184095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432304
4515	NC_017273	AGG	2	6	184142	184147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432304
4516	NC_017273	AGC	2	6	184175	184180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_017273	GTG	2	6	184213	184218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_017273	G	7	7	184218	184224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017273	CCT	2	6	184230	184235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_017273	GGCG	2	8	184314	184321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_017273	AGG	2	6	184331	184336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017273	GCC	3	9	184342	184350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_017273	GGT	2	6	184392	184397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017273	GAGGTG	2	12	184411	184422	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017273	G	6	6	184422	184427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017273	GGC	2	6	184440	184445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_017273	GGC	2	6	184502	184507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_017273	CCA	2	6	184554	184559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_017273	GA	3	6	184624	184629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017273	GAG	2	6	184652	184657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017273	GAAG	2	8	184660	184667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017273	TTCC	2	8	184710	184717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_017273	GCG	2	6	184980	184985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_017273	TGG	2	6	185035	185040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017273	TTC	2	6	185079	185084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_017273	GGA	2	6	185107	185112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_017273	TCC	2	6	185140	185145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_017273	CTC	2	6	185172	185177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_017273	CCAGAG	2	12	185227	185238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4541	NC_017273	CCT	2	6	185305	185310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_017273	GGT	2	6	185371	185376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017273	TCC	2	6	185445	185450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_017273	GAGG	2	8	185507	185514	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017273	CCA	2	6	185527	185532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_017273	GGGCGT	2	12	185566	185577	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4547	NC_017273	TAGGT	2	10	185591	185600	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017273	TCCT	2	8	185620	185627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_017273	AGGTTG	2	12	185642	185653	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017273	C	6	6	185654	185659	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4551	NC_017273	AGG	2	6	185684	185689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017273	GCT	2	6	185760	185765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_017273	ACC	2	6	185789	185794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_017273	AGG	2	6	185831	185836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017273	TCA	2	6	185847	185852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_017273	CAAG	2	8	185940	185947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_017273	GCC	2	6	185969	185974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_017273	GCG	2	6	185980	185985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_017273	TCT	2	6	186011	186016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_017273	AGG	2	6	186032	186037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017273	GC	3	6	186085	186090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_017273	CCT	2	6	186118	186123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_017273	GGA	2	6	186126	186131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017273	GTG	2	6	186219	186224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017273	CCT	3	9	186249	186257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_017273	CTTCCT	2	12	186279	186290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4567	NC_017273	GGC	2	6	186357	186362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_017273	CGGG	2	8	186364	186371	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_017273	G	6	6	186441	186446	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_017273	GGA	2	6	186495	186500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017273	GGGCG	2	10	186549	186558	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4572	NC_017273	TCC	4	12	186599	186610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_017273	TGGAGG	2	12	186632	186643	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017273	TCCCC	2	10	186678	186687	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4575	NC_017273	GCCC	2	8	186690	186697	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4576	NC_017273	G	7	7	186750	186756	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_017273	CTT	2	6	186760	186765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_017273	GCC	2	6	186775	186780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_017273	CCG	3	9	186782	186790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_017273	AGGCCC	2	12	186791	186802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_017273	GGCCCT	2	12	186867	186878	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4582	NC_017273	GCC	2	6	186922	186927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4583	NC_017273	CGC	2	6	186978	186983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_017273	CGGG	2	8	187052	187059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4585	NC_017273	GTAAAC	3	18	187096	187113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4587	NC_017273	CCTGGC	2	12	187243	187254	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384432305
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4596	NC_017273	GGGGA	2	10	187553	187562	20 %	0 %	80 %	0 %	384432305
4597	NC_017273	C	6	6	187575	187580	0 %	0 %	0 %	100 %	384432305
4598	NC_017273	GGAG	2	8	187588	187595	25 %	0 %	75 %	0 %	384432305
4599	NC_017273	TGG	2	6	187617	187622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432305
4600	NC_017273	CTC	2	6	187688	187693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432305
4601	NC_017273	CGC	2	6	187831	187836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432305
4602	NC_017273	GCG	2	6	187865	187870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432305
4603	NC_017273	GGA	2	6	187873	187878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432305
4604	NC_017273	GAG	2	6	187898	187903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432305
4605	NC_017273	TGG	2	6	187911	187916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432305
4606	NC_017273	ACG	2	6	187920	187925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432305
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4609	NC_017273	CGGGA	2	10	188015	188024	20 %	0 %	60 %	20 %	384432305
4610	NC_017273	C	7	7	188027	188033	0 %	0 %	0 %	100 %	384432305
4611	NC_017273	TGG	2	6	188058	188063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432305
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4615	NC_017273	GAAA	2	8	188151	188158	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017273	A	6	6	188172	188177	100 %	0 %	0 %	0 %	384432306
4617	NC_017273	GGC	2	6	188247	188252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432306
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4621	NC_017273	GTC	2	6	188325	188330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432306
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4623	NC_017273	ACGGG	2	10	188442	188451	20 %	0 %	60 %	20 %	384432306
4624	NC_017273	ACA	2	6	188581	188586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432306
4625	NC_017273	CAG	2	6	188625	188630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432306
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4627	NC_017273	GCCTTC	2	12	188730	188741	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384432306
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4629	NC_017273	GC	3	6	188801	188806	0 %	0 %	50 %	50 %	384432306
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4995	NC_017273	CGC	2	6	201521	201526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432316
4996	NC_017273	CG	3	6	201626	201631	0 %	0 %	50 %	50 %	384432316
4997	NC_017273	CCTC	2	8	201640	201647	0 %	25 %	0 %	75 %	384432316
4998	NC_017273	TCC	2	6	201682	201687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432316
4999	NC_017273	G	7	7	201696	201702	0 %	0 %	100 %	0 %	384432316
5000	NC_017273	CCT	2	6	201782	201787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432316

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