MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_017272	TCC	3	9	1842583	1842591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432108
49003	NC_017272	GCCC	2	8	1842613	1842620	0 %	0 %	25 %	75 %	384432108
49004	NC_017272	GGA	2	6	1842638	1842643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432108
49005	NC_017272	CCT	2	6	1842656	1842661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432108
49006	NC_017272	TCC	2	6	1842664	1842669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432108
49007	NC_017272	G	6	6	1842706	1842711	0 %	0 %	100 %	0 %	384432108
49008	NC_017272	TCCC	2	8	1842734	1842741	0 %	25 %	0 %	75 %	384432108
49009	NC_017272	GCC	2	6	1842760	1842765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432108
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49039	NC_017272	CGG	2	6	1843599	1843604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432109
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49050	NC_017272	GAG	2	6	1843946	1843951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432109
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49052	NC_017272	CTC	2	6	1844120	1844125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432109
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49055	NC_017272	GTC	2	6	1844159	1844164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432109
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49101	NC_017272	CAC	2	6	1845120	1845125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432111
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49104	NC_017272	GGGTA	2	10	1845203	1845212	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49105	NC_017272	G	6	6	1845221	1845226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49106	NC_017272	GGA	2	6	1845232	1845237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432112
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49109	NC_017272	G	7	7	1845316	1845322	0 %	0 %	100 %	0 %	384432112
49110	NC_017272	TGG	2	6	1845323	1845328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432112
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49114	NC_017272	CG	3	6	1845394	1845399	0 %	0 %	50 %	50 %	384432112
49115	NC_017272	TGG	2	6	1845438	1845443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432112
49116	NC_017272	G	7	7	1845491	1845497	0 %	0 %	100 %	0 %	384432112
49117	NC_017272	ACC	2	6	1845555	1845560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432112
49118	NC_017272	GGA	2	6	1845568	1845573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432112
49119	NC_017272	GGC	2	6	1845748	1845753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432112
49120	NC_017272	CTC	2	6	1845788	1845793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432112
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49125	NC_017272	GCC	3	9	1845944	1845952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432112
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49134	NC_017272	GCGGG	2	10	1846234	1846243	0 %	0 %	80 %	20 %	384432112
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49142	NC_017272	AGGC	2	8	1846512	1846519	25 %	0 %	50 %	25 %	384432112
49143	NC_017272	GCCC	2	8	1846522	1846529	0 %	0 %	25 %	75 %	384432112
49144	NC_017272	C	6	6	1846575	1846580	0 %	0 %	0 %	100 %	384432112
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49147	NC_017272	GAG	2	6	1846709	1846714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432112
49148	NC_017272	AGG	2	6	1846722	1846727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432112
49149	NC_017272	GGTCCT	2	12	1846756	1846767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432112
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49153	NC_017272	CTC	2	6	1846844	1846849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432112
49154	NC_017272	CACC	2	8	1846867	1846874	25 %	0 %	0 %	75 %	384432112
49155	NC_017272	ACT	2	6	1846911	1846916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432112
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49160	NC_017272	AGGCC	2	10	1847041	1847050	20 %	0 %	40 %	40 %	384432112
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49165	NC_017272	GTG	2	6	1847346	1847351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432113
49166	NC_017272	CGGGGA	2	12	1847360	1847371	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384432113
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49174	NC_017272	TCC	2	6	1847674	1847679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432113
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49177	NC_017272	G	6	6	1847839	1847844	0 %	0 %	100 %	0 %	384432113
49178	NC_017272	TCT	2	6	1847863	1847868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432113
49179	NC_017272	CCT	2	6	1847975	1847980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432113
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49181	NC_017272	CCTT	2	8	1848018	1848025	0 %	50 %	0 %	50 %	384432114
49182	NC_017272	CCT	2	6	1848085	1848090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432114
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49188	NC_017272	C	6	6	1848230	1848235	0 %	0 %	0 %	100 %	384432114
49189	NC_017272	AGG	2	6	1848279	1848284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432114
49190	NC_017272	G	6	6	1848320	1848325	0 %	0 %	100 %	0 %	384432114
49191	NC_017272	GGGGA	2	10	1848327	1848336	20 %	0 %	80 %	0 %	384432114
49192	NC_017272	CCT	2	6	1848355	1848360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432114
49193	NC_017272	GCCG	2	8	1848406	1848413	0 %	0 %	50 %	50 %	384432114
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49200	NC_017272	CCT	2	6	1848673	1848678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432114
49201	NC_017272	CGC	2	6	1848690	1848695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432114
49202	NC_017272	GCCC	2	8	1848711	1848718	0 %	0 %	25 %	75 %	384432114
49203	NC_017272	C	6	6	1848716	1848721	0 %	0 %	0 %	100 %	384432114
49204	NC_017272	C	6	6	1848761	1848766	0 %	0 %	0 %	100 %	384432114
49205	NC_017272	GCC	2	6	1848842	1848847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432114
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49210	NC_017272	GGC	2	6	1849012	1849017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432114
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49212	NC_017272	GGGC	2	8	1849044	1849051	0 %	0 %	75 %	25 %	384432114
49213	NC_017272	AGG	2	6	1849071	1849076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432114
49214	NC_017272	GGC	2	6	1849097	1849102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432114
49215	NC_017272	AGA	2	6	1849123	1849128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432114
49216	NC_017272	G	6	6	1849168	1849173	0 %	0 %	100 %	0 %	384432114
49217	NC_017272	CAC	2	6	1849253	1849258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432114
49218	NC_017272	CGC	2	6	1849272	1849277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432114
49219	NC_017272	CCT	2	6	1849291	1849296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49220	NC_017272	GAA	2	6	1849359	1849364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432115
49221	NC_017272	GCC	2	6	1849371	1849376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432115
49222	NC_017272	GGA	2	6	1849397	1849402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432115
49223	NC_017272	GAA	2	6	1849433	1849438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432115
49224	NC_017272	GGA	2	6	1849484	1849489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432115
49225	NC_017272	GCC	2	6	1849527	1849532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432115
49226	NC_017272	GGC	2	6	1849538	1849543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432115
49227	NC_017272	GGA	2	6	1849568	1849573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432115
49228	NC_017272	AGG	2	6	1849585	1849590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432115
49229	NC_017272	GGAGCG	2	12	1849595	1849606	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384432115
49230	NC_017272	GC	3	6	1849629	1849634	0 %	0 %	50 %	50 %	384432115
49231	NC_017272	TTC	2	6	1849743	1849748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432115
49232	NC_017272	CAC	2	6	1849776	1849781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432115
49233	NC_017272	GAG	2	6	1849851	1849856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432115
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49235	NC_017272	TGG	2	6	1849912	1849917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432115
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49354	NC_017272	CAC	2	6	1855077	1855082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432119
49355	NC_017272	GAA	2	6	1855088	1855093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432119
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49357	NC_017272	CTC	2	6	1855290	1855295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432120
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49362	NC_017272	CCCCGT	2	12	1855385	1855396	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384432120
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49369	NC_017272	CCCGG	2	10	1855602	1855611	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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49402	NC_017272	CGCCCC	2	12	1856850	1856861	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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49467	NC_017272	CTC	2	6	1858824	1858829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432124
49468	NC_017272	CTC	3	9	1858854	1858862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432124
49469	NC_017272	CCA	2	6	1858928	1858933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432124
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