MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48502	NC_017272	GAG	2	6	1824229	1824234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432084
48503	NC_017272	CAC	2	6	1824307	1824312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432084
48504	NC_017272	TCCTG	2	10	1824349	1824358	0 %	40 %	20 %	40 %	384432084
48505	NC_017272	GGA	2	6	1824443	1824448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48506	NC_017272	CTG	2	6	1824463	1824468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48507	NC_017272	AAT	2	6	1824548	1824553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432085
48508	NC_017272	CTC	3	9	1824585	1824593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432085
48509	NC_017272	GGA	2	6	1824620	1824625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432085
48510	NC_017272	CGC	2	6	1824632	1824637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432085
48511	NC_017272	CCT	2	6	1824683	1824688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432085
48512	NC_017272	GTG	2	6	1824891	1824896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48513	NC_017272	TGG	2	6	1824949	1824954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432086
48514	NC_017272	CGCC	2	8	1825019	1825026	0 %	0 %	25 %	75 %	384432086
48515	NC_017272	GCC	2	6	1825032	1825037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432086
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48517	NC_017272	GGC	2	6	1825085	1825090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432086
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48520	NC_017272	CTC	2	6	1825170	1825175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432086
48521	NC_017272	AAG	2	6	1825189	1825194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432086
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48538	NC_017272	CG	3	6	1825688	1825693	0 %	0 %	50 %	50 %	384432086
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48543	NC_017272	GC	3	6	1825775	1825780	0 %	0 %	50 %	50 %	384432086
48544	NC_017272	G	6	6	1825792	1825797	0 %	0 %	100 %	0 %	384432086
48545	NC_017272	CCT	2	6	1825802	1825807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432086
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48615	NC_017272	CGG	2	6	1828159	1828164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48616	NC_017272	TCC	3	9	1828227	1828235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432089
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48618	NC_017272	GAG	2	6	1828286	1828291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432089
48619	NC_017272	GCCC	2	8	1828294	1828301	0 %	0 %	25 %	75 %	384432089
48620	NC_017272	CTG	3	9	1828346	1828354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432089
48621	NC_017272	GAA	2	6	1828391	1828396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432089
48622	NC_017272	GAG	2	6	1828400	1828405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432089
48623	NC_017272	GAC	2	6	1828412	1828417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432089
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48630	NC_017272	GGGC	2	8	1828661	1828668	0 %	0 %	75 %	25 %	384432089
48631	NC_017272	GAT	2	6	1828706	1828711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432089
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48652	NC_017272	GGTG	2	8	1829719	1829726	0 %	25 %	75 %	0 %	384432090
48653	NC_017272	CGG	2	6	1829731	1829736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432090
48654	NC_017272	CCA	2	6	1829743	1829748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432090
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48659	NC_017272	C	6	6	1829931	1829936	0 %	0 %	0 %	100 %	384432090
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48681	NC_017272	TGG	2	6	1830821	1830826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432092
48682	NC_017272	GCG	2	6	1830830	1830835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432092
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48686	NC_017272	GGGC	2	8	1830936	1830943	0 %	0 %	75 %	25 %	384432092
48687	NC_017272	CCT	2	6	1830951	1830956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432092
48688	NC_017272	GA	3	6	1830978	1830983	50 %	0 %	50 %	0 %	384432092
48689	NC_017272	ACC	2	6	1831013	1831018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432092
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48691	NC_017272	G	6	6	1831053	1831058	0 %	0 %	100 %	0 %	384432092
48692	NC_017272	GTT	2	6	1831159	1831164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432092
48693	NC_017272	CCG	2	6	1831199	1831204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432092
48694	NC_017272	CAC	2	6	1831216	1831221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432092
48695	NC_017272	G	6	6	1831276	1831281	0 %	0 %	100 %	0 %	384432092
48696	NC_017272	ATC	2	6	1831343	1831348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432092
48697	NC_017272	CCTC	2	8	1831352	1831359	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
48698	NC_017272	CAC	2	6	1831388	1831393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48702	NC_017272	GCC	2	6	1831481	1831486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432093
48703	NC_017272	CAC	2	6	1831487	1831492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432093
48704	NC_017272	GGC	2	6	1831499	1831504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432093
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48717	NC_017272	CTG	2	6	1832247	1832252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432094
48718	NC_017272	G	7	7	1832252	1832258	0 %	0 %	100 %	0 %	384432094
48719	NC_017272	AGG	2	6	1832296	1832301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432094
48720	NC_017272	AGG	2	6	1832404	1832409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432094
48721	NC_017272	GTA	2	6	1832436	1832441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432094
48722	NC_017272	C	6	6	1832504	1832509	0 %	0 %	0 %	100 %	384432094
48723	NC_017272	ACC	2	6	1832539	1832544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432094
48724	NC_017272	CGG	3	9	1832624	1832632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432094
48725	NC_017272	CAT	2	6	1832658	1832663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432094
48726	NC_017272	TGC	2	6	1832711	1832716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432094
48727	NC_017272	CCT	2	6	1832735	1832740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432094
48728	NC_017272	GGC	2	6	1832763	1832768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432094
48729	NC_017272	GTC	2	6	1832799	1832804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432094
48730	NC_017272	C	7	7	1832818	1832824	0 %	0 %	0 %	100 %	384432094
48731	NC_017272	GGT	2	6	1832895	1832900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432094
48732	NC_017272	CCT	2	6	1832915	1832920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432094
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48848	NC_017272	TCT	2	6	1837476	1837481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432099
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