MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48003	NC_017272	C	6	6	1806631	1806636	0 %	0 %	0 %	100 %	384432063
48004	NC_017272	G	6	6	1806718	1806723	0 %	0 %	100 %	0 %	384432063
48005	NC_017272	G	6	6	1806732	1806737	0 %	0 %	100 %	0 %	384432063
48006	NC_017272	GGC	2	6	1806806	1806811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432063
48007	NC_017272	TCG	2	6	1806853	1806858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432063
48008	NC_017272	GAG	2	6	1806864	1806869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432063
48009	NC_017272	GTGG	2	8	1806882	1806889	0 %	25 %	75 %	0 %	384432063
48010	NC_017272	TGA	2	6	1806899	1806904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432063
48011	NC_017272	C	7	7	1806915	1806921	0 %	0 %	0 %	100 %	384432063
48012	NC_017272	GGAGA	2	10	1806942	1806951	40 %	0 %	60 %	0 %	384432063
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48017	NC_017272	TCC	2	6	1807243	1807248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432063
48018	NC_017272	GGA	2	6	1807295	1807300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432063
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48039	NC_017272	GCGGG	2	10	1807975	1807984	0 %	0 %	80 %	20 %	384432064
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48114	NC_017272	TCG	2	6	1810800	1810805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432069
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48117	NC_017272	GAA	2	6	1810874	1810879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432069
48118	NC_017272	GAT	2	6	1810901	1810906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432069
48119	NC_017272	CCT	2	6	1811005	1811010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432069
48120	NC_017272	TCC	2	6	1811058	1811063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432069
48121	NC_017272	CCA	2	6	1811065	1811070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432069
48122	NC_017272	GTC	2	6	1811099	1811104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432069
48123	NC_017272	CCT	3	9	1811147	1811155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
48124	NC_017272	CTC	2	6	1811163	1811168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
48125	NC_017272	GTG	2	6	1811173	1811178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432070
48126	NC_017272	CGC	2	6	1811199	1811204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
48127	NC_017272	GCC	2	6	1811318	1811323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
48128	NC_017272	TGG	2	6	1811354	1811359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432070
48129	NC_017272	GAG	2	6	1811370	1811375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432070
48130	NC_017272	GAG	2	6	1811379	1811384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432070
48131	NC_017272	CCT	2	6	1811402	1811407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
48132	NC_017272	ACC	2	6	1811431	1811436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
48133	NC_017272	TCC	2	6	1811462	1811467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
48134	NC_017272	CCG	3	9	1811480	1811488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
48135	NC_017272	CCT	2	6	1811636	1811641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
48136	NC_017272	GTCGGG	2	12	1811655	1811666	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384432070
48137	NC_017272	CAC	2	6	1811715	1811720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
48138	NC_017272	AGG	2	6	1811803	1811808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432070
48139	NC_017272	CGG	2	6	1811840	1811845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432070
48140	NC_017272	GAG	2	6	1811847	1811852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432070
48141	NC_017272	GCG	2	6	1811869	1811874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432070
48142	NC_017272	ACC	2	6	1811914	1811919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
48143	NC_017272	CGC	3	9	1811958	1811966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
48144	NC_017272	GGT	2	6	1812021	1812026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432070
48145	NC_017272	CAC	2	6	1812045	1812050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
48146	NC_017272	CTC	2	6	1812075	1812080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
48147	NC_017272	TGG	2	6	1812091	1812096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432070
48148	NC_017272	C	6	6	1812101	1812106	0 %	0 %	0 %	100 %	384432070
48149	NC_017272	CGC	2	6	1812186	1812191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
48150	NC_017272	G	6	6	1812236	1812241	0 %	0 %	100 %	0 %	384432070
48151	NC_017272	GAA	2	6	1812267	1812272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432070
48152	NC_017272	CCA	3	9	1812290	1812298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
48153	NC_017272	TCCACC	2	12	1812307	1812318	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384432070
48154	NC_017272	CCCG	2	8	1812331	1812338	0 %	0 %	25 %	75 %	384432070
48155	NC_017272	CCT	2	6	1812398	1812403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48156	NC_017272	CTC	2	6	1812433	1812438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432071
48157	NC_017272	ACCCGG	2	12	1812440	1812451	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384432071
48158	NC_017272	AAG	2	6	1812542	1812547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432071
48159	NC_017272	AGGT	2	8	1812617	1812624	25 %	25 %	50 %	0 %	384432071
48160	NC_017272	GCC	2	6	1812631	1812636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432071
48161	NC_017272	GGA	2	6	1812643	1812648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432072
48162	NC_017272	CCG	2	6	1812664	1812669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432072
48163	NC_017272	GTG	3	9	1812737	1812745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432072
48164	NC_017272	GAG	3	9	1812812	1812820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432072
48165	NC_017272	GGA	2	6	1812858	1812863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432073
48166	NC_017272	CTC	2	6	1812874	1812879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
48167	NC_017272	CTC	3	9	1812937	1812945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
48168	NC_017272	CTC	2	6	1812964	1812969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
48169	NC_017272	GCC	2	6	1812990	1812995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432073
48170	NC_017272	GAT	2	6	1813012	1813017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432073
48171	NC_017272	G	6	6	1813046	1813051	0 %	0 %	100 %	0 %	384432073
48172	NC_017272	GTT	2	6	1813138	1813143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432073
48173	NC_017272	CCA	2	6	1813161	1813166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432073
48174	NC_017272	CCA	2	6	1813173	1813178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432073
48175	NC_017272	C	6	6	1813261	1813266	0 %	0 %	0 %	100 %	384432073
48176	NC_017272	TGG	2	6	1813305	1813310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432073
48177	NC_017272	GTGG	2	8	1813318	1813325	0 %	25 %	75 %	0 %	384432073
48178	NC_017272	CAC	2	6	1813411	1813416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432073
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48181	NC_017272	CTC	2	6	1813537	1813542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
48182	NC_017272	CGG	2	6	1813560	1813565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432073
48183	NC_017272	G	6	6	1813584	1813589	0 %	0 %	100 %	0 %	384432073
48184	NC_017272	CCT	2	6	1813614	1813619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
48185	NC_017272	CCT	2	6	1813623	1813628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
48186	NC_017272	GGC	2	6	1813657	1813662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432073
48187	NC_017272	AGG	2	6	1813688	1813693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432073
48188	NC_017272	GGC	2	6	1813740	1813745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432073
48189	NC_017272	CAC	2	6	1813759	1813764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432073
48190	NC_017272	AGG	2	6	1813782	1813787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432073
48191	NC_017272	G	6	6	1813815	1813820	0 %	0 %	100 %	0 %	384432073
48192	NC_017272	GTG	2	6	1813832	1813837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432073
48193	NC_017272	AAT	2	6	1813948	1813953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432073
48194	NC_017272	AAG	2	6	1814015	1814020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48195	NC_017272	C	6	6	1814040	1814045	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48196	NC_017272	GGC	2	6	1814046	1814051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48197	NC_017272	T	6	6	1814056	1814061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48198	NC_017272	CG	3	6	1814062	1814067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48199	NC_017272	CGC	2	6	1814100	1814105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48200	NC_017272	CTC	2	6	1814146	1814151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
48201	NC_017272	GC	3	6	1814155	1814160	0 %	0 %	50 %	50 %	384432074
48202	NC_017272	AGG	2	6	1814233	1814238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432074
48203	NC_017272	TC	3	6	1814255	1814260	0 %	50 %	0 %	50 %	384432074
48204	NC_017272	GAT	2	6	1814271	1814276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432074
48205	NC_017272	GTCGGG	2	12	1814280	1814291	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384432074
48206	NC_017272	CGG	2	6	1814297	1814302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432074
48207	NC_017272	GGCG	2	8	1814312	1814319	0 %	0 %	75 %	25 %	384432074
48208	NC_017272	TCC	2	6	1814323	1814328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
48209	NC_017272	CCT	2	6	1814348	1814353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
48210	NC_017272	GCCTCC	2	12	1814371	1814382	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384432074
48211	NC_017272	AGA	2	6	1814383	1814388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432074
48212	NC_017272	TCC	2	6	1814413	1814418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
48213	NC_017272	C	6	6	1814421	1814426	0 %	0 %	0 %	100 %	384432074
48214	NC_017272	TCC	2	6	1814471	1814476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
48215	NC_017272	ACC	2	6	1814500	1814505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432074
48216	NC_017272	GGT	2	6	1814567	1814572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432074
48217	NC_017272	CCT	2	6	1814624	1814629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
48218	NC_017272	G	6	6	1814632	1814637	0 %	0 %	100 %	0 %	384432074
48219	NC_017272	ACGGTC	2	12	1814668	1814679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384432074
48220	NC_017272	CAC	2	6	1814698	1814703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432074
48221	NC_017272	TGG	2	6	1814747	1814752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432074
48222	NC_017272	GCG	2	6	1814778	1814783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432074
48223	NC_017272	CCTC	2	8	1814834	1814841	0 %	25 %	0 %	75 %	384432074
48224	NC_017272	AGG	2	6	1814842	1814847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432074
48225	NC_017272	GAG	2	6	1814886	1814891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432074
48226	NC_017272	GCG	2	6	1814892	1814897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432074
48227	NC_017272	GGGCG	2	10	1814927	1814936	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48228	NC_017272	GTA	2	6	1815020	1815025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432075
48229	NC_017272	GGT	2	6	1815046	1815051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432075
48230	NC_017272	C	7	7	1815059	1815065	0 %	0 %	0 %	100 %	384432075
48231	NC_017272	CGG	3	9	1815097	1815105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432075
48232	NC_017272	GGC	2	6	1815122	1815127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432075
48233	NC_017272	C	6	6	1815151	1815156	0 %	0 %	0 %	100 %	384432075
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48235	NC_017272	GCGG	2	8	1815191	1815198	0 %	0 %	75 %	25 %	384432075
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48355	NC_017272	CCT	2	6	1819393	1819398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432079
48356	NC_017272	ACC	2	6	1819427	1819432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432079
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48358	NC_017272	GAG	2	6	1819472	1819477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432079
48359	NC_017272	TCC	2	6	1819488	1819493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432079
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48431	NC_017272	GAG	2	6	1821922	1821927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432081
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48463	NC_017272	TCA	2	6	1822924	1822929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432082
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48468	NC_017272	GGA	2	6	1823056	1823061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432082
48469	NC_017272	TCT	2	6	1823080	1823085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432082
48470	NC_017272	TCC	2	6	1823130	1823135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432082
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48474	NC_017272	CAC	2	6	1823303	1823308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432082
48475	NC_017272	CCA	2	6	1823320	1823325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432082
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48477	NC_017272	GGT	3	9	1823372	1823380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432082
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48479	NC_017272	GAG	2	6	1823402	1823407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432082
48480	NC_017272	CCCCA	2	10	1823426	1823435	20 %	0 %	0 %	80 %	384432082
48481	NC_017272	CCACGG	2	12	1823449	1823460	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384432082
48482	NC_017272	AAT	2	6	1823516	1823521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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