MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017272	GC	3	6	155824	155829	0 %	0 %	50 %	50 %	384430371
4002	NC_017272	CGC	2	6	155833	155838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430371
4003	NC_017272	GAG	2	6	155840	155845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430371
4004	NC_017272	AGG	2	6	155886	155891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430371
4005	NC_017272	GGA	2	6	155893	155898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430371
4006	NC_017272	GGA	2	6	155953	155958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430371
4007	NC_017272	CGC	2	6	155964	155969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430371
4008	NC_017272	TGGGCC	2	12	156059	156070	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430371
4009	NC_017272	TCC	2	6	156120	156125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430371
4010	NC_017272	TCC	2	6	156181	156186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430372
4011	NC_017272	CTC	2	6	156231	156236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430372
4012	NC_017272	GGA	2	6	156254	156259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430372
4013	NC_017272	TCC	2	6	156274	156279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430372
4014	NC_017272	GGGC	2	8	156355	156362	0 %	0 %	75 %	25 %	384430372
4015	NC_017272	CACCTT	2	12	156384	156395	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384430372
4016	NC_017272	CCA	2	6	156473	156478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430372
4017	NC_017272	CCAG	2	8	156482	156489	25 %	0 %	25 %	50 %	384430372
4018	NC_017272	CCT	2	6	156495	156500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430372
4019	NC_017272	GTG	2	6	156511	156516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430372
4020	NC_017272	CGC	2	6	156527	156532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430372
4021	NC_017272	GGT	2	6	156545	156550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430372
4022	NC_017272	GTG	2	6	156601	156606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430372
4023	NC_017272	CCA	2	6	156662	156667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430372
4024	NC_017272	TCCC	2	8	156671	156678	0 %	25 %	0 %	75 %	384430372
4025	NC_017272	GTGGG	2	10	156682	156691	0 %	20 %	80 %	0 %	384430372
4026	NC_017272	CAG	2	6	156729	156734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430372
4027	NC_017272	AGG	2	6	156757	156762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430372
4028	NC_017272	GGA	2	6	156788	156793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430372
4029	NC_017272	TCC	2	6	156862	156867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430372
4030	NC_017272	GAG	2	6	156909	156914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430372
4031	NC_017272	GCG	2	6	156915	156920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430372
4032	NC_017272	GTG	2	6	157018	157023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430372
4033	NC_017272	GGC	2	6	157037	157042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430372
4034	NC_017272	TGG	2	6	157057	157062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430372
4035	NC_017272	GGA	2	6	157064	157069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430372
4036	NC_017272	CCT	2	6	157112	157117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430372
4037	NC_017272	CCT	3	9	157133	157141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430372
4038	NC_017272	AGG	2	6	157216	157221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430372
4039	NC_017272	CCA	2	6	157247	157252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430372
4040	NC_017272	CCA	2	6	157319	157324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430372
4041	NC_017272	CCTTGC	2	12	157325	157336	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384430372
4042	NC_017272	TCG	2	6	157339	157344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430372
4043	NC_017272	GAT	2	6	157359	157364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430372
4044	NC_017272	AGC	2	6	157408	157413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017272	GC	3	6	157430	157435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_017272	TAA	2	6	157447	157452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017272	TCAGG	2	10	157476	157485	20 %	20 %	40 %	20 %	384430373
4048	NC_017272	CAC	2	6	157551	157556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430373
4049	NC_017272	GAG	2	6	157626	157631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430373
4050	NC_017272	CTCG	2	8	157635	157642	0 %	25 %	25 %	50 %	384430373
4051	NC_017272	GAG	2	6	157665	157670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430373
4052	NC_017272	CCA	2	6	157697	157702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430373
4053	NC_017272	AGA	2	6	157727	157732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430373
4054	NC_017272	TCCG	2	8	157741	157748	0 %	25 %	25 %	50 %	384430373
4055	NC_017272	GAG	2	6	157803	157808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430373
4056	NC_017272	AGG	2	6	157843	157848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430373
4057	NC_017272	CCA	2	6	157904	157909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430373
4058	NC_017272	GAG	3	9	157929	157937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430373
4059	NC_017272	GAA	2	6	157941	157946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430373
4060	NC_017272	AGG	2	6	158029	158034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430373
4061	NC_017272	TGG	2	6	158075	158080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430373
4062	NC_017272	GAG	2	6	158097	158102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430373
4063	NC_017272	TCC	3	9	158145	158153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430374
4064	NC_017272	TGA	2	6	158167	158172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430374
4065	NC_017272	GCCGTA	2	12	158207	158218	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384430374
4066	NC_017272	GGC	3	9	158272	158280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430374
4067	NC_017272	GA	3	6	158289	158294	50 %	0 %	50 %	0 %	384430374
4068	NC_017272	GGC	2	6	158297	158302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430374
4069	NC_017272	CGGA	2	8	158307	158314	25 %	0 %	50 %	25 %	384430374
4070	NC_017272	TCC	2	6	158379	158384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430374
4071	NC_017272	ATGAAG	2	12	158532	158543	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384430374
4072	NC_017272	CTC	2	6	158612	158617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430374
4073	NC_017272	T	6	6	158625	158630	0 %	100 %	0 %	0 %	384430374
4074	NC_017272	GGA	2	6	158703	158708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430375
4075	NC_017272	CCTC	2	8	158718	158725	0 %	25 %	0 %	75 %	384430375
4076	NC_017272	G	7	7	158749	158755	0 %	0 %	100 %	0 %	384430375
4077	NC_017272	AGG	2	6	158792	158797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430375
4078	NC_017272	CGC	2	6	158798	158803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430375
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4080	NC_017272	CGAGGA	2	12	158859	158870	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430375
4081	NC_017272	C	7	7	158874	158880	0 %	0 %	0 %	100 %	384430375
4082	NC_017272	GGC	2	6	158889	158894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430375
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4084	NC_017272	CCT	2	6	158944	158949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430375
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4086	NC_017272	C	7	7	158971	158977	0 %	0 %	0 %	100 %	384430375
4087	NC_017272	GGGT	2	8	159017	159024	0 %	25 %	75 %	0 %	384430375
4088	NC_017272	GGTG	2	8	159030	159037	0 %	25 %	75 %	0 %	384430375
4089	NC_017272	CGT	2	6	159045	159050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430375
4090	NC_017272	GAG	3	9	159055	159063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430375
4091	NC_017272	GGC	2	6	159087	159092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430375
4092	NC_017272	GAG	2	6	159121	159126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430375
4093	NC_017272	GTG	3	9	159164	159172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430375
4094	NC_017272	ACC	2	6	159200	159205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430375
4095	NC_017272	CACCCG	2	12	159295	159306	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384430375
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4097	NC_017272	GCG	2	6	159334	159339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430375
4098	NC_017272	CCCGG	2	10	159349	159358	0 %	0 %	40 %	60 %	384430375
4099	NC_017272	G	7	7	159399	159405	0 %	0 %	100 %	0 %	384430376
4100	NC_017272	CTC	2	6	159432	159437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430376
4101	NC_017272	GGA	2	6	159494	159499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430376
4102	NC_017272	TGGTG	2	10	159530	159539	0 %	40 %	60 %	0 %	384430376
4103	NC_017272	CCT	2	6	159545	159550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430376
4104	NC_017272	TCC	2	6	159607	159612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430376
4105	NC_017272	CCT	2	6	159644	159649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430376
4106	NC_017272	GAG	3	9	159669	159677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430376
4107	NC_017272	CTTGGC	2	12	159684	159695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430376
4108	NC_017272	GAG	2	6	159705	159710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430376
4109	NC_017272	CGC	2	6	159738	159743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430376
4110	NC_017272	AAG	2	6	159768	159773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430376
4111	NC_017272	CGG	2	6	159803	159808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430376
4112	NC_017272	GCCCC	2	10	159824	159833	0 %	0 %	20 %	80 %	384430376
4113	NC_017272	CCG	2	6	159851	159856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430376
4114	NC_017272	CCA	2	6	159857	159862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430376
4115	NC_017272	AGA	2	6	159911	159916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430376
4116	NC_017272	CGG	2	6	159974	159979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430376
4117	NC_017272	AGA	2	6	159980	159985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430376
4118	NC_017272	AGGCGA	2	12	160136	160147	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430376
4119	NC_017272	CACCT	2	10	160253	160262	20 %	20 %	0 %	60 %	384430377
4120	NC_017272	ACG	2	6	160266	160271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430377
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4122	NC_017272	AGG	2	6	160278	160283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430377
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4247	NC_017272	CGC	2	6	164871	164876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4248	NC_017272	T	6	6	164900	164905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_017272	GCC	2	6	164954	164959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4250	NC_017272	AGG	2	6	164999	165004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_017272	CTC	2	6	165034	165039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430381
4252	NC_017272	GGTCCT	2	12	165087	165098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430381
4253	NC_017272	C	6	6	165143	165148	0 %	0 %	0 %	100 %	384430381
4254	NC_017272	TCC	2	6	165215	165220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430381
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4260	NC_017272	GGGC	2	8	165439	165446	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4261	NC_017272	GCC	2	6	165500	165505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430382
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4272	NC_017272	GCCCG	2	10	165880	165889	0 %	0 %	40 %	60 %	384430382
4273	NC_017272	GGTGG	2	10	166080	166089	0 %	20 %	80 %	0 %	384430382
4274	NC_017272	CTT	2	6	166107	166112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430382
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4281	NC_017272	G	6	6	166347	166352	0 %	0 %	100 %	0 %	384430382
4282	NC_017272	CCT	2	6	166368	166373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430382
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4319	NC_017272	GC	3	6	167671	167676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4320	NC_017272	GTC	2	6	167715	167720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4371	NC_017272	GAG	2	6	169437	169442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430387
4372	NC_017272	GGC	2	6	169443	169448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430387
4373	NC_017272	TCC	2	6	169462	169467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430387
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4488	NC_017272	TGGCC	2	10	172878	172887	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4494	NC_017272	G	6	6	173071	173076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4495	NC_017272	TCC	2	6	173136	173141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4497	NC_017272	CCT	2	6	173170	173175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4499	NC_017272	CTC	2	6	173213	173218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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