MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_017272	CGC	2	6	1616619	1616624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431861
43003	NC_017272	TCT	2	6	1616643	1616648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431861
43004	NC_017272	CTT	2	6	1616665	1616670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431861
43005	NC_017272	G	6	6	1616730	1616735	0 %	0 %	100 %	0 %	384431861
43006	NC_017272	CCT	2	6	1616736	1616741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431861
43007	NC_017272	GCC	2	6	1616752	1616757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431861
43008	NC_017272	TTC	2	6	1616789	1616794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431861
43009	NC_017272	CTT	2	6	1616827	1616832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431861
43010	NC_017272	CCT	2	6	1616841	1616846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431861
43011	NC_017272	CTT	2	6	1616902	1616907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431861
43012	NC_017272	GTT	2	6	1617030	1617035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431862
43013	NC_017272	GAT	2	6	1617036	1617041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431862
43014	NC_017272	CGG	2	6	1617044	1617049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431862
43015	NC_017272	GTC	2	6	1617054	1617059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431862
43016	NC_017272	CCT	2	6	1617092	1617097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431862
43017	NC_017272	CAC	3	9	1617108	1617116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431862
43018	NC_017272	CCTT	2	8	1617133	1617140	0 %	50 %	0 %	50 %	384431862
43019	NC_017272	C	6	6	1617146	1617151	0 %	0 %	0 %	100 %	384431862
43020	NC_017272	CCT	2	6	1617161	1617166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431862
43021	NC_017272	AGGT	2	8	1617274	1617281	25 %	25 %	50 %	0 %	384431862
43022	NC_017272	TACCT	2	10	1617296	1617305	20 %	40 %	0 %	40 %	384431862
43023	NC_017272	GGC	2	6	1617334	1617339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431863
43024	NC_017272	CCA	2	6	1617355	1617360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431863
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43026	NC_017272	GCGCTT	2	12	1617401	1617412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431863
43027	NC_017272	CCA	2	6	1617439	1617444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431863
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43029	NC_017272	CCA	2	6	1617541	1617546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431863
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43032	NC_017272	CTT	2	6	1617599	1617604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431863
43033	NC_017272	CCT	2	6	1617615	1617620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431864
43034	NC_017272	CTT	2	6	1617735	1617740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431864
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43036	NC_017272	GCT	2	6	1617794	1617799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431864
43037	NC_017272	CCTCA	2	10	1617801	1617810	20 %	20 %	0 %	60 %	384431864
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43039	NC_017272	CTC	2	6	1617898	1617903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431865
43040	NC_017272	CCGG	2	8	1617931	1617938	0 %	0 %	50 %	50 %	384431865
43041	NC_017272	CAC	2	6	1617943	1617948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431865
43042	NC_017272	CTT	2	6	1618003	1618008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431865
43043	NC_017272	CGC	2	6	1618050	1618055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431865
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43045	NC_017272	CTG	2	6	1618096	1618101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431865
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43049	NC_017272	CTC	2	6	1618240	1618245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431866
43050	NC_017272	CTT	2	6	1618246	1618251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431866
43051	NC_017272	CGG	3	9	1618271	1618279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431866
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43053	NC_017272	CGGGC	2	10	1618305	1618314	0 %	0 %	60 %	40 %	384431866
43054	NC_017272	GCC	2	6	1618327	1618332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431866
43055	NC_017272	GGT	2	6	1618381	1618386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431866
43056	NC_017272	GGC	2	6	1618450	1618455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431866
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43058	NC_017272	CCG	2	6	1618481	1618486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431866
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43062	NC_017272	CTC	2	6	1618687	1618692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431866
43063	NC_017272	ACC	2	6	1618730	1618735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431866
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43067	NC_017272	TCT	3	9	1618990	1618998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431867
43068	NC_017272	TGA	2	6	1618999	1619004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431867
43069	NC_017272	GCC	2	6	1619067	1619072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431867
43070	NC_017272	TCC	2	6	1619088	1619093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431867
43071	NC_017272	GTT	2	6	1619105	1619110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431867
43072	NC_017272	GGC	3	9	1619120	1619128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431867
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43074	NC_017272	TTG	2	6	1619166	1619171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431867
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43079	NC_017272	TGGCCT	2	12	1619304	1619315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431868
43080	NC_017272	CCA	2	6	1619370	1619375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431868
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43082	NC_017272	CCA	2	6	1619436	1619441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431868
43083	NC_017272	TGG	2	6	1619454	1619459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431868
43084	NC_017272	GCG	2	6	1619461	1619466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431868
43085	NC_017272	TGA	2	6	1619478	1619483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431868
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43087	NC_017272	GTC	2	6	1619533	1619538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431868
43088	NC_017272	ACCTC	2	10	1619572	1619581	20 %	20 %	0 %	60 %	384431869
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43090	NC_017272	GAT	2	6	1619598	1619603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431869
43091	NC_017272	CGC	2	6	1619623	1619628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431869
43092	NC_017272	AGGCG	2	10	1619664	1619673	20 %	0 %	60 %	20 %	384431869
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43096	NC_017272	AGGC	2	8	1619877	1619884	25 %	0 %	50 %	25 %	384431869
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43100	NC_017272	CTG	2	6	1620063	1620068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431869
43101	NC_017272	GAT	2	6	1620093	1620098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431869
43102	NC_017272	GCC	2	6	1620169	1620174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431869
43103	NC_017272	ATG	2	6	1620217	1620222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431869
43104	NC_017272	GCC	3	9	1620240	1620248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431869
43105	NC_017272	GTT	2	6	1620276	1620281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431869
43106	NC_017272	C	7	7	1620285	1620291	0 %	0 %	0 %	100 %	384431869
43107	NC_017272	TCT	2	6	1620293	1620298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431869
43108	NC_017272	GCG	2	6	1620369	1620374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431869
43109	NC_017272	CTT	2	6	1620396	1620401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431869
43110	NC_017272	TCC	2	6	1620418	1620423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43111	NC_017272	GGGCC	2	10	1620435	1620444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43112	NC_017272	TCT	2	6	1620488	1620493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431870
43113	NC_017272	CTT	2	6	1620519	1620524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431870
43114	NC_017272	CTT	3	9	1620561	1620569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431870
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43116	NC_017272	TGG	2	6	1620647	1620652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431870
43117	NC_017272	CGT	2	6	1620734	1620739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431870
43118	NC_017272	CAC	2	6	1620860	1620865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431871
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43120	NC_017272	CGG	2	6	1620888	1620893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431871
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43130	NC_017272	CGG	2	6	1621245	1621250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431871
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43134	NC_017272	CCT	2	6	1621372	1621377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43179	NC_017272	TCC	2	6	1623547	1623552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43180	NC_017272	AAG	2	6	1623557	1623562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43202	NC_017272	CTC	2	6	1624571	1624576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431875
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43221	NC_017272	GGGGAT	2	12	1625069	1625080	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384431875
43222	NC_017272	GGA	2	6	1625131	1625136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431875
43223	NC_017272	TCC	2	6	1625160	1625165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431875
43224	NC_017272	CAC	2	6	1625186	1625191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431875
43225	NC_017272	GC	3	6	1625195	1625200	0 %	0 %	50 %	50 %	384431875
43226	NC_017272	TTG	2	6	1625262	1625267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431875
43227	NC_017272	CTGG	2	8	1625339	1625346	0 %	25 %	50 %	25 %	384431875
43228	NC_017272	GAT	2	6	1625429	1625434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431875
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43230	NC_017272	GGT	2	6	1625462	1625467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431875
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43232	NC_017272	TGG	2	6	1625521	1625526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431875
43233	NC_017272	GTA	2	6	1625570	1625575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431875
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43347	NC_017272	CCA	2	6	1629474	1629479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431881
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