MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_017272	TGT	2	6	1597061	1597066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431831
42503	NC_017272	GTG	2	6	1597090	1597095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431831
42504	NC_017272	CTC	2	6	1597119	1597124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431831
42505	NC_017272	G	6	6	1597134	1597139	0 %	0 %	100 %	0 %	384431831
42506	NC_017272	CTT	2	6	1597152	1597157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431831
42507	NC_017272	C	6	6	1597209	1597214	0 %	0 %	0 %	100 %	384431831
42508	NC_017272	AGGT	2	8	1597255	1597262	25 %	25 %	50 %	0 %	384431831
42509	NC_017272	CCCA	2	8	1597315	1597322	25 %	0 %	0 %	75 %	384431831
42510	NC_017272	CCG	2	6	1597349	1597354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431831
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42512	NC_017272	CCA	2	6	1597412	1597417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431831
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42515	NC_017272	ACC	2	6	1597642	1597647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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42519	NC_017272	GCC	2	6	1597843	1597848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431832
42520	NC_017272	GGC	3	9	1597943	1597951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431832
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42542	NC_017272	G	6	6	1598878	1598883	0 %	0 %	100 %	0 %	384431833
42543	NC_017272	CTC	2	6	1598978	1598983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431833
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42590	NC_017272	CGT	2	6	1601102	1601107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431835
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42600	NC_017272	CTCCC	2	10	1601375	1601384	0 %	20 %	0 %	80 %	384431835
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42602	NC_017272	CAG	2	6	1601414	1601419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431835
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42605	NC_017272	CCCGCA	2	12	1601470	1601481	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384431835
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42607	NC_017272	CCG	2	6	1601512	1601517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431835
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42610	NC_017272	CCTG	2	8	1601671	1601678	0 %	25 %	25 %	50 %	384431835
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42614	NC_017272	AG	3	6	1601849	1601854	50 %	0 %	50 %	0 %	384431835
42615	NC_017272	AGGC	2	8	1601918	1601925	25 %	0 %	50 %	25 %	384431835
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42617	NC_017272	GCACC	2	10	1601971	1601980	20 %	0 %	20 %	60 %	384431835
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42969	NC_017272	CTC	2	6	1615225	1615230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431857
42970	NC_017272	CAC	3	9	1615231	1615239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431857
42971	NC_017272	CTTGAC	2	12	1615285	1615296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384431857
42972	NC_017272	CAC	2	6	1615366	1615371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431858
42973	NC_017272	CGC	2	6	1615388	1615393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431858
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42975	NC_017272	CGC	2	6	1615507	1615512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431858
42976	NC_017272	CCG	2	6	1615527	1615532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431858
42977	NC_017272	TGG	2	6	1615537	1615542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431858
42978	NC_017272	CGTCCA	2	12	1615619	1615630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384431858
42979	NC_017272	TGA	2	6	1615646	1615651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431858
42980	NC_017272	CG	3	6	1615660	1615665	0 %	0 %	50 %	50 %	384431858
42981	NC_017272	TCC	2	6	1615681	1615686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431858
42982	NC_017272	C	7	7	1615830	1615836	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42983	NC_017272	GCAG	2	8	1615904	1615911	25 %	0 %	50 %	25 %	384431859
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42988	NC_017272	CAC	2	6	1616113	1616118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431860
42989	NC_017272	CCA	2	6	1616145	1616150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431860
42990	NC_017272	GCT	2	6	1616178	1616183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431860
42991	NC_017272	GAG	2	6	1616272	1616277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431860
42992	NC_017272	CGC	2	6	1616306	1616311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431860
42993	NC_017272	CTT	2	6	1616368	1616373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431860
42994	NC_017272	TGA	2	6	1616403	1616408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431860
42995	NC_017272	GCC	2	6	1616423	1616428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431860
42996	NC_017272	TCC	2	6	1616447	1616452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431860
42997	NC_017272	TGA	2	6	1616475	1616480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431860
42998	NC_017272	GCG	2	6	1616527	1616532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431860
42999	NC_017272	CCT	2	6	1616550	1616555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431860
43000	NC_017272	GTA	2	6	1616557	1616562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431860

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