MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_017272	GCG	2	6	1559865	1559870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431794
41503	NC_017272	GGAGC	2	10	1559885	1559894	20 %	0 %	60 %	20 %	384431794
41504	NC_017272	GCC	2	6	1559898	1559903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431794
41505	NC_017272	CG	3	6	1559910	1559915	0 %	0 %	50 %	50 %	384431794
41506	NC_017272	TGCGG	2	10	1559948	1559957	0 %	20 %	60 %	20 %	384431794
41507	NC_017272	AGG	3	9	1559968	1559976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431794
41508	NC_017272	GCC	2	6	1560023	1560028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431794
41509	NC_017272	GAG	2	6	1560030	1560035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431794
41510	NC_017272	TAC	2	6	1560051	1560056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431794
41511	NC_017272	GCCC	2	8	1560068	1560075	0 %	0 %	25 %	75 %	384431794
41512	NC_017272	CAC	2	6	1560171	1560176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431794
41513	NC_017272	CTT	2	6	1560200	1560205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431794
41514	NC_017272	CCT	2	6	1560208	1560213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431794
41515	NC_017272	GGGCCT	2	12	1560266	1560277	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384431794
41516	NC_017272	GAG	2	6	1560285	1560290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431794
41517	NC_017272	GAC	3	9	1560303	1560311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431794
41518	NC_017272	GCC	2	6	1560327	1560332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431794
41519	NC_017272	CCA	2	6	1560466	1560471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431795
41520	NC_017272	C	7	7	1560476	1560482	0 %	0 %	0 %	100 %	384431795
41521	NC_017272	GGA	2	6	1560487	1560492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431795
41522	NC_017272	TCT	2	6	1560496	1560501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431795
41523	NC_017272	CCA	2	6	1560529	1560534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431795
41524	NC_017272	ACC	2	6	1560549	1560554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431795
41525	NC_017272	GAG	2	6	1560563	1560568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431795
41526	NC_017272	AGGGTC	2	12	1560615	1560626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384431795
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41528	NC_017272	GAT	2	6	1560638	1560643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431795
41529	NC_017272	TCC	2	6	1560648	1560653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431795
41530	NC_017272	GCG	3	9	1560662	1560670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431795
41531	NC_017272	CCA	2	6	1560679	1560684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431795
41532	NC_017272	GTG	2	6	1560744	1560749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431795
41533	NC_017272	CCT	2	6	1560763	1560768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431795
41534	NC_017272	CCA	2	6	1560832	1560837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431795
41535	NC_017272	CGC	2	6	1560889	1560894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431795
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41538	NC_017272	ACC	2	6	1561014	1561019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431796
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41540	NC_017272	CGT	2	6	1561081	1561086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431796
41541	NC_017272	CTT	2	6	1561100	1561105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431796
41542	NC_017272	GTG	2	6	1561161	1561166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431796
41543	NC_017272	GGC	2	6	1561180	1561185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431796
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41546	NC_017272	CGG	2	6	1561339	1561344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431796
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41549	NC_017272	GTG	2	6	1561539	1561544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431797
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41551	NC_017272	CAC	2	6	1561605	1561610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431797
41552	NC_017272	GTG	2	6	1561614	1561619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431797
41553	NC_017272	CCT	3	9	1561661	1561669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431797
41554	NC_017272	CGCC	2	8	1561742	1561749	0 %	0 %	25 %	75 %	384431797
41555	NC_017272	TGGCCC	2	12	1561807	1561818	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431797
41556	NC_017272	TGG	2	6	1561840	1561845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431797
41557	NC_017272	GGA	2	6	1561847	1561852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431797
41558	NC_017272	GGT	2	6	1561853	1561858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431797
41559	NC_017272	GGCG	2	8	1561865	1561872	0 %	0 %	75 %	25 %	384431797
41560	NC_017272	GGA	2	6	1561874	1561879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431797
41561	NC_017272	GCG	2	6	1561902	1561907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431797
41562	NC_017272	GCG	2	6	1561917	1561922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41563	NC_017272	G	6	6	1561934	1561939	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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41565	NC_017272	CTTT	2	8	1561998	1562005	0 %	75 %	0 %	25 %	384431798
41566	NC_017272	GGCCCA	2	12	1562019	1562030	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384431798
41567	NC_017272	G	6	6	1562054	1562059	0 %	0 %	100 %	0 %	384431798
41568	NC_017272	GGGC	2	8	1562071	1562078	0 %	0 %	75 %	25 %	384431798
41569	NC_017272	GGC	2	6	1562085	1562090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431798
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41571	NC_017272	CTC	2	6	1562131	1562136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431798
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41573	NC_017272	GTG	2	6	1562170	1562175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431798
41574	NC_017272	C	7	7	1562196	1562202	0 %	0 %	0 %	100 %	384431798
41575	NC_017272	ACG	2	6	1562231	1562236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431798
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41584	NC_017272	CGC	2	6	1562485	1562490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431798
41585	NC_017272	ACC	2	6	1562522	1562527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431798
41586	NC_017272	CCT	2	6	1562553	1562558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431798
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41588	NC_017272	CCCG	2	8	1562600	1562607	0 %	0 %	25 %	75 %	384431798
41589	NC_017272	CCCCT	2	10	1562608	1562617	0 %	20 %	0 %	80 %	384431798
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41593	NC_017272	CTT	2	6	1562878	1562883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431799
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41599	NC_017272	CTTC	2	8	1563095	1563102	0 %	50 %	0 %	50 %	384431800
41600	NC_017272	GTA	2	6	1563201	1563206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431800
41601	NC_017272	C	6	6	1563232	1563237	0 %	0 %	0 %	100 %	384431800
41602	NC_017272	CCA	2	6	1563248	1563253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431800
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41604	NC_017272	G	6	6	1563352	1563357	0 %	0 %	100 %	0 %	384431800
41605	NC_017272	GCC	2	6	1563373	1563378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431800
41606	NC_017272	CTC	2	6	1563432	1563437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431800
41607	NC_017272	CTC	3	9	1563462	1563470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431800
41608	NC_017272	GGT	2	6	1563501	1563506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431800
41609	NC_017272	GTA	2	6	1563555	1563560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431800
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41612	NC_017272	AGGTGG	2	12	1563622	1563633	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384431800
41613	NC_017272	AGG	2	6	1563670	1563675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431800
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41615	NC_017272	GGA	2	6	1563702	1563707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431800
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41852	NC_017272	CCT	2	6	1572760	1572765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431811
41853	NC_017272	GCC	2	6	1572809	1572814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431811
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41921	NC_017272	CTC	2	6	1575227	1575232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431813
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41924	NC_017272	CCG	2	6	1575396	1575401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431813
41925	NC_017272	CCG	2	6	1575403	1575408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431813
41926	NC_017272	GCC	2	6	1575455	1575460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431813
41927	NC_017272	GAG	2	6	1575467	1575472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431813
41928	NC_017272	CCA	2	6	1575538	1575543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41929	NC_017272	GGC	2	6	1575569	1575574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431814
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41931	NC_017272	CGG	2	6	1575651	1575656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431814
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41933	NC_017272	G	6	6	1575726	1575731	0 %	0 %	100 %	0 %	384431814
41934	NC_017272	AGGA	2	8	1575748	1575755	50 %	0 %	50 %	0 %	384431814
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41939	NC_017272	ATG	2	6	1575847	1575852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431814
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41944	NC_017272	GGC	2	6	1575990	1575995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431814
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41948	NC_017272	GTCCAG	2	12	1576125	1576136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384431814
41949	NC_017272	C	6	6	1576145	1576150	0 %	0 %	0 %	100 %	384431814
41950	NC_017272	CCAGGG	2	12	1576178	1576189	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384431814
41951	NC_017272	GTA	2	6	1576284	1576289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431814
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41953	NC_017272	CGC	2	6	1576351	1576356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431814
41954	NC_017272	GCC	2	6	1576382	1576387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431814
41955	NC_017272	GTA	2	6	1576392	1576397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431814
41956	NC_017272	GAT	2	6	1576425	1576430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431814
41957	NC_017272	GAG	2	6	1576461	1576466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431814
41958	NC_017272	GAT	2	6	1576485	1576490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431814
41959	NC_017272	GTC	2	6	1576515	1576520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431814
41960	NC_017272	AGT	2	6	1576556	1576561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431814
41961	NC_017272	TGGGC	2	10	1576583	1576592	0 %	20 %	60 %	20 %	384431814
41962	NC_017272	GAG	2	6	1576641	1576646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431814
41963	NC_017272	GCC	2	6	1576682	1576687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431814
41964	NC_017272	GGC	2	6	1576691	1576696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431814
41965	NC_017272	AGA	2	6	1576700	1576705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431814
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