MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_017272	CCA	2	6	1542401	1542406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431771
41003	NC_017272	CTC	3	9	1542414	1542422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431771
41004	NC_017272	C	6	6	1542449	1542454	0 %	0 %	0 %	100 %	384431771
41005	NC_017272	GAGGCG	2	12	1542483	1542494	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384431771
41006	NC_017272	CCT	2	6	1542518	1542523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431771
41007	NC_017272	C	6	6	1542558	1542563	0 %	0 %	0 %	100 %	384431771
41008	NC_017272	TCG	2	6	1542601	1542606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431771
41009	NC_017272	ACC	2	6	1542610	1542615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431771
41010	NC_017272	GGGA	2	8	1542627	1542634	25 %	0 %	75 %	0 %	384431771
41011	NC_017272	G	6	6	1542653	1542658	0 %	0 %	100 %	0 %	384431771
41012	NC_017272	CCGC	2	8	1542662	1542669	0 %	0 %	25 %	75 %	384431771
41013	NC_017272	GTA	2	6	1542681	1542686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431771
41014	NC_017272	CTCCGC	2	12	1542714	1542725	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384431771
41015	NC_017272	GGAA	2	8	1542749	1542756	50 %	0 %	50 %	0 %	384431771
41016	NC_017272	CAC	2	6	1542834	1542839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431771
41017	NC_017272	CTC	2	6	1542867	1542872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431772
41018	NC_017272	CTT	2	6	1542888	1542893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431772
41019	NC_017272	GCC	3	9	1542919	1542927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431772
41020	NC_017272	CGGG	2	8	1542953	1542960	0 %	0 %	75 %	25 %	384431772
41021	NC_017272	CGG	2	6	1542965	1542970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431772
41022	NC_017272	AGG	2	6	1543008	1543013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431772
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41024	NC_017272	CGC	2	6	1543139	1543144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431772
41025	NC_017272	CCGC	3	12	1543141	1543152	0 %	0 %	25 %	75 %	384431772
41026	NC_017272	CCGG	2	8	1543156	1543163	0 %	0 %	50 %	50 %	384431772
41027	NC_017272	TCG	2	6	1543204	1543209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431772
41028	NC_017272	GAA	2	6	1543218	1543223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431772
41029	NC_017272	CGC	2	6	1543246	1543251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431772
41030	NC_017272	GTG	2	6	1543320	1543325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431772
41031	NC_017272	CCA	2	6	1543358	1543363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431772
41032	NC_017272	GCCC	2	8	1543419	1543426	0 %	0 %	25 %	75 %	384431772
41033	NC_017272	TC	3	6	1543445	1543450	0 %	50 %	0 %	50 %	384431772
41034	NC_017272	GTA	2	6	1543458	1543463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431772
41035	NC_017272	CTC	2	6	1543487	1543492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41036	NC_017272	C	6	6	1543551	1543556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41037	NC_017272	CGG	2	6	1543562	1543567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41038	NC_017272	CCCA	2	8	1543585	1543592	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41039	NC_017272	GGA	2	6	1543642	1543647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431773
41040	NC_017272	CAC	2	6	1543652	1543657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431773
41041	NC_017272	CCGC	2	8	1543658	1543665	0 %	0 %	25 %	75 %	384431773
41042	NC_017272	GGA	2	6	1543669	1543674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431773
41043	NC_017272	AGC	2	6	1543678	1543683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431773
41044	NC_017272	GGAAGG	2	12	1543735	1543746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431773
41045	NC_017272	GGC	2	6	1543773	1543778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431773
41046	NC_017272	C	7	7	1543799	1543805	0 %	0 %	0 %	100 %	384431773
41047	NC_017272	GAG	2	6	1543820	1543825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431773
41048	NC_017272	CCCG	2	8	1543834	1543841	0 %	0 %	25 %	75 %	384431773
41049	NC_017272	AGG	2	6	1543842	1543847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431773
41050	NC_017272	GAG	2	6	1543850	1543855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431773
41051	NC_017272	C	8	8	1543957	1543964	0 %	0 %	0 %	100 %	384431773
41052	NC_017272	GCC	2	6	1543974	1543979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431773
41053	NC_017272	GAG	4	12	1543985	1543996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431773
41054	NC_017272	CGG	2	6	1544036	1544041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431774
41055	NC_017272	GCC	2	6	1544056	1544061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431774
41056	NC_017272	GAG	2	6	1544067	1544072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431774
41057	NC_017272	GTA	2	6	1544151	1544156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431774
41058	NC_017272	CCGC	2	8	1544171	1544178	0 %	0 %	25 %	75 %	384431774
41059	NC_017272	GGGCCT	2	12	1544192	1544203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384431774
41060	NC_017272	GGGC	2	8	1544291	1544298	0 %	0 %	75 %	25 %	384431774
41061	NC_017272	CGC	2	6	1544305	1544310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431774
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41063	NC_017272	CCT	2	6	1544327	1544332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431774
41064	NC_017272	GCC	2	6	1544347	1544352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431774
41065	NC_017272	GCC	2	6	1544368	1544373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431774
41066	NC_017272	CCT	2	6	1544438	1544443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431774
41067	NC_017272	GGA	2	6	1544453	1544458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431774
41068	NC_017272	TCC	2	6	1544464	1544469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431774
41069	NC_017272	GCC	4	12	1544509	1544520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431774
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41071	NC_017272	CTG	2	6	1544544	1544549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431774
41072	NC_017272	TTC	2	6	1544596	1544601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431774
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41074	NC_017272	C	7	7	1544703	1544709	0 %	0 %	0 %	100 %	384431775
41075	NC_017272	CCA	2	6	1544757	1544762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431775
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41079	NC_017272	CCGC	2	8	1544895	1544902	0 %	0 %	25 %	75 %	384431775
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41085	NC_017272	GGCG	2	8	1545222	1545229	0 %	0 %	75 %	25 %	384431775
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41087	NC_017272	TCC	2	6	1545245	1545250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431775
41088	NC_017272	GAG	2	6	1545268	1545273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431775
41089	NC_017272	GCC	2	6	1545305	1545310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431775
41090	NC_017272	ACC	2	6	1545311	1545316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431775
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41092	NC_017272	GAG	2	6	1545436	1545441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431775
41093	NC_017272	C	6	6	1545460	1545465	0 %	0 %	0 %	100 %	384431775
41094	NC_017272	GAG	2	6	1545487	1545492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431775
41095	NC_017272	GCCG	2	8	1545495	1545502	0 %	0 %	50 %	50 %	384431775
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41100	NC_017272	CTCC	2	8	1545672	1545679	0 %	25 %	0 %	75 %	384431775
41101	NC_017272	GGA	2	6	1545681	1545686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431775
41102	NC_017272	ACCCC	2	10	1545690	1545699	20 %	0 %	0 %	80 %	384431775
41103	NC_017272	CTC	2	6	1545745	1545750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431775
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41105	NC_017272	CTCG	2	8	1545811	1545818	0 %	25 %	25 %	50 %	384431775
41106	NC_017272	GAG	3	9	1545862	1545870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431775
41107	NC_017272	GAG	4	12	1545880	1545891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431775
41108	NC_017272	GGA	2	6	1545913	1545918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431775
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41110	NC_017272	C	6	6	1546024	1546029	0 %	0 %	0 %	100 %	384431776
41111	NC_017272	CCT	2	6	1546048	1546053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431776
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41114	NC_017272	CCT	2	6	1546189	1546194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431776
41115	NC_017272	CGG	2	6	1546209	1546214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431776
41116	NC_017272	GGCG	2	8	1546228	1546235	0 %	0 %	75 %	25 %	384431776
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41236	NC_017272	AGG	3	9	1550205	1550213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431779
41237	NC_017272	CCT	2	6	1550215	1550220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431779
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41264	NC_017272	TCC	2	6	1551227	1551232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41472	NC_017272	CTT	2	6	1558951	1558956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431792
41473	NC_017272	CTT	2	6	1558969	1558974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431792
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41479	NC_017272	TCCC	2	8	1559154	1559161	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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