MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_017272	CGGGCC	2	12	1506200	1506211	0 %	0 %	50 %	50 %	384431732
40003	NC_017272	CGC	2	6	1506256	1506261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431732
40004	NC_017272	TGC	2	6	1506273	1506278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431732
40005	NC_017272	GGA	2	6	1506280	1506285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431732
40006	NC_017272	GAG	2	6	1506311	1506316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431732
40007	NC_017272	TGG	3	9	1506342	1506350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431732
40008	NC_017272	CGC	2	6	1506385	1506390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431732
40009	NC_017272	GGT	2	6	1506397	1506402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431732
40010	NC_017272	GAG	2	6	1506476	1506481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431732
40011	NC_017272	CCG	2	6	1506486	1506491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431732
40012	NC_017272	GGC	2	6	1506500	1506505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431732
40013	NC_017272	TGA	2	6	1506558	1506563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431732
40014	NC_017272	GGT	2	6	1506604	1506609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431732
40015	NC_017272	CCT	2	6	1506613	1506618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431732
40016	NC_017272	GCC	2	6	1506633	1506638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431732
40017	NC_017272	CACC	2	8	1506658	1506665	25 %	0 %	0 %	75 %	384431732
40018	NC_017272	GCCC	2	8	1506702	1506709	0 %	0 %	25 %	75 %	384431732
40019	NC_017272	T	6	6	1506734	1506739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40020	NC_017272	AGG	2	6	1506757	1506762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40021	NC_017272	GGA	2	6	1506793	1506798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431733
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40030	NC_017272	GGGGAA	2	12	1507055	1507066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431733
40031	NC_017272	GCC	2	6	1507103	1507108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431733
40032	NC_017272	AGG	2	6	1507131	1507136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431733
40033	NC_017272	GAT	2	6	1507177	1507182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431733
40034	NC_017272	AGG	2	6	1507245	1507250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431733
40035	NC_017272	CCT	2	6	1507252	1507257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431733
40036	NC_017272	CCG	2	6	1507293	1507298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431733
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40039	NC_017272	GTA	2	6	1507378	1507383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431733
40040	NC_017272	TGGTCC	2	12	1507395	1507406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431734
40041	NC_017272	C	6	6	1507491	1507496	0 %	0 %	0 %	100 %	384431734
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40043	NC_017272	G	7	7	1507540	1507546	0 %	0 %	100 %	0 %	384431734
40044	NC_017272	AAG	2	6	1507549	1507554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431734
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40046	NC_017272	GACCC	2	10	1507578	1507587	20 %	0 %	20 %	60 %	384431734
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40050	NC_017272	CTC	2	6	1507703	1507708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431734
40051	NC_017272	CCA	2	6	1507768	1507773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431734
40052	NC_017272	CCGCC	2	10	1507785	1507794	0 %	0 %	20 %	80 %	384431734
40053	NC_017272	GTG	2	6	1507808	1507813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431734
40054	NC_017272	GGA	2	6	1507822	1507827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431734
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40059	NC_017272	TCC	2	6	1508028	1508033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431734
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40062	NC_017272	CTC	3	9	1508072	1508080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431734
40063	NC_017272	ACC	2	6	1508097	1508102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431734
40064	NC_017272	GAG	2	6	1508147	1508152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431734
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40088	NC_017272	ATG	2	6	1508902	1508907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431734
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40103	NC_017272	GGA	2	6	1509375	1509380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431735
40104	NC_017272	CTGCC	2	10	1509394	1509403	0 %	20 %	20 %	60 %	384431735
40105	NC_017272	AGG	2	6	1509481	1509486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40106	NC_017272	CGA	2	6	1509525	1509530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431736
40107	NC_017272	GAA	2	6	1509549	1509554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431736
40108	NC_017272	AGG	2	6	1509569	1509574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431736
40109	NC_017272	GTG	2	6	1509610	1509615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431736
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40112	NC_017272	AGT	2	6	1509776	1509781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431736
40113	NC_017272	CTT	2	6	1509890	1509895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431737
40114	NC_017272	CGGG	2	8	1509902	1509909	0 %	0 %	75 %	25 %	384431737
40115	NC_017272	G	6	6	1509907	1509912	0 %	0 %	100 %	0 %	384431737
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40470	NC_017272	TCC	2	6	1522431	1522436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431751
40471	NC_017272	AAG	2	6	1522475	1522480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431751
40472	NC_017272	CCT	2	6	1522495	1522500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431751
40473	NC_017272	C	7	7	1522501	1522507	0 %	0 %	0 %	100 %	384431751
40474	NC_017272	CCT	2	6	1522591	1522596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431751
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40480	NC_017272	C	7	7	1522816	1522822	0 %	0 %	0 %	100 %	384431751
40481	NC_017272	GGC	2	6	1522853	1522858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431751
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40483	NC_017272	GAG	2	6	1522985	1522990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431751
40484	NC_017272	TCC	2	6	1523004	1523009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431751
40485	NC_017272	CGG	2	6	1523022	1523027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431751
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40491	NC_017272	GGCCC	2	10	1523357	1523366	0 %	0 %	40 %	60 %	384431751
40492	NC_017272	GCC	2	6	1523376	1523381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431751
40493	NC_017272	CCT	2	6	1523392	1523397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431751
40494	NC_017272	CCT	2	6	1523452	1523457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431751
40495	NC_017272	GGCCAC	2	12	1523462	1523473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384431751
40496	NC_017272	CTC	2	6	1523474	1523479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431751
40497	NC_017272	CCT	2	6	1523482	1523487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431751
40498	NC_017272	GGGGC	2	10	1523491	1523500	0 %	0 %	80 %	20 %	384431751
40499	NC_017272	CTC	2	6	1523507	1523512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431751
40500	NC_017272	CCA	2	6	1523524	1523529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431751

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