MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017272	GGT	2	6	135551	135556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430348
3502	NC_017272	TGG	2	6	135580	135585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430348
3503	NC_017272	CGC	2	6	135608	135613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430348
3504	NC_017272	CCTTC	2	10	135662	135671	0 %	40 %	0 %	60 %	384430348
3505	NC_017272	GGT	2	6	135680	135685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430348
3506	NC_017272	C	6	6	135765	135770	0 %	0 %	0 %	100 %	384430348
3507	NC_017272	GGCGC	2	10	135806	135815	0 %	0 %	60 %	40 %	384430348
3508	NC_017272	TGG	2	6	135913	135918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430348
3509	NC_017272	CCCGG	2	10	135923	135932	0 %	0 %	40 %	60 %	384430348
3510	NC_017272	CTC	3	9	135945	135953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430348
3511	NC_017272	TCCT	2	8	135958	135965	0 %	50 %	0 %	50 %	384430348
3512	NC_017272	CCT	2	6	135967	135972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430348
3513	NC_017272	CCG	2	6	136013	136018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_017272	CGG	2	6	136031	136036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_017272	GGCG	2	8	136082	136089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_017272	GCG	2	6	136132	136137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_017272	TGG	2	6	136160	136165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430349
3518	NC_017272	GGT	2	6	136227	136232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430349
3519	NC_017272	CTC	3	9	136255	136263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430349
3520	NC_017272	TCA	2	6	136280	136285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430349
3521	NC_017272	TGG	2	6	136409	136414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430349
3522	NC_017272	GAG	2	6	136468	136473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430349
3523	NC_017272	ACCCC	2	10	136514	136523	20 %	0 %	0 %	80 %	384430349
3524	NC_017272	TGGG	2	8	136540	136547	0 %	25 %	75 %	0 %	384430349
3525	NC_017272	GGA	2	6	136548	136553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430349
3526	NC_017272	AGG	2	6	136583	136588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430349
3527	NC_017272	CCT	2	6	136682	136687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430349
3528	NC_017272	GGA	2	6	136719	136724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430349
3529	NC_017272	GTG	2	6	136738	136743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430349
3530	NC_017272	CTC	2	6	136820	136825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430350
3531	NC_017272	GGT	2	6	136855	136860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430350
3532	NC_017272	GGCCC	2	10	136879	136888	0 %	0 %	40 %	60 %	384430350
3533	NC_017272	AGG	2	6	137001	137006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430350
3534	NC_017272	TGA	2	6	137055	137060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430350
3535	NC_017272	GGA	2	6	137137	137142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430350
3536	NC_017272	AGG	2	6	137147	137152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430350
3537	NC_017272	GGC	2	6	137228	137233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430350
3538	NC_017272	GCCA	2	8	137234	137241	25 %	0 %	25 %	50 %	384430350
3539	NC_017272	CGC	2	6	137245	137250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430350
3540	NC_017272	TGG	2	6	137289	137294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430350
3541	NC_017272	CGC	2	6	137347	137352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430350
3542	NC_017272	GCC	2	6	137391	137396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430350
3543	NC_017272	CGGG	2	8	137420	137427	0 %	0 %	75 %	25 %	384430350
3544	NC_017272	AAG	2	6	137462	137467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430350
3545	NC_017272	GGA	3	9	137521	137529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430350
3546	NC_017272	C	7	7	137635	137641	0 %	0 %	0 %	100 %	384430350
3547	NC_017272	TCC	2	6	137783	137788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430351
3548	NC_017272	CCT	2	6	137793	137798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430351
3549	NC_017272	CTC	3	9	137803	137811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430351
3550	NC_017272	CCT	2	6	137826	137831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430351
3551	NC_017272	G	7	7	137856	137862	0 %	0 %	100 %	0 %	384430351
3552	NC_017272	TCC	2	6	137876	137881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430351
3553	NC_017272	CCT	3	9	137949	137957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430351
3554	NC_017272	GGGGT	2	10	138022	138031	0 %	20 %	80 %	0 %	384430351
3555	NC_017272	TCT	2	6	138038	138043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430351
3556	NC_017272	CCT	2	6	138066	138071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430351
3557	NC_017272	TCC	2	6	138074	138079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430351
3558	NC_017272	AAG	2	6	138122	138127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017272	GCG	2	6	138192	138197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430352
3560	NC_017272	AGG	2	6	138248	138253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430352
3561	NC_017272	CAC	2	6	138321	138326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430352
3562	NC_017272	AGGG	2	8	138370	138377	25 %	0 %	75 %	0 %	384430352
3563	NC_017272	ACCT	2	8	138457	138464	25 %	25 %	0 %	50 %	384430352
3564	NC_017272	G	7	7	138525	138531	0 %	0 %	100 %	0 %	384430352
3565	NC_017272	GAG	2	6	138535	138540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430352
3566	NC_017272	AAG	2	6	138577	138582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430352
3567	NC_017272	GGGGC	2	10	138604	138613	0 %	0 %	80 %	20 %	384430352
3568	NC_017272	CAA	2	6	138630	138635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430352
3569	NC_017272	CTC	2	6	138640	138645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430352
3570	NC_017272	GCG	2	6	138661	138666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430352
3571	NC_017272	TCA	2	6	138725	138730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430352
3572	NC_017272	CCT	2	6	138734	138739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430352
3573	NC_017272	CTC	2	6	138883	138888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430352
3574	NC_017272	ACC	2	6	139001	139006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_017272	GGT	2	6	139064	139069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017272	TAT	2	6	139201	139206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384430353
3577	NC_017272	AG	3	6	139213	139218	50 %	0 %	50 %	0 %	384430353
3578	NC_017272	TCC	2	6	139274	139279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3579	NC_017272	TCC	2	6	139383	139388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3580	NC_017272	CCT	2	6	139389	139394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3581	NC_017272	AGA	2	6	139407	139412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430353
3582	NC_017272	TCC	2	6	139424	139429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3583	NC_017272	AGG	2	6	139508	139513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430353
3584	NC_017272	GAA	2	6	139531	139536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430353
3585	NC_017272	CGG	2	6	139539	139544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430353
3586	NC_017272	GAAG	2	8	139556	139563	50 %	0 %	50 %	0 %	384430353
3587	NC_017272	ACC	2	6	139574	139579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430353
3588	NC_017272	GAG	2	6	139606	139611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430353
3589	NC_017272	CCT	2	6	139641	139646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3590	NC_017272	GGA	2	6	139668	139673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430353
3591	NC_017272	AGA	2	6	139677	139682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430353
3592	NC_017272	CCCT	2	8	139711	139718	0 %	25 %	0 %	75 %	384430353
3593	NC_017272	GCTG	2	8	139731	139738	0 %	25 %	50 %	25 %	384430353
3594	NC_017272	CTCC	2	8	140035	140042	0 %	25 %	0 %	75 %	384430353
3595	NC_017272	TCC	2	6	140060	140065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3596	NC_017272	CCT	2	6	140068	140073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3597	NC_017272	CCT	2	6	140082	140087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3598	NC_017272	GGT	2	6	140158	140163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430353
3599	NC_017272	GGA	2	6	140175	140180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430353
3600	NC_017272	CCT	2	6	140331	140336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3601	NC_017272	CAC	2	6	140338	140343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430353
3602	NC_017272	CTT	2	6	140361	140366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430353
3603	NC_017272	CCT	2	6	140398	140403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3604	NC_017272	CGG	2	6	140442	140447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430353
3605	NC_017272	TCC	3	9	140465	140473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3606	NC_017272	CCA	2	6	140496	140501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430353
3607	NC_017272	G	7	7	140503	140509	0 %	0 %	100 %	0 %	384430353
3608	NC_017272	CCCT	2	8	140550	140557	0 %	25 %	0 %	75 %	384430353
3609	NC_017272	AGG	2	6	140558	140563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430353
3610	NC_017272	GGT	3	9	140571	140579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430353
3611	NC_017272	TCC	2	6	140609	140614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430353
3612	NC_017272	TGAT	2	8	140630	140637	25 %	50 %	25 %	0 %	384430353
3613	NC_017272	GTA	2	6	140686	140691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430353
3614	NC_017272	AGA	2	6	140728	140733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430353
3615	NC_017272	AGG	3	9	140753	140761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430353
3616	NC_017272	G	6	6	140784	140789	0 %	0 %	100 %	0 %	384430353
3617	NC_017272	TCC	2	6	140871	140876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430354
3618	NC_017272	CTT	2	6	140906	140911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430354
3619	NC_017272	CGAG	2	8	140943	140950	25 %	0 %	50 %	25 %	384430354
3620	NC_017272	TCC	3	9	140955	140963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430354
3621	NC_017272	ACC	2	6	141012	141017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430354
3622	NC_017272	C	6	6	141029	141034	0 %	0 %	0 %	100 %	384430354
3623	NC_017272	TCC	3	9	141084	141092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430354
3624	NC_017272	G	7	7	141101	141107	0 %	0 %	100 %	0 %	384430354
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3993	NC_017272	GCCTAC	2	12	155381	155392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384430371
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3995	NC_017272	GAG	2	6	155471	155476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430371
3996	NC_017272	GCC	2	6	155567	155572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430371
3997	NC_017272	AGA	2	6	155592	155597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430371
3998	NC_017272	GTC	2	6	155624	155629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430371
3999	NC_017272	TCG	2	6	155682	155687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430371
4000	NC_017272	GGA	2	6	155788	155793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430371

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