MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38502	NC_017272	G	6	6	1450577	1450582	0 %	0 %	100 %	0 %	384431677
38503	NC_017272	C	7	7	1450600	1450606	0 %	0 %	0 %	100 %	384431677
38504	NC_017272	CTC	3	9	1450639	1450647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431677
38505	NC_017272	CCT	2	6	1450653	1450658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431677
38506	NC_017272	CTA	2	6	1450671	1450676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431677
38507	NC_017272	GGA	2	6	1450791	1450796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38508	NC_017272	AGG	2	6	1450802	1450807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38509	NC_017272	TCC	2	6	1450883	1450888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431677
38510	NC_017272	TGG	2	6	1450889	1450894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431677
38511	NC_017272	TCA	2	6	1450958	1450963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431677
38512	NC_017272	GTGGGG	2	12	1450996	1451007	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384431677
38513	NC_017272	GCG	2	6	1451008	1451013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431677
38514	NC_017272	GAG	2	6	1451091	1451096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38515	NC_017272	G	6	6	1451112	1451117	0 %	0 %	100 %	0 %	384431677
38516	NC_017272	ACG	2	6	1451123	1451128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431677
38517	NC_017272	CTC	2	6	1451152	1451157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431677
38518	NC_017272	GCC	2	6	1451203	1451208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431677
38519	NC_017272	GGA	2	6	1451343	1451348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38520	NC_017272	CTC	2	6	1451362	1451367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431677
38521	NC_017272	CCT	2	6	1451409	1451414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431677
38522	NC_017272	GCC	2	6	1451422	1451427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431677
38523	NC_017272	CTC	2	6	1451428	1451433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431677
38524	NC_017272	GCC	2	6	1451434	1451439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431677
38525	NC_017272	GGA	2	6	1451450	1451455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38526	NC_017272	GCC	2	6	1451482	1451487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431677
38527	NC_017272	TGA	2	6	1451495	1451500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431677
38528	NC_017272	C	6	6	1451531	1451536	0 %	0 %	0 %	100 %	384431677
38529	NC_017272	GCC	2	6	1451581	1451586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431677
38530	NC_017272	ATG	2	6	1451656	1451661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431677
38531	NC_017272	GGA	2	6	1451670	1451675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38532	NC_017272	GGCGG	2	10	1451727	1451736	0 %	0 %	80 %	20 %	384431677
38533	NC_017272	GCG	2	6	1451737	1451742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431677
38534	NC_017272	GAG	2	6	1451743	1451748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38535	NC_017272	GAC	2	6	1451758	1451763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431677
38536	NC_017272	CGCC	2	8	1451808	1451815	0 %	0 %	25 %	75 %	384431677
38537	NC_017272	ACCT	2	8	1451881	1451888	25 %	25 %	0 %	50 %	384431677
38538	NC_017272	ACG	2	6	1451897	1451902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431677
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38541	NC_017272	GAG	2	6	1451962	1451967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38542	NC_017272	CCT	2	6	1452033	1452038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431677
38543	NC_017272	CCG	2	6	1452056	1452061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431677
38544	NC_017272	GTG	2	6	1452076	1452081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431677
38545	NC_017272	GAG	2	6	1452106	1452111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38546	NC_017272	GAG	2	6	1452118	1452123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431677
38547	NC_017272	C	7	7	1452130	1452136	0 %	0 %	0 %	100 %	384431677
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38549	NC_017272	G	6	6	1452159	1452164	0 %	0 %	100 %	0 %	384431677
38550	NC_017272	GTC	2	6	1452251	1452256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431678
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38554	NC_017272	CGG	2	6	1452375	1452380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431678
38555	NC_017272	TCC	2	6	1452396	1452401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431678
38556	NC_017272	GGT	2	6	1452409	1452414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431678
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38559	NC_017272	GAG	2	6	1452452	1452457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431678
38560	NC_017272	CCA	2	6	1452481	1452486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431678
38561	NC_017272	CTC	2	6	1452509	1452514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431678
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38569	NC_017272	GTA	2	6	1452806	1452811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431678
38570	NC_017272	TCT	2	6	1452817	1452822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431678
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38580	NC_017272	GTA	2	6	1453235	1453240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431678
38581	NC_017272	TCCACG	2	12	1453263	1453274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384431678
38582	NC_017272	CCACCC	2	12	1453282	1453293	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	384431678
38583	NC_017272	CGGG	2	8	1453297	1453304	0 %	0 %	75 %	25 %	384431678
38584	NC_017272	GCG	2	6	1453305	1453310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431678
38585	NC_017272	TGG	2	6	1453410	1453415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38587	NC_017272	TGG	3	9	1453472	1453480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431679
38588	NC_017272	C	6	6	1453504	1453509	0 %	0 %	0 %	100 %	384431679
38589	NC_017272	ACC	2	6	1453531	1453536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431679
38590	NC_017272	GAG	2	6	1453645	1453650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431679
38591	NC_017272	TGG	2	6	1453751	1453756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431679
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38600	NC_017272	GGC	2	6	1453928	1453933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431679
38601	NC_017272	GGA	2	6	1453971	1453976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431679
38602	NC_017272	GGT	2	6	1453983	1453988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431679
38603	NC_017272	CCTCGC	2	12	1454067	1454078	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384431679
38604	NC_017272	GGA	2	6	1454145	1454150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431679
38605	NC_017272	CGC	2	6	1454151	1454156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431679
38606	NC_017272	CCT	2	6	1454223	1454228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431679
38607	NC_017272	GAG	2	6	1454245	1454250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431679
38608	NC_017272	GC	3	6	1454278	1454283	0 %	0 %	50 %	50 %	384431679
38609	NC_017272	TGG	2	6	1454359	1454364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431680
38610	NC_017272	TCC	3	9	1454374	1454382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431680
38611	NC_017272	CCT	3	9	1454390	1454398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431680
38612	NC_017272	CAC	2	6	1454432	1454437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431680
38613	NC_017272	CCT	2	6	1454450	1454455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431680
38614	NC_017272	CTA	2	6	1454480	1454485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431680
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