MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_017272	GGA	2	6	1430410	1430415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431654
38003	NC_017272	CG	3	6	1430418	1430423	0 %	0 %	50 %	50 %	384431654
38004	NC_017272	TGG	2	6	1430437	1430442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431654
38005	NC_017272	CCA	2	6	1430443	1430448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431654
38006	NC_017272	C	7	7	1430510	1430516	0 %	0 %	0 %	100 %	384431654
38007	NC_017272	AGGGC	2	10	1430521	1430530	20 %	0 %	60 %	20 %	384431654
38008	NC_017272	CCA	2	6	1430545	1430550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431654
38009	NC_017272	CCT	2	6	1430557	1430562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431654
38010	NC_017272	CCA	2	6	1430602	1430607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431654
38011	NC_017272	AGG	2	6	1430613	1430618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431654
38012	NC_017272	GAG	2	6	1430675	1430680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431654
38013	NC_017272	CCA	2	6	1430689	1430694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431654
38014	NC_017272	AGA	2	6	1430782	1430787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431654
38015	NC_017272	CCCT	2	8	1430820	1430827	0 %	25 %	0 %	75 %	384431655
38016	NC_017272	AAG	2	6	1430840	1430845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431655
38017	NC_017272	CAC	2	6	1430866	1430871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431655
38018	NC_017272	CTC	2	6	1430878	1430883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431655
38019	NC_017272	CCA	2	6	1430886	1430891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431655
38020	NC_017272	GGTC	2	8	1430907	1430914	0 %	25 %	50 %	25 %	384431655
38021	NC_017272	ACC	2	6	1430921	1430926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431655
38022	NC_017272	GCG	2	6	1431010	1431015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431655
38023	NC_017272	CCAC	2	8	1431042	1431049	25 %	0 %	0 %	75 %	384431655
38024	NC_017272	CTC	2	6	1431112	1431117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431655
38025	NC_017272	AGC	2	6	1431134	1431139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431655
38026	NC_017272	TCCCC	2	10	1431141	1431150	0 %	20 %	0 %	80 %	384431655
38027	NC_017272	CCA	2	6	1431153	1431158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431655
38028	NC_017272	GCGG	2	8	1431193	1431200	0 %	0 %	75 %	25 %	384431655
38029	NC_017272	TCC	2	6	1431203	1431208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431655
38030	NC_017272	TCA	2	6	1431246	1431251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431655
38031	NC_017272	GGAA	2	8	1431297	1431304	50 %	0 %	50 %	0 %	384431656
38032	NC_017272	CCG	2	6	1431313	1431318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431656
38033	NC_017272	CCG	2	6	1431336	1431341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431656
38034	NC_017272	GGA	2	6	1431394	1431399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431656
38035	NC_017272	ACCAG	2	10	1431457	1431466	40 %	0 %	20 %	40 %	384431656
38036	NC_017272	CGG	2	6	1431514	1431519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431656
38037	NC_017272	GCC	3	9	1431585	1431593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431656
38038	NC_017272	AGG	2	6	1431603	1431608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431656
38039	NC_017272	AGA	2	6	1431610	1431615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431656
38040	NC_017272	GGA	2	6	1431616	1431621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431656
38041	NC_017272	CTCCC	2	10	1431626	1431635	0 %	20 %	0 %	80 %	384431656
38042	NC_017272	TCC	2	6	1431642	1431647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431656
38043	NC_017272	GAG	2	6	1431686	1431691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431656
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38045	NC_017272	GGA	2	6	1431709	1431714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431656
38046	NC_017272	GAA	2	6	1431758	1431763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431656
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38050	NC_017272	GGC	2	6	1431830	1431835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431656
38051	NC_017272	CCA	2	6	1431847	1431852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431656
38052	NC_017272	AGGGC	2	10	1431867	1431876	20 %	0 %	60 %	20 %	384431656
38053	NC_017272	ATC	2	6	1431906	1431911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431656
38054	NC_017272	GCG	2	6	1431912	1431917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431657
38055	NC_017272	GA	3	6	1432091	1432096	50 %	0 %	50 %	0 %	384431657
38056	NC_017272	CCT	2	6	1432107	1432112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431657
38057	NC_017272	GGA	2	6	1432140	1432145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431657
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38059	NC_017272	GTC	2	6	1432213	1432218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431657
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38082	NC_017272	AAGGCC	2	12	1432923	1432934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38089	NC_017272	GCC	2	6	1433139	1433144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38090	NC_017272	CGG	2	6	1433200	1433205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38091	NC_017272	AGG	2	6	1433262	1433267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38094	NC_017272	TCG	2	6	1433310	1433315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38098	NC_017272	AGG	2	6	1433428	1433433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38099	NC_017272	GAG	3	9	1433436	1433444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38103	NC_017272	GGC	2	6	1433502	1433507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38104	NC_017272	ATG	2	6	1433521	1433526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38106	NC_017272	GAG	3	9	1433571	1433579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38108	NC_017272	GAG	2	6	1433604	1433609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38109	NC_017272	GAG	2	6	1433613	1433618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38110	NC_017272	GAA	2	6	1433715	1433720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38111	NC_017272	GAG	3	9	1433721	1433729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38112	NC_017272	AGG	2	6	1433741	1433746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38114	NC_017272	CAC	2	6	1433784	1433789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38115	NC_017272	GAG	2	6	1433799	1433804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38116	NC_017272	GGGGA	2	10	1433811	1433820	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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38118	NC_017272	CCA	3	9	1433947	1433955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431658
38119	NC_017272	CCGGG	2	10	1433983	1433992	0 %	0 %	60 %	40 %	384431658
38120	NC_017272	G	6	6	1434004	1434009	0 %	0 %	100 %	0 %	384431658
38121	NC_017272	GAG	2	6	1434029	1434034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431658
38122	NC_017272	CCT	2	6	1434202	1434207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431658
38123	NC_017272	TCC	2	6	1434240	1434245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431658
38124	NC_017272	CGCC	2	8	1434247	1434254	0 %	0 %	25 %	75 %	384431658
38125	NC_017272	GAC	2	6	1434290	1434295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431658
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38127	NC_017272	G	6	6	1434389	1434394	0 %	0 %	100 %	0 %	384431659
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38147	NC_017272	CCT	2	6	1435328	1435333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431661
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38151	NC_017272	TCC	2	6	1435507	1435512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431661
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38154	NC_017272	GA	3	6	1435630	1435635	50 %	0 %	50 %	0 %	384431661
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38193	NC_017272	TGG	2	6	1437477	1437482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431664
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38211	NC_017272	CTTC	2	8	1438208	1438215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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38225	NC_017272	C	6	6	1438926	1438931	0 %	0 %	0 %	100 %	384431667
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