MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_017272	C	7	7	1355152	1355158	0 %	0 %	0 %	100 %	384431572
36003	NC_017272	G	6	6	1355191	1355196	0 %	0 %	100 %	0 %	384431572
36004	NC_017272	GGACGC	2	12	1355253	1355264	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384431572
36005	NC_017272	GGCG	2	8	1355298	1355305	0 %	0 %	75 %	25 %	384431572
36006	NC_017272	CCG	2	6	1355309	1355314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431572
36007	NC_017272	C	6	6	1355321	1355326	0 %	0 %	0 %	100 %	384431572
36008	NC_017272	GAG	2	6	1355365	1355370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431572
36009	NC_017272	GGC	2	6	1355391	1355396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431572
36010	NC_017272	GCGGA	2	10	1355407	1355416	20 %	0 %	60 %	20 %	384431572
36011	NC_017272	GGT	2	6	1355451	1355456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431572
36012	NC_017272	G	7	7	1355511	1355517	0 %	0 %	100 %	0 %	384431572
36013	NC_017272	CGC	2	6	1355544	1355549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431572
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36015	NC_017272	CTC	2	6	1355650	1355655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431572
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36017	NC_017272	CTC	2	6	1355695	1355700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431572
36018	NC_017272	AGG	2	6	1355702	1355707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431572
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36020	NC_017272	CCCCG	2	10	1355878	1355887	0 %	0 %	20 %	80 %	384431573
36021	NC_017272	CCGGG	2	10	1355956	1355965	0 %	0 %	60 %	40 %	384431573
36022	NC_017272	CCCCT	2	10	1355987	1355996	0 %	20 %	0 %	80 %	384431573
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36029	NC_017272	C	6	6	1356206	1356211	0 %	0 %	0 %	100 %	384431573
36030	NC_017272	C	7	7	1356262	1356268	0 %	0 %	0 %	100 %	384431573
36031	NC_017272	GGA	2	6	1356322	1356327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431573
36032	NC_017272	AAG	2	6	1356346	1356351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431573
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36035	NC_017272	GCCT	2	8	1356437	1356444	0 %	25 %	25 %	50 %	384431573
36036	NC_017272	GC	3	6	1356474	1356479	0 %	0 %	50 %	50 %	384431573
36037	NC_017272	GGC	2	6	1356496	1356501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431573
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36040	NC_017272	GC	4	8	1356539	1356546	0 %	0 %	50 %	50 %	384431573
36041	NC_017272	GGA	2	6	1356550	1356555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431573
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36043	NC_017272	GGT	2	6	1356765	1356770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431574
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36049	NC_017272	G	6	6	1357055	1357060	0 %	0 %	100 %	0 %	384431574
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36057	NC_017272	C	7	7	1357313	1357319	0 %	0 %	0 %	100 %	384431574
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36102	NC_017272	TGG	2	6	1358923	1358928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431578
36103	NC_017272	AAG	2	6	1359006	1359011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431578
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36105	NC_017272	ACT	2	6	1359043	1359048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431578
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36354	NC_017272	TCC	2	6	1368422	1368427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431591
36355	NC_017272	GGGA	2	8	1368443	1368450	25 %	0 %	75 %	0 %	384431591
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36362	NC_017272	CCA	2	6	1368714	1368719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431591
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36373	NC_017272	C	6	6	1369094	1369099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36374	NC_017272	G	6	6	1369103	1369108	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36375	NC_017272	GGCCG	2	10	1369121	1369130	0 %	0 %	60 %	40 %	384431592
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36385	NC_017272	G	7	7	1369544	1369550	0 %	0 %	100 %	0 %	384431592
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36420	NC_017272	ATG	2	6	1370642	1370647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431593
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36460	NC_017272	TGCA	2	8	1372170	1372177	25 %	25 %	25 %	25 %	384431595
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36467	NC_017272	TGC	2	6	1372434	1372439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431595
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