MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_017272	GTG	2	6	1298269	1298274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431512
34503	NC_017272	GAG	2	6	1298290	1298295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431512
34504	NC_017272	CAT	2	6	1298313	1298318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431512
34505	NC_017272	AGC	2	6	1298393	1298398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431512
34506	NC_017272	GGCC	2	8	1298511	1298518	0 %	0 %	50 %	50 %	384431512
34507	NC_017272	CAAGGC	2	12	1298535	1298546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431512
34508	NC_017272	GCC	2	6	1298644	1298649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431512
34509	NC_017272	GCC	2	6	1298656	1298661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431512
34510	NC_017272	AAG	2	6	1298668	1298673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431512
34511	NC_017272	AGG	2	6	1298696	1298701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431512
34512	NC_017272	GAC	2	6	1298746	1298751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431512
34513	NC_017272	ACA	2	6	1298759	1298764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431512
34514	NC_017272	CCGGCA	2	12	1298795	1298806	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384431512
34515	NC_017272	ACA	2	6	1298816	1298821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431512
34516	NC_017272	TCA	2	6	1298825	1298830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431512
34517	NC_017272	GGC	2	6	1298844	1298849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431512
34518	NC_017272	GCCTAA	2	12	1298873	1298884	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34519	NC_017272	AGG	2	6	1298926	1298931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34520	NC_017272	CTT	2	6	1299147	1299152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431513
34521	NC_017272	GTG	2	6	1299165	1299170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431513
34522	NC_017272	TGG	2	6	1299205	1299210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431513
34523	NC_017272	CCG	3	9	1299233	1299241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431513
34524	NC_017272	CAC	2	6	1299245	1299250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431513
34525	NC_017272	CTT	2	6	1299290	1299295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431513
34526	NC_017272	TTC	2	6	1299342	1299347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431513
34527	NC_017272	ACCT	2	8	1299468	1299475	25 %	25 %	0 %	50 %	384431513
34528	NC_017272	ATC	2	6	1299564	1299569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431513
34529	NC_017272	CGG	2	6	1299587	1299592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431513
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34531	NC_017272	G	6	6	1299732	1299737	0 %	0 %	100 %	0 %	384431513
34532	NC_017272	CTT	2	6	1299761	1299766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431513
34533	NC_017272	ACCT	2	8	1299771	1299778	25 %	25 %	0 %	50 %	384431513
34534	NC_017272	GTG	2	6	1299822	1299827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431513
34535	NC_017272	TCCTCA	2	12	1299832	1299843	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384431513
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34537	NC_017272	CCT	2	6	1299872	1299877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431513
34538	NC_017272	TCCT	2	8	1299947	1299954	0 %	50 %	0 %	50 %	384431514
34539	NC_017272	CCTGGG	2	12	1299979	1299990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384431514
34540	NC_017272	GCC	2	6	1300004	1300009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431514
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34545	NC_017272	CGC	2	6	1300267	1300272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431514
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34550	NC_017272	CAC	2	6	1300459	1300464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431514
34551	NC_017272	G	6	6	1300509	1300514	0 %	0 %	100 %	0 %	384431514
34552	NC_017272	GGT	2	6	1300549	1300554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431514
34553	NC_017272	CAA	2	6	1300567	1300572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431514
34554	NC_017272	ACC	2	6	1300578	1300583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431514
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34556	NC_017272	CTT	2	6	1300705	1300710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431514
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34598	NC_017272	G	6	6	1302419	1302424	0 %	0 %	100 %	0 %	384431516
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34601	NC_017272	TGG	2	6	1302517	1302522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431516
34602	NC_017272	AGG	2	6	1302556	1302561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431516
34603	NC_017272	TCC	2	6	1302571	1302576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431516
34604	NC_017272	CGCC	2	8	1302590	1302597	0 %	0 %	25 %	75 %	384431516
34605	NC_017272	CCGGC	2	10	1302655	1302664	0 %	0 %	40 %	60 %	384431516
34606	NC_017272	G	7	7	1302747	1302753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34607	NC_017272	GAA	2	6	1302809	1302814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431517
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34824	NC_017272	GGGCCA	2	12	1311350	1311361	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384431523
34825	NC_017272	CCA	2	6	1311404	1311409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431523
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34832	NC_017272	GGA	2	6	1311560	1311565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431523
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34834	NC_017272	GA	3	6	1311610	1311615	50 %	0 %	50 %	0 %	384431523
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34839	NC_017272	GAG	2	6	1311759	1311764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431523
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34841	NC_017272	GGC	2	6	1311803	1311808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431523
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34843	NC_017272	GCC	2	6	1311824	1311829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431523
34844	NC_017272	AGG	2	6	1311844	1311849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431523
34845	NC_017272	GCG	2	6	1311859	1311864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431523
34846	NC_017272	GAAG	2	8	1311932	1311939	50 %	0 %	50 %	0 %	384431523
34847	NC_017272	GAA	2	6	1311954	1311959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431523
34848	NC_017272	GGC	2	6	1312031	1312036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431523
34849	NC_017272	GACC	2	8	1312054	1312061	25 %	0 %	25 %	50 %	384431523
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34851	NC_017272	GCC	2	6	1312090	1312095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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34970	NC_017272	CCT	2	6	1316445	1316450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431528
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34989	NC_017272	GGT	2	6	1317167	1317172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431529
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34991	NC_017272	C	7	7	1317273	1317279	0 %	0 %	0 %	100 %	384431529
34992	NC_017272	AT	3	6	1317371	1317376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34993	NC_017272	GAG	2	6	1317400	1317405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34994	NC_017272	GA	3	6	1317408	1317413	50 %	0 %	50 %	0 %	384431530
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34999	NC_017272	CTG	2	6	1317512	1317517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431530
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