MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017272	GAG	2	6	115650	115655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430323
3002	NC_017272	TGG	2	6	115678	115683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430323
3003	NC_017272	CCA	2	6	115685	115690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430323
3004	NC_017272	CTC	2	6	115722	115727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430323
3005	NC_017272	GGC	2	6	115782	115787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430323
3006	NC_017272	CCT	2	6	115850	115855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430323
3007	NC_017272	ACC	2	6	115875	115880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430324
3008	NC_017272	ACC	2	6	115887	115892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430324
3009	NC_017272	G	7	7	115911	115917	0 %	0 %	100 %	0 %	384430324
3010	NC_017272	CTC	2	6	115994	115999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430324
3011	NC_017272	GAG	3	9	116015	116023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430324
3012	NC_017272	G	7	7	116023	116029	0 %	0 %	100 %	0 %	384430324
3013	NC_017272	GTG	2	6	116036	116041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430324
3014	NC_017272	GAG	2	6	116048	116053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430324
3015	NC_017272	CAGGGC	2	12	116072	116083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430324
3016	NC_017272	GGGC	2	8	116119	116126	0 %	0 %	75 %	25 %	384430324
3017	NC_017272	AGG	2	6	116136	116141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430324
3018	NC_017272	GTC	2	6	116150	116155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430324
3019	NC_017272	CCA	2	6	116167	116172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430324
3020	NC_017272	CGCTCC	2	12	116184	116195	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384430324
3021	NC_017272	TCC	2	6	116244	116249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430324
3022	NC_017272	CCT	2	6	116263	116268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430324
3023	NC_017272	GGC	2	6	116279	116284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430324
3024	NC_017272	GGA	2	6	116317	116322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430324
3025	NC_017272	GCG	2	6	116324	116329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430324
3026	NC_017272	CCCTC	2	10	116388	116397	0 %	20 %	0 %	80 %	384430324
3027	NC_017272	GAG	2	6	116405	116410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430324
3028	NC_017272	GAG	2	6	116447	116452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430324
3029	NC_017272	GGC	2	6	116453	116458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430324
3030	NC_017272	GCG	2	6	116462	116467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430324
3031	NC_017272	TCC	2	6	116508	116513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430324
3032	NC_017272	ACC	2	6	116526	116531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430324
3033	NC_017272	C	6	6	116621	116626	0 %	0 %	0 %	100 %	384430324
3034	NC_017272	AAGCC	2	10	116684	116693	40 %	0 %	20 %	40 %	384430324
3035	NC_017272	TCC	3	9	116694	116702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430324
3036	NC_017272	C	7	7	116740	116746	0 %	0 %	0 %	100 %	384430324
3037	NC_017272	AGG	3	9	116766	116774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430324
3038	NC_017272	CCA	2	6	116800	116805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430324
3039	NC_017272	CGG	2	6	116819	116824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430324
3040	NC_017272	G	6	6	116823	116828	0 %	0 %	100 %	0 %	384430324
3041	NC_017272	CGG	2	6	116902	116907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430325
3042	NC_017272	AGG	2	6	116926	116931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3043	NC_017272	GAG	4	12	116934	116945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3044	NC_017272	TCC	2	6	117017	117022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430325
3045	NC_017272	CCA	2	6	117053	117058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430325
3046	NC_017272	GCC	2	6	117094	117099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430325
3047	NC_017272	GCCCC	2	10	117125	117134	0 %	0 %	20 %	80 %	384430325
3048	NC_017272	CAGGGC	2	12	117150	117161	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430325
3049	NC_017272	AGG	2	6	117184	117189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3050	NC_017272	GAG	2	6	117225	117230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3051	NC_017272	GAG	2	6	117342	117347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3052	NC_017272	GAG	4	12	117417	117428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3053	NC_017272	GGA	2	6	117497	117502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3054	NC_017272	AGG	2	6	117526	117531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3055	NC_017272	GAA	2	6	117546	117551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430325
3056	NC_017272	GAG	2	6	117561	117566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3057	NC_017272	GCCCC	2	10	117584	117593	0 %	0 %	20 %	80 %	384430325
3058	NC_017272	GGGC	2	8	117596	117603	0 %	0 %	75 %	25 %	384430325
3059	NC_017272	GCC	2	6	117628	117633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430325
3060	NC_017272	CCG	2	6	117727	117732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430325
3061	NC_017272	CG	3	6	117739	117744	0 %	0 %	50 %	50 %	384430325
3062	NC_017272	AGG	2	6	117745	117750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3063	NC_017272	AGG	2	6	117796	117801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3064	NC_017272	AGG	2	6	117817	117822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3065	NC_017272	CGC	2	6	117828	117833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430325
3066	NC_017272	AGG	2	6	117853	117858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3067	NC_017272	AGG	2	6	117904	117909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3068	NC_017272	AGG	2	6	118042	118047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430325
3069	NC_017272	GCTTGG	2	12	118112	118123	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384430326
3070	NC_017272	TCC	2	6	118147	118152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430326
3071	NC_017272	TGT	2	6	118211	118216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430326
3072	NC_017272	TGACGA	2	12	118220	118231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384430326
3073	NC_017272	GAG	3	9	118317	118325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430326
3074	NC_017272	GGC	2	6	118327	118332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430326
3075	NC_017272	CTG	3	9	118365	118373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430326
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3077	NC_017272	CTT	2	6	118401	118406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430326
3078	NC_017272	GGC	2	6	118434	118439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430326
3079	NC_017272	CCA	2	6	118454	118459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430326
3080	NC_017272	TCC	2	6	118465	118470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430326
3081	NC_017272	GGA	2	6	118685	118690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430326
3082	NC_017272	GAT	2	6	118719	118724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430326
3083	NC_017272	CCA	2	6	118811	118816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430326
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3085	NC_017272	AAGGAG	2	12	118937	118948	50 %	0 %	50 %	0 %	384430327
3086	NC_017272	CGC	3	9	118964	118972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430327
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3089	NC_017272	AGG	3	9	119091	119099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430327
3090	NC_017272	G	6	6	119098	119103	0 %	0 %	100 %	0 %	384430327
3091	NC_017272	GCG	2	6	119124	119129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430327
3092	NC_017272	GGC	2	6	119162	119167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430327
3093	NC_017272	CAC	2	6	119171	119176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430327
3094	NC_017272	ACC	2	6	119187	119192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430327
3095	NC_017272	GCC	2	6	119220	119225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430327
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3097	NC_017272	CTC	2	6	119453	119458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430327
3098	NC_017272	GAA	2	6	119495	119500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430327
3099	NC_017272	CCG	2	6	119551	119556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430327
3100	NC_017272	GGGA	2	8	119569	119576	25 %	0 %	75 %	0 %	384430327
3101	NC_017272	CCAG	2	8	119599	119606	25 %	0 %	25 %	50 %	384430327
3102	NC_017272	TCCT	2	8	119627	119634	0 %	50 %	0 %	50 %	384430327
3103	NC_017272	TCG	2	6	119700	119705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430327
3104	NC_017272	GCC	2	6	119817	119822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430327
3105	NC_017272	TCC	2	6	119823	119828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430327
3106	NC_017272	CCG	2	6	119872	119877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430327
3107	NC_017272	CAC	2	6	119921	119926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430327
3108	NC_017272	GAG	3	9	119960	119968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430327
3109	NC_017272	AGG	3	9	119988	119996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430327
3110	NC_017272	GGA	2	6	119998	120003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430327
3111	NC_017272	GAG	2	6	120141	120146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430328
3112	NC_017272	GTA	2	6	120177	120182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430328
3113	NC_017272	GCC	2	6	120214	120219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430328
3114	NC_017272	TGG	2	6	120239	120244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430328
3115	NC_017272	CGG	2	6	120287	120292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430328
3116	NC_017272	GCG	2	6	120331	120336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430328
3117	NC_017272	GAT	2	6	120339	120344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430328
3118	NC_017272	GGC	2	6	120345	120350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430328
3119	NC_017272	GCC	2	6	120367	120372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430328
3120	NC_017272	ACC	2	6	120379	120384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430328
3121	NC_017272	GGC	2	6	120423	120428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430328
3122	NC_017272	CGG	2	6	120464	120469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430328
3123	NC_017272	CCG	2	6	120515	120520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430328
3124	NC_017272	AGG	2	6	120562	120567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430328
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3126	NC_017272	GA	3	6	120577	120582	50 %	0 %	50 %	0 %	384430328
3127	NC_017272	ACC	2	6	120601	120606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430328
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3130	NC_017272	CGG	2	6	120835	120840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430328
3131	NC_017272	GTG	2	6	120886	120891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430328
3132	NC_017272	AGG	2	6	120892	120897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430328
3133	NC_017272	GGA	2	6	120903	120908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430328
3134	NC_017272	GA	3	6	120907	120912	50 %	0 %	50 %	0 %	384430328
3135	NC_017272	AGG	2	6	120916	120921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430328
3136	NC_017272	GAG	2	6	120924	120929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430328
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3139	NC_017272	C	6	6	121012	121017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3140	NC_017272	GAA	2	6	121102	121107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430329
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3144	NC_017272	CCTTGT	2	12	121374	121385	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384430329
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3147	NC_017272	TGGCCT	2	12	121491	121502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430329
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3152	NC_017272	CAGG	2	8	121657	121664	25 %	0 %	50 %	25 %	384430329
3153	NC_017272	CGT	2	6	121704	121709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430329
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3219	NC_017272	GC	3	6	124074	124079	0 %	0 %	50 %	50 %	384430332
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3224	NC_017272	CGCC	2	8	124170	124177	0 %	0 %	25 %	75 %	384430332
3225	NC_017272	GGC	2	6	124184	124189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430332
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3230	NC_017272	GGA	2	6	124362	124367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430332
3231	NC_017272	GGA	2	6	124434	124439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430332
3232	NC_017272	CTC	2	6	124453	124458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430332
3233	NC_017272	GGAG	2	8	124506	124513	25 %	0 %	75 %	0 %	384430332
3234	NC_017272	C	6	6	124543	124548	0 %	0 %	0 %	100 %	384430332
3235	NC_017272	CCT	2	6	124551	124556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430332
3236	NC_017272	GTGGAG	2	12	124606	124617	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384430332
3237	NC_017272	AGA	2	6	124722	124727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430332
3238	NC_017272	TGG	2	6	124748	124753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430332
3239	NC_017272	CGG	2	6	124776	124781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430332
3240	NC_017272	CCA	2	6	124811	124816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430332
3241	NC_017272	GCG	2	6	124837	124842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430332
3242	NC_017272	CGC	2	6	124908	124913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430332
3243	NC_017272	CGGG	2	8	124932	124939	0 %	0 %	75 %	25 %	384430332
3244	NC_017272	TGA	2	6	124991	124996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430332
3245	NC_017272	AGGG	2	8	125050	125057	25 %	0 %	75 %	0 %	384430332
3246	NC_017272	GCGGA	2	10	125059	125068	20 %	0 %	60 %	20 %	384430332
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3353	NC_017272	G	6	6	129634	129639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3354	NC_017272	C	6	6	129650	129655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3355	NC_017272	CTC	2	6	129695	129700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430338
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3362	NC_017272	AAGGCC	2	12	130062	130073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430340
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3368	NC_017272	GAA	2	6	130187	130192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430340
3369	NC_017272	GAG	3	9	130236	130244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430340
3370	NC_017272	GGT	2	6	130262	130267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430340
3371	NC_017272	TCG	2	6	130294	130299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430340
3372	NC_017272	GAA	2	6	130373	130378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430340
3373	NC_017272	CAAGGT	2	12	130490	130501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384430340
3374	NC_017272	GGT	2	6	130553	130558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430340
3375	NC_017272	G	6	6	130590	130595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3376	NC_017272	AGG	2	6	130601	130606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3377	NC_017272	GAA	2	6	130614	130619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430341
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3383	NC_017272	GGC	2	6	130851	130856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430341
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3385	NC_017272	AGA	2	6	130940	130945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430341
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3389	NC_017272	GGT	2	6	131022	131027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430341
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3400	NC_017272	GTG	2	6	131387	131392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430342
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3409	NC_017272	GGC	2	6	131757	131762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3410	NC_017272	GCC	2	6	131768	131773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3411	NC_017272	G	6	6	131797	131802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3412	NC_017272	TGCGG	2	10	131819	131828	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3417	NC_017272	T	8	8	131933	131940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3418	NC_017272	ATC	2	6	132076	132081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430343
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3424	NC_017272	G	7	7	132451	132457	0 %	0 %	100 %	0 %	384430344
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3450	NC_017272	GTG	2	6	133813	133818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430346
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3490	NC_017272	TCCAC	2	10	134974	134983	20 %	20 %	0 %	60 %	384430347
3491	NC_017272	CGCC	2	8	134992	134999	0 %	0 %	25 %	75 %	384430347
3492	NC_017272	CTG	2	6	135110	135115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430347
3493	NC_017272	GGC	2	6	135121	135126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430347
3494	NC_017272	ACC	2	6	135152	135157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3495	NC_017272	TCA	2	6	135202	135207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430348
3496	NC_017272	GGA	2	6	135293	135298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430348
3497	NC_017272	GAG	2	6	135354	135359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430348
3498	NC_017272	GGCG	2	8	135367	135374	0 %	0 %	75 %	25 %	384430348
3499	NC_017272	GGA	2	6	135377	135382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430348
3500	NC_017272	CTC	2	6	135528	135533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430348

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