MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_017272	CTG	2	6	1279317	1279322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431497
34003	NC_017272	CCT	2	6	1279397	1279402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431497
34004	NC_017272	CGG	2	6	1279421	1279426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431497
34005	NC_017272	CTC	2	6	1279443	1279448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431497
34006	NC_017272	CTT	2	6	1279568	1279573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431497
34007	NC_017272	CGGAGG	2	12	1279594	1279605	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384431497
34008	NC_017272	C	6	6	1279677	1279682	0 %	0 %	0 %	100 %	384431497
34009	NC_017272	AGG	2	6	1279750	1279755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431497
34010	NC_017272	GTG	2	6	1279770	1279775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431497
34011	NC_017272	CCT	2	6	1279826	1279831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431497
34012	NC_017272	CTC	3	9	1279839	1279847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431497
34013	NC_017272	GAG	2	6	1279854	1279859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431497
34014	NC_017272	TGG	3	9	1279912	1279920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431497
34015	NC_017272	TCC	2	6	1279960	1279965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431497
34016	NC_017272	AGCCCT	2	12	1280068	1280079	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384431498
34017	NC_017272	CCT	2	6	1280086	1280091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431498
34018	NC_017272	CGG	2	6	1280149	1280154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431498
34019	NC_017272	TCT	2	6	1280157	1280162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431498
34020	NC_017272	TAC	2	6	1280165	1280170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431498
34021	NC_017272	CAA	2	6	1280194	1280199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431498
34022	NC_017272	CGG	2	6	1280233	1280238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431498
34023	NC_017272	CCT	4	12	1280251	1280262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431498
34024	NC_017272	GGACC	2	10	1280266	1280275	20 %	0 %	40 %	40 %	384431498
34025	NC_017272	CTA	2	6	1280293	1280298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431498
34026	NC_017272	GAG	2	6	1280345	1280350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431498
34027	NC_017272	CCT	2	6	1280406	1280411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431498
34028	NC_017272	GGT	2	6	1280449	1280454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431498
34029	NC_017272	CTT	2	6	1280519	1280524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431498
34030	NC_017272	TCC	2	6	1280526	1280531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431498
34031	NC_017272	GCG	2	6	1280534	1280539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431498
34032	NC_017272	CTT	2	6	1280626	1280631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431498
34033	NC_017272	TGGG	2	8	1280633	1280640	0 %	25 %	75 %	0 %	384431498
34034	NC_017272	TGG	2	6	1280661	1280666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431498
34035	NC_017272	CAC	2	6	1280731	1280736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431498
34036	NC_017272	ACA	2	6	1280802	1280807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431498
34037	NC_017272	TCG	2	6	1280844	1280849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431498
34038	NC_017272	GAG	2	6	1280870	1280875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431498
34039	NC_017272	ATG	2	6	1280888	1280893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431498
34040	NC_017272	CCG	2	6	1280928	1280933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431498
34041	NC_017272	TCA	2	6	1281039	1281044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431498
34042	NC_017272	GGA	2	6	1281101	1281106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34043	NC_017272	C	6	6	1281133	1281138	0 %	0 %	0 %	100 %	384431499
34044	NC_017272	TCC	2	6	1281205	1281210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34045	NC_017272	TCC	3	9	1281289	1281297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34046	NC_017272	TGGG	2	8	1281298	1281305	0 %	25 %	75 %	0 %	384431499
34047	NC_017272	TCC	2	6	1281364	1281369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34048	NC_017272	ACC	2	6	1281388	1281393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431499
34049	NC_017272	C	6	6	1281401	1281406	0 %	0 %	0 %	100 %	384431499
34050	NC_017272	CCT	2	6	1281449	1281454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34051	NC_017272	GCC	2	6	1281468	1281473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431499
34052	NC_017272	CTC	2	6	1281483	1281488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34053	NC_017272	CCT	2	6	1281512	1281517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34054	NC_017272	CCT	2	6	1281533	1281538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34055	NC_017272	GAG	2	6	1281567	1281572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431499
34056	NC_017272	TGC	2	6	1281589	1281594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431499
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34060	NC_017272	CTT	3	9	1281692	1281700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431499
34061	NC_017272	CCT	3	9	1281764	1281772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34062	NC_017272	TCA	2	6	1281814	1281819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431499
34063	NC_017272	CGC	2	6	1281872	1281877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431499
34064	NC_017272	GGT	2	6	1281893	1281898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431499
34065	NC_017272	TGGCCC	2	12	1281907	1281918	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431499
34066	NC_017272	TGG	2	6	1281919	1281924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431499
34067	NC_017272	CGGG	2	8	1281944	1281951	0 %	0 %	75 %	25 %	384431499
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34069	NC_017272	TCG	2	6	1282015	1282020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431499
34070	NC_017272	GCGG	2	8	1282046	1282053	0 %	0 %	75 %	25 %	384431499
34071	NC_017272	CGC	2	6	1282070	1282075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431499
34072	NC_017272	TGG	2	6	1282081	1282086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431499
34073	NC_017272	CCG	2	6	1282090	1282095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431499
34074	NC_017272	TCA	2	6	1282108	1282113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431499
34075	NC_017272	TCA	2	6	1282141	1282146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431499
34076	NC_017272	TGG	2	6	1282147	1282152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431499
34077	NC_017272	TCC	2	6	1282156	1282161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34078	NC_017272	CTG	2	6	1282170	1282175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431499
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34082	NC_017272	CAC	2	6	1282217	1282222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431499
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34084	NC_017272	TCC	2	6	1282330	1282335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34085	NC_017272	TCC	2	6	1282339	1282344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34086	NC_017272	CCG	2	6	1282384	1282389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431499
34087	NC_017272	CCT	2	6	1282496	1282501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34088	NC_017272	CCG	2	6	1282522	1282527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431499
34089	NC_017272	CAGC	2	8	1282577	1282584	25 %	0 %	25 %	50 %	384431499
34090	NC_017272	CAG	2	6	1282590	1282595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431499
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34093	NC_017272	CAT	2	6	1282715	1282720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431499
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34097	NC_017272	CAG	2	6	1282773	1282778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431499
34098	NC_017272	GCC	2	6	1282779	1282784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431499
34099	NC_017272	CCAC	2	8	1282792	1282799	25 %	0 %	0 %	75 %	384431499
34100	NC_017272	CTA	2	6	1282811	1282816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431499
34101	NC_017272	CCCG	2	8	1282838	1282845	0 %	0 %	25 %	75 %	384431499
34102	NC_017272	CGC	3	9	1282862	1282870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431499
34103	NC_017272	CGC	2	6	1282910	1282915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431499
34104	NC_017272	TGG	2	6	1282939	1282944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431499
34105	NC_017272	CTT	3	9	1282946	1282954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431499
34106	NC_017272	CCT	2	6	1282955	1282960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
34107	NC_017272	CTC	2	6	1282980	1282985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
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34109	NC_017272	CCGCC	2	10	1283005	1283014	0 %	0 %	20 %	80 %	384431499
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34111	NC_017272	CGG	2	6	1283103	1283108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431499
34112	NC_017272	CTC	3	9	1283151	1283159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
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34114	NC_017272	TCC	2	6	1283194	1283199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431499
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34116	NC_017272	TTC	2	6	1283211	1283216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431499
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34119	NC_017272	AGG	2	6	1283275	1283280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34220	NC_017272	TGC	3	9	1287217	1287225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431503
34221	NC_017272	CGG	2	6	1287269	1287274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431503
34222	NC_017272	GCCGG	2	10	1287282	1287291	0 %	0 %	60 %	40 %	384431503
34223	NC_017272	GCCTC	2	10	1287311	1287320	0 %	20 %	20 %	60 %	384431503
34224	NC_017272	CTA	2	6	1287332	1287337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34225	NC_017272	GC	3	6	1287351	1287356	0 %	0 %	50 %	50 %	384431504
34226	NC_017272	CGG	2	6	1287419	1287424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431504
34227	NC_017272	CGGG	2	8	1287440	1287447	0 %	0 %	75 %	25 %	384431504
34228	NC_017272	GGA	2	6	1287497	1287502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431504
34229	NC_017272	GGC	2	6	1287504	1287509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431504
34230	NC_017272	GGC	2	6	1287537	1287542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431504
34231	NC_017272	CTC	2	6	1287558	1287563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431504
34232	NC_017272	GCCTG	2	10	1287580	1287589	0 %	20 %	40 %	40 %	384431504
34233	NC_017272	GTG	2	6	1287609	1287614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431504
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34353	NC_017272	CCT	2	6	1291430	1291435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431506
34354	NC_017272	GAG	2	6	1291455	1291460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431506
34355	NC_017272	CCT	2	6	1291493	1291498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431506
34356	NC_017272	CGG	2	6	1291499	1291504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431506
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