MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_017272	CAC	2	6	1259889	1259894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431476
33502	NC_017272	CTT	2	6	1259910	1259915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431476
33503	NC_017272	CTTGGT	2	12	1259943	1259954	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384431476
33504	NC_017272	CTC	2	6	1260012	1260017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33505	NC_017272	CG	3	6	1260068	1260073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33506	NC_017272	TGG	2	6	1260081	1260086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431477
33507	NC_017272	CCT	2	6	1260172	1260177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431477
33508	NC_017272	CAG	2	6	1260197	1260202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431477
33509	NC_017272	CGG	2	6	1260259	1260264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431477
33510	NC_017272	AGG	2	6	1260330	1260335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431477
33511	NC_017272	TTC	2	6	1260350	1260355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431477
33512	NC_017272	GCGG	2	8	1260439	1260446	0 %	0 %	75 %	25 %	384431477
33513	NC_017272	GGA	2	6	1260484	1260489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431477
33514	NC_017272	CCT	2	6	1260505	1260510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431477
33515	NC_017272	C	6	6	1260585	1260590	0 %	0 %	0 %	100 %	384431477
33516	NC_017272	CGTCTC	2	12	1260625	1260636	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384431477
33517	NC_017272	GGA	2	6	1260697	1260702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431477
33518	NC_017272	AAG	2	6	1260746	1260751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431477
33519	NC_017272	CGG	2	6	1260775	1260780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431477
33520	NC_017272	AGG	2	6	1260825	1260830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431477
33521	NC_017272	TGG	2	6	1260912	1260917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431477
33522	NC_017272	GCGA	2	8	1260944	1260951	25 %	0 %	50 %	25 %	384431477
33523	NC_017272	CCT	2	6	1261032	1261037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431477
33524	NC_017272	CGG	2	6	1261051	1261056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431477
33525	NC_017272	CAA	2	6	1261108	1261113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431477
33526	NC_017272	GTG	2	6	1261136	1261141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431477
33527	NC_017272	GCC	2	6	1261189	1261194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431477
33528	NC_017272	ACG	2	6	1261335	1261340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431477
33529	NC_017272	GGA	2	6	1261360	1261365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431477
33530	NC_017272	G	6	6	1261394	1261399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33531	NC_017272	C	6	6	1261414	1261419	0 %	0 %	0 %	100 %	384431478
33532	NC_017272	GGT	2	6	1261458	1261463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431478
33533	NC_017272	TTC	2	6	1261471	1261476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431478
33534	NC_017272	TCTTT	2	10	1261486	1261495	0 %	80 %	0 %	20 %	384431478
33535	NC_017272	GGC	2	6	1261499	1261504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431478
33536	NC_017272	C	6	6	1261547	1261552	0 %	0 %	0 %	100 %	384431478
33537	NC_017272	AGG	2	6	1261699	1261704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431478
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33539	NC_017272	GGC	2	6	1261879	1261884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431479
33540	NC_017272	CCT	2	6	1261922	1261927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431479
33541	NC_017272	ATC	2	6	1261939	1261944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431479
33542	NC_017272	CCA	2	6	1261988	1261993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431479
33543	NC_017272	ACC	2	6	1261996	1262001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431479
33544	NC_017272	CTC	2	6	1262016	1262021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431479
33545	NC_017272	CTC	2	6	1262061	1262066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431479
33546	NC_017272	CCG	2	6	1262120	1262125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431479
33547	NC_017272	CCT	2	6	1262213	1262218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431479
33548	NC_017272	GGGGC	2	10	1262253	1262262	0 %	0 %	80 %	20 %	384431479
33549	NC_017272	CCT	3	9	1262300	1262308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431479
33550	NC_017272	GAG	2	6	1262361	1262366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431479
33551	NC_017272	CCA	2	6	1262390	1262395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431479
33552	NC_017272	CCT	2	6	1262417	1262422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431479
33553	NC_017272	CTT	2	6	1262430	1262435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431479
33554	NC_017272	CTT	2	6	1262451	1262456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431479
33555	NC_017272	CCT	2	6	1262498	1262503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431479
33556	NC_017272	CTC	2	6	1262577	1262582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431479
33557	NC_017272	GTC	2	6	1262661	1262666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431479
33558	NC_017272	CCT	2	6	1262699	1262704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431479
33559	NC_017272	GGA	2	6	1262741	1262746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431479
33560	NC_017272	GTA	2	6	1262748	1262753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431479
33561	NC_017272	CCA	2	6	1262798	1262803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431479
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33563	NC_017272	CGC	2	6	1262889	1262894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431479
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33567	NC_017272	TGGAGA	2	12	1263104	1263115	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384431479
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33570	NC_017272	GTA	2	6	1263360	1263365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431479
33571	NC_017272	CTT	2	6	1263387	1263392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431479
33572	NC_017272	CAC	2	6	1263405	1263410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431479
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33584	NC_017272	GTA	2	6	1263678	1263683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431479
33585	NC_017272	GGT	2	6	1263690	1263695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431479
33586	NC_017272	AGA	2	6	1263701	1263706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431479
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33588	NC_017272	A	8	8	1263728	1263735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33589	NC_017272	CGGG	2	8	1263751	1263758	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33590	NC_017272	CTC	2	6	1263819	1263824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431480
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33592	NC_017272	CCA	2	6	1263884	1263889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431480
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33596	NC_017272	CTT	2	6	1264110	1264115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431480
33597	NC_017272	CGATGA	2	12	1264127	1264138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384431480
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33600	NC_017272	TGA	2	6	1264196	1264201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431480
33601	NC_017272	CTC	2	6	1264299	1264304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431480
33602	NC_017272	CAC	2	6	1264329	1264334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431480
33603	NC_017272	CCCT	2	8	1264348	1264355	0 %	25 %	0 %	75 %	384431480
33604	NC_017272	CAC	2	6	1264413	1264418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431480
33605	NC_017272	GGC	2	6	1264443	1264448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431480
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33607	NC_017272	CTT	2	6	1264461	1264466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431480
33608	NC_017272	C	6	6	1264495	1264500	0 %	0 %	0 %	100 %	384431481
33609	NC_017272	CCT	2	6	1264621	1264626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431481
33610	NC_017272	TTC	3	9	1264638	1264646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431481
33611	NC_017272	GAG	2	6	1264691	1264696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431481
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33615	NC_017272	GTC	2	6	1264841	1264846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431481
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