MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_017272	TCT	2	6	1241795	1241800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431457
33002	NC_017272	GGA	2	6	1241826	1241831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431458
33003	NC_017272	GAG	2	6	1241862	1241867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431458
33004	NC_017272	GGGC	2	8	1241924	1241931	0 %	0 %	75 %	25 %	384431458
33005	NC_017272	C	6	6	1241948	1241953	0 %	0 %	0 %	100 %	384431458
33006	NC_017272	TCC	2	6	1241986	1241991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431458
33007	NC_017272	CCA	2	6	1241999	1242004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431458
33008	NC_017272	CAC	2	6	1242054	1242059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431458
33009	NC_017272	CTT	2	6	1242075	1242080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431458
33010	NC_017272	CCT	2	6	1242119	1242124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431458
33011	NC_017272	C	6	6	1242134	1242139	0 %	0 %	0 %	100 %	384431458
33012	NC_017272	GAG	2	6	1242165	1242170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431458
33013	NC_017272	CGG	2	6	1242190	1242195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431458
33014	NC_017272	GGC	2	6	1242198	1242203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431458
33015	NC_017272	GGA	2	6	1242239	1242244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431458
33016	NC_017272	TCC	2	6	1242259	1242264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431458
33017	NC_017272	GGCCTC	2	12	1242291	1242302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431458
33018	NC_017272	GGA	2	6	1242305	1242310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431458
33019	NC_017272	CCT	2	6	1242332	1242337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431458
33020	NC_017272	AGG	2	6	1242400	1242405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33021	NC_017272	GAT	2	6	1242443	1242448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431459
33022	NC_017272	GCAGGA	2	12	1242484	1242495	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384431459
33023	NC_017272	GGC	2	6	1242503	1242508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431459
33024	NC_017272	CGCC	2	8	1242544	1242551	0 %	0 %	25 %	75 %	384431459
33025	NC_017272	AGC	2	6	1242587	1242592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431459
33026	NC_017272	GCC	2	6	1242641	1242646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431459
33027	NC_017272	GCC	3	9	1242651	1242659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431459
33028	NC_017272	TCC	2	6	1242660	1242665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431459
33029	NC_017272	GCC	2	6	1242666	1242671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431459
33030	NC_017272	CTT	2	6	1242716	1242721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431459
33031	NC_017272	CCT	2	6	1242733	1242738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33032	NC_017272	GAA	2	6	1242811	1242816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431460
33033	NC_017272	GTG	2	6	1242860	1242865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431460
33034	NC_017272	AGG	3	9	1242866	1242874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33035	NC_017272	CCA	2	6	1242897	1242902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431460
33036	NC_017272	GAG	2	6	1242910	1242915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33037	NC_017272	CAAGCC	2	12	1242924	1242935	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384431460
33038	NC_017272	GAG	2	6	1242964	1242969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33039	NC_017272	CCCG	2	8	1242982	1242989	0 %	0 %	25 %	75 %	384431460
33040	NC_017272	AGCC	2	8	1243127	1243134	25 %	0 %	25 %	50 %	384431460
33041	NC_017272	AGG	2	6	1243155	1243160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33042	NC_017272	GCC	2	6	1243186	1243191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431460
33043	NC_017272	ACCCC	2	10	1243197	1243206	20 %	0 %	0 %	80 %	384431460
33044	NC_017272	AGGCC	2	10	1243257	1243266	20 %	0 %	40 %	40 %	384431460
33045	NC_017272	GAA	2	6	1243267	1243272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431460
33046	NC_017272	ACC	2	6	1243280	1243285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431460
33047	NC_017272	GAG	2	6	1243300	1243305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33048	NC_017272	GAG	2	6	1243309	1243314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33049	NC_017272	GAA	2	6	1243414	1243419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431460
33050	NC_017272	ACC	2	6	1243442	1243447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431460
33051	NC_017272	AGA	2	6	1243452	1243457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431460
33052	NC_017272	GCTTGA	2	12	1243500	1243511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384431460
33053	NC_017272	CCA	2	6	1243572	1243577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431460
33054	NC_017272	AGA	2	6	1243581	1243586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431460
33055	NC_017272	ATC	2	6	1243613	1243618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431460
33056	NC_017272	GAA	2	6	1243633	1243638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431460
33057	NC_017272	ACC	2	6	1243646	1243651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431460
33058	NC_017272	G	6	6	1243724	1243729	0 %	0 %	100 %	0 %	384431460
33059	NC_017272	GTG	2	6	1243762	1243767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431460
33060	NC_017272	CCT	2	6	1243821	1243826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431460
33061	NC_017272	AGG	2	6	1243862	1243867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33062	NC_017272	CGAAGC	2	12	1243869	1243880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431460
33063	NC_017272	CTC	2	6	1243894	1243899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431460
33064	NC_017272	GCC	2	6	1244018	1244023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431460
33065	NC_017272	CCCG	2	8	1244105	1244112	0 %	0 %	25 %	75 %	384431460
33066	NC_017272	GCC	2	6	1244120	1244125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431460
33067	NC_017272	CCT	2	6	1244139	1244144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431460
33068	NC_017272	ACC	3	9	1244153	1244161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431460
33069	NC_017272	GCC	2	6	1244165	1244170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431460
33070	NC_017272	CCCG	2	8	1244173	1244180	0 %	0 %	25 %	75 %	384431460
33071	NC_017272	AGG	2	6	1244198	1244203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33072	NC_017272	TCC	2	6	1244210	1244215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431460
33073	NC_017272	CCT	2	6	1244232	1244237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431460
33074	NC_017272	CCA	2	6	1244238	1244243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431460
33075	NC_017272	GAG	2	6	1244263	1244268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33076	NC_017272	GGA	2	6	1244283	1244288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431460
33077	NC_017272	GCG	2	6	1244318	1244323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431460
33078	NC_017272	CTC	3	9	1244365	1244373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431460
33079	NC_017272	GCC	2	6	1244438	1244443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431460
33080	NC_017272	GT	3	6	1244501	1244506	0 %	50 %	50 %	0 %	384431460
33081	NC_017272	CCG	2	6	1244514	1244519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431460
33082	NC_017272	CCGC	2	8	1244544	1244551	0 %	0 %	25 %	75 %	384431460
33083	NC_017272	ACC	2	6	1244609	1244614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431460
33084	NC_017272	CTG	2	6	1244620	1244625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431460
33085	NC_017272	GGCCC	2	10	1244647	1244656	0 %	0 %	40 %	60 %	384431460
33086	NC_017272	CCT	2	6	1244705	1244710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431461
33087	NC_017272	GGCCTC	2	12	1244769	1244780	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431461
33088	NC_017272	GAG	2	6	1244802	1244807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431461
33089	NC_017272	CCGC	2	8	1244819	1244826	0 %	0 %	25 %	75 %	384431461
33090	NC_017272	GGCCTT	2	12	1244853	1244864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431461
33091	NC_017272	GGCCTC	2	12	1244865	1244876	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431461
33092	NC_017272	GGCCTC	2	12	1244892	1244903	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431461
33093	NC_017272	CTC	2	6	1244919	1244924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431461
33094	NC_017272	CCT	2	6	1244927	1244932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431461
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33096	NC_017272	GCT	2	6	1244960	1244965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431461
33097	NC_017272	CCG	2	6	1245046	1245051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33098	NC_017272	GCGCG	2	10	1245136	1245145	0 %	0 %	60 %	40 %	384431462
33099	NC_017272	CTT	2	6	1245147	1245152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431462
33100	NC_017272	GCG	2	6	1245230	1245235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431462
33101	NC_017272	CCTCGC	2	12	1245239	1245250	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384431462
33102	NC_017272	GGA	2	6	1245305	1245310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431462
33103	NC_017272	GGC	2	6	1245317	1245322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431462
33104	NC_017272	TCC	2	6	1245367	1245372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431462
33105	NC_017272	GGC	2	6	1245387	1245392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431462
33106	NC_017272	CCT	2	6	1245419	1245424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431462
33107	NC_017272	GTG	2	6	1245435	1245440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431462
33108	NC_017272	ACT	2	6	1245442	1245447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431462
33109	NC_017272	CCT	2	6	1245494	1245499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431462
33110	NC_017272	ACG	2	6	1245553	1245558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431462
33111	NC_017272	CTC	2	6	1245603	1245608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431462
33112	NC_017272	TGG	2	6	1245658	1245663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431462
33113	NC_017272	AGA	2	6	1245679	1245684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431462
33114	NC_017272	G	7	7	1245770	1245776	0 %	0 %	100 %	0 %	384431462
33115	NC_017272	GGT	2	6	1245809	1245814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431462
33116	NC_017272	CTC	2	6	1245824	1245829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431462
33117	NC_017272	GAG	2	6	1245852	1245857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431462
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33352	NC_017272	CCT	2	6	1254436	1254441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431470
33353	NC_017272	CCT	2	6	1254493	1254498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431470
33354	NC_017272	CCT	2	6	1254580	1254585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431470
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