MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32003	NC_017272	CAC	2	6	1206032	1206037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431428
32004	NC_017272	GGC	2	6	1206065	1206070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431428
32005	NC_017272	GGT	4	12	1206083	1206094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431428
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32012	NC_017272	C	6	6	1206393	1206398	0 %	0 %	0 %	100 %	384431429
32013	NC_017272	GC	4	8	1206424	1206431	0 %	0 %	50 %	50 %	384431429
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32015	NC_017272	TGG	2	6	1206522	1206527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32232	NC_017272	CGT	2	6	1214025	1214030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431435
32233	NC_017272	GCT	2	6	1214043	1214048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431435
32234	NC_017272	TCC	2	6	1214069	1214074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431435
32235	NC_017272	GTC	2	6	1214134	1214139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431435
32236	NC_017272	GTC	3	9	1214197	1214205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431435
32237	NC_017272	GCG	2	6	1214278	1214283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431435
32238	NC_017272	GAT	2	6	1214305	1214310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431435
32239	NC_017272	CTC	2	6	1214338	1214343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431435
32240	NC_017272	CTC	2	6	1214356	1214361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431435
32241	NC_017272	CTC	2	6	1214389	1214394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431435
32242	NC_017272	CCT	4	12	1214427	1214438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431435
32243	NC_017272	CCA	2	6	1214445	1214450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431435
32244	NC_017272	TCT	2	6	1214451	1214456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431435
32245	NC_017272	TGA	2	6	1214457	1214462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431435
32246	NC_017272	CCTT	2	8	1214495	1214502	0 %	50 %	0 %	50 %	384431435
32247	NC_017272	AGG	2	6	1214507	1214512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431435
32248	NC_017272	GCG	2	6	1214513	1214518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431435
32249	NC_017272	GCCCC	2	10	1214557	1214566	0 %	0 %	20 %	80 %	384431435
32250	NC_017272	TGG	2	6	1214574	1214579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431435
32251	NC_017272	CCGCC	2	10	1214599	1214608	0 %	0 %	20 %	80 %	384431435
32252	NC_017272	GTG	2	6	1214635	1214640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431435
32253	NC_017272	TGG	2	6	1214657	1214662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431435
32254	NC_017272	GGA	2	6	1214676	1214681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431435
32255	NC_017272	CCGC	2	8	1214697	1214704	0 %	0 %	25 %	75 %	384431435
32256	NC_017272	CGG	2	6	1214740	1214745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431435
32257	NC_017272	GGGC	2	8	1214787	1214794	0 %	0 %	75 %	25 %	384431435
32258	NC_017272	CTG	2	6	1214833	1214838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431435
32259	NC_017272	TCC	2	6	1214993	1214998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431435
32260	NC_017272	TGG	2	6	1215072	1215077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431435
32261	NC_017272	CAC	2	6	1215079	1215084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431435
32262	NC_017272	GCCC	2	8	1215148	1215155	0 %	0 %	25 %	75 %	384431435
32263	NC_017272	GAA	2	6	1215172	1215177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431435
32264	NC_017272	TGG	2	6	1215192	1215197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431435
32265	NC_017272	CCT	2	6	1215231	1215236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431435
32266	NC_017272	TGG	2	6	1215251	1215256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431435
32267	NC_017272	GCG	2	6	1215271	1215276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431435
32268	NC_017272	GGC	2	6	1215288	1215293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431435
32269	NC_017272	GAT	2	6	1215310	1215315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431435
32270	NC_017272	GTCCCG	2	12	1215340	1215351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431435
32271	NC_017272	GAG	2	6	1215436	1215441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431435
32272	NC_017272	TTC	2	6	1215488	1215493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431435
32273	NC_017272	CGG	2	6	1215540	1215545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431435
32274	NC_017272	CTT	2	6	1215562	1215567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431435
32275	NC_017272	GTA	2	6	1215586	1215591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431435
32276	NC_017272	GAT	2	6	1215622	1215627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431435
32277	NC_017272	G	6	6	1215630	1215635	0 %	0 %	100 %	0 %	384431435
32278	NC_017272	ATG	2	6	1215674	1215679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431435
32279	NC_017272	GGT	2	6	1215693	1215698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431435
32280	NC_017272	GGA	2	6	1215705	1215710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431435
32281	NC_017272	TGT	2	6	1215735	1215740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431435
32282	NC_017272	CTC	2	6	1215811	1215816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431435
32283	NC_017272	CCA	2	6	1215972	1215977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431435
32284	NC_017272	GGA	2	6	1216023	1216028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431435
32285	NC_017272	CCG	2	6	1216034	1216039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431435
32286	NC_017272	GAG	2	6	1216114	1216119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431435
32287	NC_017272	GGC	3	9	1216168	1216176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431435
32288	NC_017272	CCA	2	6	1216224	1216229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431435
32289	NC_017272	GTA	2	6	1216237	1216242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431435
32290	NC_017272	GTT	2	6	1216261	1216266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431435
32291	NC_017272	ACC	2	6	1216340	1216345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32292	NC_017272	CCT	2	6	1216443	1216448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431436
32293	NC_017272	GCG	2	6	1216510	1216515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431436
32294	NC_017272	GGC	2	6	1216519	1216524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431436
32295	NC_017272	GGA	2	6	1216565	1216570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431436
32296	NC_017272	CCT	2	6	1216590	1216595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431436
32297	NC_017272	CGC	2	6	1216621	1216626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431436
32298	NC_017272	C	7	7	1216629	1216635	0 %	0 %	0 %	100 %	384431436
32299	NC_017272	GAG	2	6	1216642	1216647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431436
32300	NC_017272	CGC	2	6	1216669	1216674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431436
32301	NC_017272	ACC	2	6	1216682	1216687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431436
32302	NC_017272	GCC	2	6	1216706	1216711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431436
32303	NC_017272	GGC	2	6	1216732	1216737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431436
32304	NC_017272	CCA	2	6	1216755	1216760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431436
32305	NC_017272	CCT	2	6	1216806	1216811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431436
32306	NC_017272	CCT	2	6	1216842	1216847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431436
32307	NC_017272	CCG	2	6	1216854	1216859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431436
32308	NC_017272	C	6	6	1216879	1216884	0 %	0 %	0 %	100 %	384431436
32309	NC_017272	GCCGAG	2	12	1216891	1216902	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384431436
32310	NC_017272	GCG	2	6	1216934	1216939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431436
32311	NC_017272	GAG	2	6	1216957	1216962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431436
32312	NC_017272	GGTG	2	8	1216995	1217002	0 %	25 %	75 %	0 %	384431436
32313	NC_017272	C	7	7	1217005	1217011	0 %	0 %	0 %	100 %	384431436
32314	NC_017272	G	7	7	1217032	1217038	0 %	0 %	100 %	0 %	384431436
32315	NC_017272	GGC	3	9	1217056	1217064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431436
32316	NC_017272	TGG	2	6	1217081	1217086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431436
32317	NC_017272	AGGCC	2	10	1217115	1217124	20 %	0 %	40 %	40 %	384431436
32318	NC_017272	GAG	2	6	1217146	1217151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431436
32319	NC_017272	GGC	2	6	1217179	1217184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431436
32320	NC_017272	AGGTCC	2	12	1217189	1217200	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384431436
32321	NC_017272	GCCT	2	8	1217212	1217219	0 %	25 %	25 %	50 %	384431436
32322	NC_017272	GAG	2	6	1217239	1217244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431436
32323	NC_017272	CAC	2	6	1217284	1217289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431436
32324	NC_017272	GCC	2	6	1217290	1217295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431436
32325	NC_017272	CCA	2	6	1217325	1217330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431436
32326	NC_017272	CAC	3	9	1217335	1217343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431436
32327	NC_017272	GTC	2	6	1217374	1217379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431436
32328	NC_017272	AGG	2	6	1217382	1217387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431436
32329	NC_017272	CTC	2	6	1217454	1217459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431437
32330	NC_017272	TCC	2	6	1217467	1217472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431437
32331	NC_017272	CCT	2	6	1217483	1217488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431437
32332	NC_017272	GGGC	2	8	1217547	1217554	0 %	0 %	75 %	25 %	384431437
32333	NC_017272	CTT	2	6	1217586	1217591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431437
32334	NC_017272	TCC	3	9	1217593	1217601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431437
32335	NC_017272	C	8	8	1217636	1217643	0 %	0 %	0 %	100 %	384431437
32336	NC_017272	TGG	3	9	1217665	1217673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431437
32337	NC_017272	GGAA	2	8	1217699	1217706	50 %	0 %	50 %	0 %	384431437
32338	NC_017272	TCC	2	6	1217740	1217745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431437
32339	NC_017272	GCCCC	2	10	1217809	1217818	0 %	0 %	20 %	80 %	384431437
32340	NC_017272	CTC	2	6	1217841	1217846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431437
32341	NC_017272	GGC	2	6	1217882	1217887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431437
32342	NC_017272	GAG	2	6	1217900	1217905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431437
32343	NC_017272	ACGG	2	8	1217934	1217941	25 %	0 %	50 %	25 %	384431437
32344	NC_017272	C	6	6	1217942	1217947	0 %	0 %	0 %	100 %	384431437
32345	NC_017272	C	6	6	1217949	1217954	0 %	0 %	0 %	100 %	384431437
32346	NC_017272	CGTGGG	2	12	1217969	1217980	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384431437
32347	NC_017272	GTGGCG	2	12	1218006	1218017	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384431437
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32349	NC_017272	CCT	2	6	1218056	1218061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431437
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32468	NC_017272	GGC	2	6	1221758	1221763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431441
32469	NC_017272	CCT	2	6	1221800	1221805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431441
32470	NC_017272	GAG	2	6	1221822	1221827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431441
32471	NC_017272	CGGCAA	2	12	1221860	1221871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431441
32472	NC_017272	GGC	2	6	1221890	1221895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431441
32473	NC_017272	GGA	2	6	1221952	1221957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431442
32474	NC_017272	GGA	2	6	1221964	1221969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431442
32475	NC_017272	CGC	2	6	1221985	1221990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431442
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32483	NC_017272	GAG	2	6	1222292	1222297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431442
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32489	NC_017272	GCCTG	2	10	1222391	1222400	0 %	20 %	40 %	40 %	384431443
32490	NC_017272	CTC	2	6	1222408	1222413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431443
32491	NC_017272	TCT	2	6	1222454	1222459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431443
32492	NC_017272	GAG	2	6	1222534	1222539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431443
32493	NC_017272	CCGGGC	2	12	1222548	1222559	0 %	0 %	50 %	50 %	384431443
32494	NC_017272	G	8	8	1222562	1222569	0 %	0 %	100 %	0 %	384431443
32495	NC_017272	TCT	2	6	1222604	1222609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431443
32496	NC_017272	GAG	2	6	1222620	1222625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431443
32497	NC_017272	GCC	3	9	1222654	1222662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431443
32498	NC_017272	CCGGG	2	10	1222695	1222704	0 %	0 %	60 %	40 %	384431443
32499	NC_017272	C	6	6	1222773	1222778	0 %	0 %	0 %	100 %	384431443
32500	NC_017272	CGC	2	6	1222809	1222814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431443

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