MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_017272	CAC	2	6	1185791	1185796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431405
31503	NC_017272	ACC	2	6	1185813	1185818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431405
31504	NC_017272	ACC	2	6	1185828	1185833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431405
31505	NC_017272	CGC	2	6	1185851	1185856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431405
31506	NC_017272	GCC	2	6	1185882	1185887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431405
31507	NC_017272	CAG	2	6	1185894	1185899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431405
31508	NC_017272	AGC	2	6	1185913	1185918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431405
31509	NC_017272	G	6	6	1185929	1185934	0 %	0 %	100 %	0 %	384431405
31510	NC_017272	GCT	2	6	1185943	1185948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431405
31511	NC_017272	CAA	2	6	1186007	1186012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431405
31512	NC_017272	GGT	2	6	1186037	1186042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431405
31513	NC_017272	CGGG	2	8	1186141	1186148	0 %	0 %	75 %	25 %	384431405
31514	NC_017272	CAA	2	6	1186232	1186237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431405
31515	NC_017272	CCA	2	6	1186255	1186260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431405
31516	NC_017272	GGGGT	2	10	1186264	1186273	0 %	20 %	80 %	0 %	384431405
31517	NC_017272	GTG	2	6	1186278	1186283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431405
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31520	NC_017272	GTGG	2	8	1186455	1186462	0 %	25 %	75 %	0 %	384431405
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31526	NC_017272	CCTG	2	8	1186681	1186688	0 %	25 %	25 %	50 %	384431405
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31529	NC_017272	ACA	2	6	1186810	1186815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431405
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31540	NC_017272	GCGG	2	8	1187154	1187161	0 %	0 %	75 %	25 %	384431405
31541	NC_017272	GTG	2	6	1187172	1187177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431405
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31549	NC_017272	G	6	6	1187490	1187495	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31550	NC_017272	AGG	2	6	1187536	1187541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31551	NC_017272	AAGG	2	8	1187561	1187568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31552	NC_017272	CG	3	6	1187621	1187626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31553	NC_017272	GAA	2	6	1187657	1187662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31554	NC_017272	CAT	2	6	1187716	1187721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431406
31555	NC_017272	CGG	2	6	1187784	1187789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431406
31556	NC_017272	ACC	2	6	1187984	1187989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431406
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31559	NC_017272	TCC	2	6	1188096	1188101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31560	NC_017272	G	6	6	1188112	1188117	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31561	NC_017272	TCC	2	6	1188203	1188208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31562	NC_017272	GCG	2	6	1188244	1188249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31563	NC_017272	GGA	3	9	1188286	1188294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31564	NC_017272	CCT	2	6	1188307	1188312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31565	NC_017272	TCC	2	6	1188321	1188326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31569	NC_017272	GGA	2	6	1188618	1188623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431407
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31591	NC_017272	C	6	6	1189580	1189585	0 %	0 %	0 %	100 %	384431408
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31593	NC_017272	TCCCC	2	10	1189650	1189659	0 %	20 %	0 %	80 %	384431408
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31595	NC_017272	C	6	6	1189752	1189757	0 %	0 %	0 %	100 %	384431409
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31601	NC_017272	GGC	2	6	1190020	1190025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431409
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31603	NC_017272	AGA	3	9	1190123	1190131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31604	NC_017272	CCCTCG	2	12	1190137	1190148	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31605	NC_017272	AGC	2	6	1190174	1190179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31606	NC_017272	AGGCA	2	10	1190285	1190294	40 %	0 %	40 %	20 %	384431410
31607	NC_017272	AGCC	2	8	1190330	1190337	25 %	0 %	25 %	50 %	384431410
31608	NC_017272	C	6	6	1190340	1190345	0 %	0 %	0 %	100 %	384431410
31609	NC_017272	CCA	2	6	1190382	1190387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431410
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31614	NC_017272	GTA	2	6	1190548	1190553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431410
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31854	NC_017272	GGC	2	6	1200738	1200743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431422
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31862	NC_017272	CCA	3	9	1201022	1201030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431422
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31939	NC_017272	GGT	2	6	1203914	1203919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431425
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31942	NC_017272	G	6	6	1203995	1204000	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31943	NC_017272	GAG	2	6	1204057	1204062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431426
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31952	NC_017272	CGATGG	2	12	1204425	1204436	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384431426
31953	NC_017272	GAG	2	6	1204549	1204554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431426
31954	NC_017272	GAG	2	6	1204576	1204581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431426
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31959	NC_017272	GAG	2	6	1204693	1204698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431426
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31963	NC_017272	AGGCC	2	10	1204902	1204911	20 %	0 %	40 %	40 %	384431426
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31965	NC_017272	GAG	2	6	1204951	1204956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431426
31966	NC_017272	AAGCCC	2	12	1204957	1204968	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384431426
31967	NC_017272	AGG	2	6	1204991	1204996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431426
31968	NC_017272	GCG	2	6	1205009	1205014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431426
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