MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_017272	GCC	2	6	1166266	1166271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431382
31002	NC_017272	C	6	6	1166276	1166281	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31003	NC_017272	GCC	2	6	1166329	1166334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431383
31004	NC_017272	TCG	2	6	1166401	1166406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431383
31005	NC_017272	TGC	2	6	1166429	1166434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431383
31006	NC_017272	TCA	2	6	1166440	1166445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431383
31007	NC_017272	GTA	2	6	1166475	1166480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431383
31008	NC_017272	GGC	2	6	1166529	1166534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431383
31009	NC_017272	GAA	2	6	1166566	1166571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431383
31010	NC_017272	GAA	2	6	1166625	1166630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431383
31011	NC_017272	GCC	2	6	1166679	1166684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431383
31012	NC_017272	CCT	2	6	1166747	1166752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431383
31013	NC_017272	GTA	2	6	1166767	1166772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431383
31014	NC_017272	TGG	2	6	1166810	1166815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431383
31015	NC_017272	ACCCC	2	10	1166819	1166828	20 %	0 %	0 %	80 %	384431383
31016	NC_017272	CCA	2	6	1166870	1166875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431383
31017	NC_017272	GCC	2	6	1166895	1166900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431383
31018	NC_017272	GCC	2	6	1166968	1166973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31019	NC_017272	CTT	2	6	1166982	1166987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31020	NC_017272	CCTT	2	8	1166999	1167006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31021	NC_017272	CTC	2	6	1167023	1167028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31022	NC_017272	GTG	2	6	1167064	1167069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431384
31023	NC_017272	TCCCCT	2	12	1167121	1167132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431384
31024	NC_017272	CCA	2	6	1167149	1167154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431384
31025	NC_017272	GGCCC	2	10	1167180	1167189	0 %	0 %	40 %	60 %	384431384
31026	NC_017272	CCT	2	6	1167191	1167196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431384
31027	NC_017272	GAA	2	6	1167209	1167214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431384
31028	NC_017272	GGC	2	6	1167294	1167299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431384
31029	NC_017272	TCC	2	6	1167305	1167310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431384
31030	NC_017272	CGC	2	6	1167372	1167377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431384
31031	NC_017272	CGCCT	2	10	1167379	1167388	0 %	20 %	20 %	60 %	384431384
31032	NC_017272	CCT	3	9	1167386	1167394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431384
31033	NC_017272	GCC	2	6	1167400	1167405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431384
31034	NC_017272	CAC	2	6	1167408	1167413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431384
31035	NC_017272	CAC	2	6	1167417	1167422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431384
31036	NC_017272	TGG	2	6	1167431	1167436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431384
31037	NC_017272	AAG	2	6	1167499	1167504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431384
31038	NC_017272	GAG	2	6	1167543	1167548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431384
31039	NC_017272	TGG	2	6	1167560	1167565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431384
31040	NC_017272	CCA	2	6	1167605	1167610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431384
31041	NC_017272	CGC	2	6	1167613	1167618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431384
31042	NC_017272	CCT	2	6	1167635	1167640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431384
31043	NC_017272	TGG	2	6	1167677	1167682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431384
31044	NC_017272	ATC	2	6	1167697	1167702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431384
31045	NC_017272	GTG	2	6	1167775	1167780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431384
31046	NC_017272	CCT	2	6	1167896	1167901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431384
31047	NC_017272	GGC	2	6	1167924	1167929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431384
31048	NC_017272	GTC	2	6	1167948	1167953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431384
31049	NC_017272	CAC	3	9	1167999	1168007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431384
31050	NC_017272	TGGA	2	8	1168051	1168058	25 %	25 %	50 %	0 %	384431384
31051	NC_017272	GCC	2	6	1168066	1168071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431384
31052	NC_017272	GGC	2	6	1168083	1168088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431384
31053	NC_017272	CCCG	2	8	1168156	1168163	0 %	0 %	25 %	75 %	384431384
31054	NC_017272	CCT	2	6	1168210	1168215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431385
31055	NC_017272	TGAGGT	2	12	1168249	1168260	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384431385
31056	NC_017272	CTGC	2	8	1168267	1168274	0 %	25 %	25 %	50 %	384431385
31057	NC_017272	GCG	2	6	1168305	1168310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431385
31058	NC_017272	TCCTC	2	10	1168330	1168339	0 %	40 %	0 %	60 %	384431385
31059	NC_017272	CCA	2	6	1168402	1168407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431385
31060	NC_017272	CTC	2	6	1168421	1168426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431385
31061	NC_017272	CCT	2	6	1168459	1168464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431385
31062	NC_017272	CGG	2	6	1168492	1168497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431385
31063	NC_017272	TGA	2	6	1168498	1168503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431385
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31065	NC_017272	CGC	2	6	1168581	1168586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431385
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31067	NC_017272	GGTG	2	8	1168636	1168643	0 %	25 %	75 %	0 %	384431385
31068	NC_017272	C	6	6	1168644	1168649	0 %	0 %	0 %	100 %	384431385
31069	NC_017272	CCCGC	2	10	1168705	1168714	0 %	0 %	20 %	80 %	384431385
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31078	NC_017272	CCT	2	6	1169062	1169067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431385
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31092	NC_017272	CTCC	2	8	1169670	1169677	0 %	25 %	0 %	75 %	384431386
31093	NC_017272	C	6	6	1169688	1169693	0 %	0 %	0 %	100 %	384431386
31094	NC_017272	GGGAAG	2	12	1169698	1169709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431386
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31102	NC_017272	GGC	2	6	1170029	1170034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431387
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31107	NC_017272	C	6	6	1170209	1170214	0 %	0 %	0 %	100 %	384431387
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31113	NC_017272	C	7	7	1170446	1170452	0 %	0 %	0 %	100 %	384431387
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31118	NC_017272	C	6	6	1170541	1170546	0 %	0 %	0 %	100 %	384431387
31119	NC_017272	C	6	6	1170654	1170659	0 %	0 %	0 %	100 %	384431387
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31133	NC_017272	CGT	2	6	1171349	1171354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431388
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31200	NC_017272	GGA	2	6	1173788	1173793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431391
31201	NC_017272	C	7	7	1173810	1173816	0 %	0 %	0 %	100 %	384431391
31202	NC_017272	GGA	2	6	1173818	1173823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431391
31203	NC_017272	AGG	2	6	1173853	1173858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431391
31204	NC_017272	GGA	2	6	1173914	1173919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31210	NC_017272	CTT	2	6	1174210	1174215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431392
31211	NC_017272	ACC	2	6	1174218	1174223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431392
31212	NC_017272	GCC	2	6	1174226	1174231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431392
31213	NC_017272	CCG	2	6	1174236	1174241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431392
31214	NC_017272	TCG	2	6	1174263	1174268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431392
31215	NC_017272	TCC	2	6	1174269	1174274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431392
31216	NC_017272	CTC	2	6	1174280	1174285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431392
31217	NC_017272	TTC	2	6	1174286	1174291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431392
31218	NC_017272	TCC	3	9	1174368	1174376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431392
31219	NC_017272	ACC	2	6	1174394	1174399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431392
31220	NC_017272	CTC	2	6	1174403	1174408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431392
31221	NC_017272	CCA	2	6	1174428	1174433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431392
31222	NC_017272	GGA	2	6	1174438	1174443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431392
31223	NC_017272	TCT	2	6	1174446	1174451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431392
31224	NC_017272	TCC	2	6	1174452	1174457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431392
31225	NC_017272	C	6	6	1174485	1174490	0 %	0 %	0 %	100 %	384431392
31226	NC_017272	CTC	2	6	1174526	1174531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431392
31227	NC_017272	CGC	2	6	1174561	1174566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431392
31228	NC_017272	CCT	2	6	1174567	1174572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431392
31229	NC_017272	AGG	2	6	1174581	1174586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431392
31230	NC_017272	CTC	2	6	1174616	1174621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431392
31231	NC_017272	TCC	2	6	1174638	1174643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431392
31232	NC_017272	GCTT	2	8	1174650	1174657	0 %	50 %	25 %	25 %	384431392
31233	NC_017272	GGC	2	6	1174659	1174664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431392
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31235	NC_017272	G	6	6	1174783	1174788	0 %	0 %	100 %	0 %	384431393
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31454	NC_017272	CGGG	2	8	1183308	1183315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31455	NC_017272	CCT	2	6	1183370	1183375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31461	NC_017272	GAG	2	6	1183710	1183715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431401
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31464	NC_017272	CAG	2	6	1183890	1183895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431401
31465	NC_017272	C	6	6	1183917	1183922	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31466	NC_017272	CTC	2	6	1184005	1184010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431402
31467	NC_017272	TCC	2	6	1184012	1184017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431402
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31469	NC_017272	CTCCG	2	10	1184059	1184068	0 %	20 %	20 %	60 %	384431402
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31471	NC_017272	CCG	2	6	1184139	1184144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431402
31472	NC_017272	CGG	2	6	1184174	1184179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431402
31473	NC_017272	CGG	2	6	1184184	1184189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431402
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