MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017272	C	6	6	59449	59454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1502	NC_017272	C	6	6	59461	59466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1503	NC_017272	CCA	2	6	59565	59570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430271
1504	NC_017272	GGA	2	6	59652	59657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430271
1505	NC_017272	AAG	2	6	59763	59768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430272
1506	NC_017272	CTC	2	6	59802	59807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430272
1507	NC_017272	CCAC	2	8	59855	59862	25 %	0 %	0 %	75 %	384430272
1508	NC_017272	GC	3	6	59902	59907	0 %	0 %	50 %	50 %	384430272
1509	NC_017272	GGGC	2	8	59956	59963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_017272	GGT	2	6	60038	60043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017272	CCA	2	6	60070	60075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_017272	GGA	3	9	60104	60112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017272	GGGT	2	8	60120	60127	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017272	C	6	6	60216	60221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1515	NC_017272	G	6	6	60232	60237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017272	TGG	2	6	60257	60262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017272	GCC	2	6	60327	60332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_017272	GTG	2	6	60334	60339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017272	CTTGG	2	10	60409	60418	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1520	NC_017272	CGC	2	6	60599	60604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430273
1521	NC_017272	AGG	2	6	60635	60640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430273
1522	NC_017272	TCC	2	6	60671	60676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430273
1523	NC_017272	GAA	2	6	60685	60690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430273
1524	NC_017272	C	6	6	60766	60771	0 %	0 %	0 %	100 %	384430273
1525	NC_017272	AGG	2	6	60816	60821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430273
1526	NC_017272	G	6	6	60833	60838	0 %	0 %	100 %	0 %	384430273
1527	NC_017272	TAG	2	6	60839	60844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430273
1528	NC_017272	GGT	2	6	60867	60872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430273
1529	NC_017272	AGA	2	6	60873	60878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430273
1530	NC_017272	GTC	2	6	60886	60891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430273
1531	NC_017272	CTC	2	6	60901	60906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430273
1532	NC_017272	CGT	2	6	60927	60932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430273
1533	NC_017272	ACC	2	6	60950	60955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430273
1534	NC_017272	GTA	2	6	61009	61014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430273
1535	NC_017272	CG	3	6	61028	61033	0 %	0 %	50 %	50 %	384430273
1536	NC_017272	GGA	3	9	61092	61100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430273
1537	NC_017272	CTC	2	6	61114	61119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430273
1538	NC_017272	GAG	2	6	61129	61134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430273
1539	NC_017272	GTA	2	6	61135	61140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430273
1540	NC_017272	G	6	6	61170	61175	0 %	0 %	100 %	0 %	384430273
1541	NC_017272	GAA	2	6	61207	61212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430273
1542	NC_017272	CCA	3	9	61224	61232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430273
1543	NC_017272	TCCCT	2	10	61242	61251	0 %	40 %	0 %	60 %	384430273
1544	NC_017272	C	6	6	61265	61270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1545	NC_017272	G	6	6	61279	61284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017272	AGA	2	6	61313	61318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430274
1547	NC_017272	CCAG	2	8	61331	61338	25 %	0 %	25 %	50 %	384430274
1548	NC_017272	CCA	2	6	61346	61351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430274
1549	NC_017272	GGC	2	6	61368	61373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430274
1550	NC_017272	CAC	2	6	61455	61460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430274
1551	NC_017272	GAA	2	6	61488	61493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430274
1552	NC_017272	GCC	2	6	61495	61500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430274
1553	NC_017272	GAA	2	6	61566	61571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430274
1554	NC_017272	GAT	2	6	61584	61589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430274
1555	NC_017272	TGA	2	6	61592	61597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430274
1556	NC_017272	GTG	2	6	61641	61646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430274
1557	NC_017272	AGG	2	6	61664	61669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430274
1558	NC_017272	AGG	2	6	61678	61683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430274
1559	NC_017272	GAG	2	6	61692	61697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430274
1560	NC_017272	CCG	2	6	61733	61738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430274
1561	NC_017272	GAGGTA	2	12	61752	61763	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384430274
1562	NC_017272	CCATCC	2	12	61814	61825	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384430274
1563	NC_017272	GTG	2	6	61851	61856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430274
1564	NC_017272	TCC	2	6	61879	61884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430274
1565	NC_017272	GCC	2	6	61957	61962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430274
1566	NC_017272	GAA	2	6	61971	61976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430274
1567	NC_017272	GCC	2	6	61990	61995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430274
1568	NC_017272	CTT	3	9	62067	62075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430274
1569	NC_017272	GAGGC	2	10	62144	62153	20 %	0 %	60 %	20 %	384430274
1570	NC_017272	CGGAG	2	10	62207	62216	20 %	0 %	60 %	20 %	384430274
1571	NC_017272	TGT	2	6	62228	62233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430274
1572	NC_017272	GCCCAG	2	12	62250	62261	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384430274
1573	NC_017272	GTA	2	6	62328	62333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430274
1574	NC_017272	GAAG	2	8	62372	62379	50 %	0 %	50 %	0 %	384430274
1575	NC_017272	TCG	2	6	62431	62436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430274
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1577	NC_017272	GTA	2	6	62466	62471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430274
1578	NC_017272	CCA	2	6	62528	62533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430274
1579	NC_017272	C	6	6	62596	62601	0 %	0 %	0 %	100 %	384430274
1580	NC_017272	AGG	2	6	62602	62607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430274
1581	NC_017272	G	6	6	62639	62644	0 %	0 %	100 %	0 %	384430274
1582	NC_017272	GAT	2	6	62679	62684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430274
1583	NC_017272	GAA	2	6	62727	62732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430274
1584	NC_017272	TGG	2	6	62779	62784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430274
1585	NC_017272	GAG	2	6	62904	62909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430274
1586	NC_017272	GTGGG	2	10	62923	62932	0 %	20 %	80 %	0 %	384430274
1587	NC_017272	AGA	2	6	62942	62947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430274
1588	NC_017272	CTG	2	6	62949	62954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430274
1589	NC_017272	GAG	2	6	63024	63029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430274
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1591	NC_017272	TGG	2	6	63146	63151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430274
1592	NC_017272	AGG	2	6	63172	63177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430274
1593	NC_017272	AGG	2	6	63193	63198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430274
1594	NC_017272	GCC	2	6	63202	63207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430274
1595	NC_017272	GTA	2	6	63249	63254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430274
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1597	NC_017272	CAC	2	6	63393	63398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430274
1598	NC_017272	GAT	2	6	63429	63434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430274
1599	NC_017272	GAA	3	9	63435	63443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430274
1600	NC_017272	TGG	2	6	63449	63454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430274
1601	NC_017272	GTT	2	6	63504	63509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430274
1602	NC_017272	GAG	2	6	63534	63539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430274
1603	NC_017272	GCGAAG	2	12	63559	63570	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430274
1604	NC_017272	GGCCGT	2	12	63573	63584	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430274
1605	NC_017272	TCT	2	6	63599	63604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430274
1606	NC_017272	GTG	2	6	63616	63621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430274
1607	NC_017272	GC	3	6	63747	63752	0 %	0 %	50 %	50 %	384430275
1608	NC_017272	TCC	2	6	63766	63771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430275
1609	NC_017272	GCCC	2	8	63870	63877	0 %	0 %	25 %	75 %	384430275
1610	NC_017272	G	6	6	63927	63932	0 %	0 %	100 %	0 %	384430275
1611	NC_017272	GGCA	2	8	63953	63960	25 %	0 %	50 %	25 %	384430275
1612	NC_017272	CTG	2	6	63969	63974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430275
1613	NC_017272	CTG	2	6	63981	63986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430275
1614	NC_017272	TCG	2	6	63994	63999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430275
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1617	NC_017272	GTA	2	6	64122	64127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430275
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1621	NC_017272	ACC	2	6	64447	64452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430275
1622	NC_017272	TCC	2	6	64486	64491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430275
1623	NC_017272	CCA	3	9	64544	64552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430275
1624	NC_017272	AGGA	2	8	64561	64568	50 %	0 %	50 %	0 %	384430275
1625	NC_017272	GAA	2	6	64569	64574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430275
1626	NC_017272	CCT	2	6	64601	64606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430275
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1628	NC_017272	GGGT	2	8	64624	64631	0 %	25 %	75 %	0 %	384430275
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