MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_017272	CCT	2	6	658275	658280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430883
17502	NC_017272	AGG	2	6	658315	658320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430883
17503	NC_017272	CTTCC	2	10	658324	658333	0 %	40 %	0 %	60 %	384430883
17504	NC_017272	GGA	2	6	658340	658345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430883
17505	NC_017272	GGA	2	6	658361	658366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430883
17506	NC_017272	GGT	2	6	658368	658373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430883
17507	NC_017272	GCCC	2	8	658377	658384	0 %	0 %	25 %	75 %	384430883
17508	NC_017272	GAG	2	6	658395	658400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430883
17509	NC_017272	CTTCCA	2	12	658418	658429	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384430883
17510	NC_017272	CCT	2	6	658543	658548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430884
17511	NC_017272	TCT	2	6	658567	658572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430884
17512	NC_017272	ACC	3	9	658587	658595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430884
17513	NC_017272	TCC	2	6	658666	658671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430884
17514	NC_017272	ATC	2	6	658674	658679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430884
17515	NC_017272	CCT	2	6	658687	658692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430884
17516	NC_017272	CCT	2	6	658696	658701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430884
17517	NC_017272	AGG	2	6	658734	658739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430884
17518	NC_017272	GAG	2	6	658790	658795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430884
17519	NC_017272	GGCCTC	2	12	658865	658876	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430884
17520	NC_017272	AGG	2	6	658917	658922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430884
17521	NC_017272	GGCCC	2	10	658967	658976	0 %	0 %	40 %	60 %	384430884
17522	NC_017272	GGTG	2	8	658984	658991	0 %	25 %	75 %	0 %	384430884
17523	NC_017272	G	7	7	659000	659006	0 %	0 %	100 %	0 %	384430884
17524	NC_017272	GGTG	2	8	659008	659015	0 %	25 %	75 %	0 %	384430884
17525	NC_017272	AGG	3	9	659028	659036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430884
17526	NC_017272	GGA	2	6	659056	659061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430884
17527	NC_017272	GAG	2	6	659078	659083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430884
17528	NC_017272	CTC	2	6	659132	659137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430884
17529	NC_017272	AGG	2	6	659230	659235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17530	NC_017272	GAG	2	6	659238	659243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17531	NC_017272	CGAGGA	2	12	659267	659278	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430885
17532	NC_017272	ACC	2	6	659290	659295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430885
17533	NC_017272	ACC	2	6	659347	659352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430885
17534	NC_017272	AGG	2	6	659359	659364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17535	NC_017272	GTG	2	6	659374	659379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430885
17536	NC_017272	CCG	2	6	659479	659484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430885
17537	NC_017272	CCA	2	6	659495	659500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430885
17538	NC_017272	GAG	2	6	659520	659525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17539	NC_017272	CAC	2	6	659535	659540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430885
17540	NC_017272	GGC	2	6	659583	659588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430885
17541	NC_017272	AGG	3	9	659641	659649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17542	NC_017272	GTA	2	6	659664	659669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430885
17543	NC_017272	C	6	6	659724	659729	0 %	0 %	0 %	100 %	384430885
17544	NC_017272	TGGCGA	2	12	659783	659794	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430885
17545	NC_017272	AGG	3	9	659830	659838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17546	NC_017272	GAG	2	6	659853	659858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17547	NC_017272	CAGGGC	2	12	659865	659876	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430885
17548	NC_017272	GAA	2	6	659931	659936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430885
17549	NC_017272	CCA	2	6	659972	659977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430885
17550	NC_017272	GAGGGC	2	12	659988	659999	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384430885
17551	NC_017272	AGG	2	6	660007	660012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17552	NC_017272	GAA	2	6	660059	660064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430885
17553	NC_017272	GAG	2	6	660069	660074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17554	NC_017272	AGG	3	9	660082	660090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430885
17555	NC_017272	C	6	6	660101	660106	0 %	0 %	0 %	100 %	384430885
17556	NC_017272	TCC	2	6	660115	660120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430886
17557	NC_017272	GGCCC	2	10	660122	660131	0 %	0 %	40 %	60 %	384430886
17558	NC_017272	GAA	2	6	660155	660160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430886
17559	NC_017272	CCA	2	6	660169	660174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430886
17560	NC_017272	GGCCAG	2	12	660215	660226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430886
17561	NC_017272	GGC	2	6	660371	660376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430886
17562	NC_017272	GAG	2	6	660392	660397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430886
17563	NC_017272	CCGCCT	2	12	660403	660414	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384430886
17564	NC_017272	CCGCA	2	10	660458	660467	20 %	0 %	20 %	60 %	384430886
17565	NC_017272	GGC	2	6	660475	660480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430886
17566	NC_017272	GGAGAA	2	12	660499	660510	50 %	0 %	50 %	0 %	384430886
17567	NC_017272	GAG	2	6	660524	660529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430886
17568	NC_017272	GAA	2	6	660557	660562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430886
17569	NC_017272	GCC	2	6	660582	660587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430886
17570	NC_017272	CCA	2	6	660601	660606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430886
17571	NC_017272	AGG	3	9	660627	660635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430886
17572	NC_017272	GAG	2	6	660671	660676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430886
17573	NC_017272	GC	3	6	660733	660738	0 %	0 %	50 %	50 %	384430886
17574	NC_017272	CCA	2	6	660739	660744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430886
17575	NC_017272	GGC	2	6	660749	660754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430886
17576	NC_017272	GAG	2	6	660776	660781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430886
17577	NC_017272	CGC	2	6	660790	660795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430886
17578	NC_017272	AGG	2	6	660807	660812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430886
17579	NC_017272	CAC	2	6	660869	660874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430886
17580	NC_017272	CCA	2	6	660901	660906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430886
17581	NC_017272	G	6	6	660977	660982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17582	NC_017272	GTA	2	6	660998	661003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430887
17583	NC_017272	GCC	2	6	661150	661155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430887
17584	NC_017272	CGCT	2	8	661220	661227	0 %	25 %	25 %	50 %	384430887
17585	NC_017272	GCCAGG	2	12	661233	661244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430887
17586	NC_017272	CTC	2	6	661280	661285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430887
17587	NC_017272	GCG	2	6	661325	661330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430887
17588	NC_017272	CAC	2	6	661373	661378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430887
17589	NC_017272	AGG	2	6	661417	661422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430887
17590	NC_017272	GCG	2	6	661473	661478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430887
17591	NC_017272	CGT	2	6	661495	661500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430887
17592	NC_017272	GCT	2	6	661618	661623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430887
17593	NC_017272	CGG	2	6	661642	661647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430887
17594	NC_017272	CTT	2	6	661682	661687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430887
17595	NC_017272	GAA	2	6	661715	661720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430887
17596	NC_017272	GCG	2	6	661728	661733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430887
17597	NC_017272	GGT	2	6	661756	661761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430887
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17599	NC_017272	CCA	2	6	661798	661803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430887
17600	NC_017272	CGC	2	6	661811	661816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430887
17601	NC_017272	CGT	2	6	661966	661971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430887
17602	NC_017272	CCA	3	9	661972	661980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430887
17603	NC_017272	C	6	6	662001	662006	0 %	0 %	0 %	100 %	384430887
17604	NC_017272	TCG	2	6	662016	662021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430887
17605	NC_017272	GCG	2	6	662022	662027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430887
17606	NC_017272	GCC	2	6	662046	662051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430887
17607	NC_017272	GGA	2	6	662083	662088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430887
17608	NC_017272	CCT	2	6	662171	662176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17609	NC_017272	TTC	2	6	662177	662182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17610	NC_017272	CAC	2	6	662217	662222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430888
17611	NC_017272	TCCCGC	2	12	662299	662310	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384430888
17612	NC_017272	TGGCGG	2	12	662324	662335	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384430888
17613	NC_017272	AGGT	2	8	662350	662357	25 %	25 %	50 %	0 %	384430888
17614	NC_017272	CCA	2	6	662444	662449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430888
17615	NC_017272	TCC	2	6	662465	662470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430888
17616	NC_017272	C	6	6	662469	662474	0 %	0 %	0 %	100 %	384430888
17617	NC_017272	TG	3	6	662572	662577	0 %	50 %	50 %	0 %	384430888
17618	NC_017272	CCT	2	6	662617	662622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430889
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17983	NC_017272	CCT	2	6	675946	675951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17984	NC_017272	TAT	2	6	675997	676002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17985	NC_017272	CCGG	2	8	676064	676071	0 %	0 %	50 %	50 %	384430900
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17991	NC_017272	TGG	3	9	676411	676419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430900
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