MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16509	NC_017272	G	6	6	622998	623003	0 %	0 %	100 %	0 %	384430842
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16744	NC_017272	GAG	2	6	631196	631201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430853
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16746	NC_017272	CTTGGG	2	12	631263	631274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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16873	NC_017272	GGA	3	9	635720	635728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430858
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16875	NC_017272	CTC	2	6	635763	635768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430858
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16894	NC_017272	CGG	2	6	636225	636230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430859
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16904	NC_017272	GAG	2	6	636580	636585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430859
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16913	NC_017272	CCGG	2	8	637034	637041	0 %	0 %	50 %	50 %	384430860
16914	NC_017272	GGTC	2	8	637042	637049	0 %	25 %	50 %	25 %	384430860
16915	NC_017272	GAG	3	9	637217	637225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430860
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16928	NC_017272	CGG	2	6	637623	637628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430861
16929	NC_017272	GGA	2	6	637629	637634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430861
16930	NC_017272	GTC	2	6	637654	637659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430861
16931	NC_017272	TGA	2	6	637737	637742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430861
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16946	NC_017272	GAG	2	6	638379	638384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430862
16947	NC_017272	GTCCC	2	10	638395	638404	0 %	20 %	20 %	60 %	384430862
16948	NC_017272	G	7	7	638414	638420	0 %	0 %	100 %	0 %	384430862
16949	NC_017272	GCGG	2	8	638442	638449	0 %	0 %	75 %	25 %	384430862
16950	NC_017272	GAG	2	6	638526	638531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430862
16951	NC_017272	GGT	2	6	638550	638555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430862
16952	NC_017272	GGT	2	6	638594	638599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430862
16953	NC_017272	CGGGGA	2	12	638609	638620	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384430862
16954	NC_017272	AGG	2	6	638647	638652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430862
16955	NC_017272	G	6	6	638651	638656	0 %	0 %	100 %	0 %	384430862
16956	NC_017272	CTC	2	6	638688	638693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430862
16957	NC_017272	CCT	2	6	638729	638734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16958	NC_017272	CCT	2	6	638817	638822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430863
16959	NC_017272	G	6	6	638828	638833	0 %	0 %	100 %	0 %	384430863
16960	NC_017272	CCT	2	6	638835	638840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430863
16961	NC_017272	GGA	2	6	638850	638855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430863
16962	NC_017272	AGG	2	6	638865	638870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430863
16963	NC_017272	TCC	2	6	638921	638926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430863
16964	NC_017272	TCC	2	6	638979	638984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430863
16965	NC_017272	CCA	2	6	638985	638990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430863
16966	NC_017272	GCC	2	6	639025	639030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430863
16967	NC_017272	AGG	3	9	639032	639040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430863
16968	NC_017272	CCTC	2	8	639054	639061	0 %	25 %	0 %	75 %	384430863
16969	NC_017272	TC	3	6	639060	639065	0 %	50 %	0 %	50 %	384430863
16970	NC_017272	GCG	2	6	639188	639193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430863
16971	NC_017272	AGG	2	6	639281	639286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430863
16972	NC_017272	GAGC	2	8	639303	639310	25 %	0 %	50 %	25 %	384430863
16973	NC_017272	CCCA	2	8	639337	639344	25 %	0 %	0 %	75 %	384430863
16974	NC_017272	CCT	2	6	639348	639353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430863
16975	NC_017272	GGA	3	9	639366	639374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430863
16976	NC_017272	GACGGT	2	12	639475	639486	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430863
16977	NC_017272	CTGCTT	2	12	639499	639510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384430863
16978	NC_017272	GCC	2	6	639525	639530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430863
16979	NC_017272	GGGC	2	8	639568	639575	0 %	0 %	75 %	25 %	384430863
16980	NC_017272	GGGCTC	2	12	639589	639600	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430863
16981	NC_017272	GGGGC	2	10	639603	639612	0 %	0 %	80 %	20 %	384430863
16982	NC_017272	CGC	2	6	639630	639635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430863
16983	NC_017272	CTC	2	6	639661	639666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430863
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16985	NC_017272	CTT	2	6	639700	639705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430863
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