MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017272	CTT	2	6	602058	602063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430819
16003	NC_017272	CTC	2	6	602079	602084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430819
16004	NC_017272	AGG	2	6	602125	602130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16005	NC_017272	CCT	2	6	602141	602146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430819
16006	NC_017272	GAG	2	6	602151	602156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16007	NC_017272	CCGC	2	8	602164	602171	0 %	0 %	25 %	75 %	384430819
16008	NC_017272	CCT	2	6	602174	602179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430819
16009	NC_017272	CAC	2	6	602277	602282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430819
16010	NC_017272	GGA	2	6	602285	602290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16011	NC_017272	CCT	2	6	602291	602296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430819
16012	NC_017272	TCC	2	6	602305	602310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430819
16013	NC_017272	CGGC	2	8	602339	602346	0 %	0 %	50 %	50 %	384430819
16014	NC_017272	GGA	2	6	602384	602389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16015	NC_017272	GGGGC	2	10	602456	602465	0 %	0 %	80 %	20 %	384430819
16016	NC_017272	TGA	2	6	602476	602481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430819
16017	NC_017272	CAA	2	6	602498	602503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430819
16018	NC_017272	AGG	2	6	602548	602553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16019	NC_017272	GAG	2	6	602571	602576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16020	NC_017272	CTT	2	6	602594	602599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430819
16021	NC_017272	CGGGC	2	10	602641	602650	0 %	0 %	60 %	40 %	384430819
16022	NC_017272	GGA	2	6	602683	602688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16023	NC_017272	GC	3	6	602817	602822	0 %	0 %	50 %	50 %	384430819
16024	NC_017272	GGC	2	6	602843	602848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430819
16025	NC_017272	GGA	2	6	602849	602854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16026	NC_017272	CGC	2	6	602862	602867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430819
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16028	NC_017272	AGG	3	9	602884	602892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16029	NC_017272	CTT	2	6	602903	602908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430819
16030	NC_017272	GCC	2	6	602956	602961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430819
16031	NC_017272	CCG	2	6	602969	602974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430819
16032	NC_017272	CTT	2	6	603125	603130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430819
16033	NC_017272	TTC	2	6	603225	603230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430819
16034	NC_017272	CCG	2	6	603233	603238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430819
16035	NC_017272	C	6	6	603292	603297	0 %	0 %	0 %	100 %	384430819
16036	NC_017272	TCC	2	6	603298	603303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430819
16037	NC_017272	CCG	2	6	603386	603391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430819
16038	NC_017272	AGG	2	6	603412	603417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430819
16039	NC_017272	TCTCC	2	10	603440	603449	0 %	40 %	0 %	60 %	384430819
16040	NC_017272	GGC	2	6	603461	603466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430819
16041	NC_017272	CTG	2	6	603495	603500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_017272	GCT	2	6	603524	603529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_017272	TCT	2	6	603566	603571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_017272	T	6	6	603588	603593	0 %	100 %	0 %	0 %	384430820
16045	NC_017272	TTC	2	6	603599	603604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430820
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16049	NC_017272	GTC	2	6	603723	603728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430820
16050	NC_017272	CACCC	2	10	603809	603818	20 %	0 %	0 %	80 %	384430820
16051	NC_017272	CCA	2	6	603850	603855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430820
16052	NC_017272	GCT	2	6	603857	603862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430820
16053	NC_017272	CAC	2	6	603863	603868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430820
16054	NC_017272	GAT	2	6	603887	603892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430820
16055	NC_017272	CCA	2	6	603910	603915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430820
16056	NC_017272	AAG	2	6	603930	603935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430820
16057	NC_017272	C	6	6	603960	603965	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16058	NC_017272	ACCC	2	8	603978	603985	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16059	NC_017272	GGC	2	6	604052	604057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_017272	GGC	2	6	604204	604209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_017272	GCC	2	6	604282	604287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16062	NC_017272	GCC	2	6	604308	604313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16063	NC_017272	ATC	2	6	604365	604370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430821
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16072	NC_017272	CCT	2	6	604582	604587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430822
16073	NC_017272	CCGC	2	8	604633	604640	0 %	0 %	25 %	75 %	384430822
16074	NC_017272	CCG	3	9	604657	604665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430822
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16081	NC_017272	TCC	2	6	604890	604895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430822
16082	NC_017272	GAG	3	9	604907	604915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430822
16083	NC_017272	GGC	2	6	604999	605004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430822
16084	NC_017272	GCGGA	2	10	605031	605040	20 %	0 %	60 %	20 %	384430822
16085	NC_017272	AGGGCC	2	12	605058	605069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430822
16086	NC_017272	GAGG	2	8	605075	605082	25 %	0 %	75 %	0 %	384430822
16087	NC_017272	AGG	2	6	605106	605111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430822
16088	NC_017272	TCC	2	6	605223	605228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430822
16089	NC_017272	C	6	6	605274	605279	0 %	0 %	0 %	100 %	384430822
16090	NC_017272	CGT	2	6	605431	605436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430822
16091	NC_017272	CCG	2	6	605485	605490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430822
16092	NC_017272	G	6	6	605501	605506	0 %	0 %	100 %	0 %	384430822
16093	NC_017272	GGC	2	6	605508	605513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430822
16094	NC_017272	C	6	6	605525	605530	0 %	0 %	0 %	100 %	384430822
16095	NC_017272	GGC	2	6	605531	605536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430822
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16097	NC_017272	CAGC	2	8	605558	605565	25 %	0 %	25 %	50 %	384430822
16098	NC_017272	CCT	2	6	605575	605580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16099	NC_017272	CCT	2	6	605697	605702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430823
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16101	NC_017272	GCC	2	6	605774	605779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430823
16102	NC_017272	GAG	2	6	605836	605841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430823
16103	NC_017272	CTC	2	6	605896	605901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430823
16104	NC_017272	CGG	2	6	605991	605996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430823
16105	NC_017272	ACC	2	6	606044	606049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430823
16106	NC_017272	GAG	2	6	606067	606072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430823
16107	NC_017272	CTCC	2	8	606118	606125	0 %	25 %	0 %	75 %	384430823
16108	NC_017272	CTC	2	6	606163	606168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430823
16109	NC_017272	GCG	2	6	606175	606180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430823
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16112	NC_017272	TTC	2	6	606233	606238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430823
16113	NC_017272	CCTC	2	8	606252	606259	0 %	25 %	0 %	75 %	384430823
16114	NC_017272	GCG	3	9	606268	606276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430823
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16116	NC_017272	C	6	6	606335	606340	0 %	0 %	0 %	100 %	384430823
16117	NC_017272	CCT	3	9	606366	606374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430823
16118	NC_017272	GGC	2	6	606405	606410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430823
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16120	NC_017272	AGGGCC	2	12	606467	606478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430823
16121	NC_017272	TCC	2	6	606482	606487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430823
16122	NC_017272	CTT	2	6	606493	606498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430823
16123	NC_017272	TCC	2	6	606503	606508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430823
16124	NC_017272	TGG	2	6	606591	606596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430823
16125	NC_017272	GGCG	2	8	606627	606634	0 %	0 %	75 %	25 %	384430823
16126	NC_017272	GGC	2	6	606636	606641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430823
16127	NC_017272	G	6	6	606719	606724	0 %	0 %	100 %	0 %	384430823
16128	NC_017272	CTT	2	6	606727	606732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430823
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16132	NC_017272	GGC	2	6	606775	606780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430823
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16151	NC_017272	C	6	6	607659	607664	0 %	0 %	0 %	100 %	384430825
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16154	NC_017272	TCC	2	6	607789	607794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16225	NC_017272	G	6	6	610486	610491	0 %	0 %	100 %	0 %	384430829
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16232	NC_017272	CCT	2	6	610847	610852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430829
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16237	NC_017272	CTC	2	6	611055	611060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430829
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16240	NC_017272	CAA	2	6	611153	611158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430829
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16360	NC_017272	C	7	7	616147	616153	0 %	0 %	0 %	100 %	384430836
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16363	NC_017272	TCC	2	6	616294	616299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430836
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16487	NC_017272	CCG	2	6	622065	622070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430841
16488	NC_017272	ACC	2	6	622077	622082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430841
16489	NC_017272	CCGT	2	8	622101	622108	0 %	25 %	25 %	50 %	384430841
16490	NC_017272	G	7	7	622125	622131	0 %	0 %	100 %	0 %	384430841
16491	NC_017272	CTC	2	6	622214	622219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430841
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