MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017272	GGA	2	6	548145	548150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430770
14502	NC_017272	GGA	2	6	548157	548162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430770
14503	NC_017272	GCC	2	6	548192	548197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430770
14504	NC_017272	GGC	2	6	548315	548320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430771
14505	NC_017272	GTA	2	6	548357	548362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430771
14506	NC_017272	GGC	2	6	548384	548389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430771
14507	NC_017272	GCG	2	6	548412	548417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430771
14508	NC_017272	CGCGGC	2	12	548429	548440	0 %	0 %	50 %	50 %	384430771
14509	NC_017272	AGG	2	6	548499	548504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430771
14510	NC_017272	CGG	2	6	548505	548510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430771
14511	NC_017272	TCG	3	9	548559	548567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430771
14512	NC_017272	GGA	4	12	548578	548589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430771
14513	NC_017272	GGT	2	6	548617	548622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430771
14514	NC_017272	GGC	2	6	548624	548629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430771
14515	NC_017272	CCT	2	6	548650	548655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430771
14516	NC_017272	CCCG	2	8	548664	548671	0 %	0 %	25 %	75 %	384430771
14517	NC_017272	GACGAG	2	12	548678	548689	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430771
14518	NC_017272	TCC	3	9	548691	548699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430771
14519	NC_017272	G	6	6	548708	548713	0 %	0 %	100 %	0 %	384430771
14520	NC_017272	CGG	2	6	548714	548719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430771
14521	NC_017272	GAG	3	9	548720	548728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430771
14522	NC_017272	GCG	2	6	548748	548753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430771
14523	NC_017272	C	6	6	548842	548847	0 %	0 %	0 %	100 %	384430771
14524	NC_017272	GGCG	2	8	548902	548909	0 %	0 %	75 %	25 %	384430771
14525	NC_017272	GTA	2	6	548927	548932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430771
14526	NC_017272	TGG	2	6	548950	548955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430771
14527	NC_017272	C	6	6	548969	548974	0 %	0 %	0 %	100 %	384430771
14528	NC_017272	TCC	2	6	548975	548980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430771
14529	NC_017272	GAG	2	6	548981	548986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430771
14530	NC_017272	GGA	2	6	549001	549006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430771
14531	NC_017272	GGT	2	6	549025	549030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430771
14532	NC_017272	CCA	2	6	549082	549087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430771
14533	NC_017272	GTA	2	6	549161	549166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430771
14534	NC_017272	ACC	2	6	549180	549185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430771
14535	NC_017272	CCT	2	6	549196	549201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430772
14536	NC_017272	GAG	2	6	549238	549243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14537	NC_017272	GAA	2	6	549262	549267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430772
14538	NC_017272	G	6	6	549279	549284	0 %	0 %	100 %	0 %	384430772
14539	NC_017272	AGG	2	6	549327	549332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14540	NC_017272	AGG	2	6	549341	549346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14541	NC_017272	GAG	3	9	549373	549381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14542	NC_017272	CCT	2	6	549411	549416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430772
14543	NC_017272	GGA	2	6	549444	549449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14544	NC_017272	CGT	2	6	549489	549494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430772
14545	NC_017272	AGG	2	6	549506	549511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14546	NC_017272	GAG	4	12	549514	549525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14547	NC_017272	C	7	7	549538	549544	0 %	0 %	0 %	100 %	384430772
14548	NC_017272	GGA	2	6	549573	549578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14549	NC_017272	CCT	2	6	549594	549599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430772
14550	NC_017272	T	7	7	549605	549611	0 %	100 %	0 %	0 %	384430772
14551	NC_017272	GAG	2	6	549631	549636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14552	NC_017272	G	7	7	549636	549642	0 %	0 %	100 %	0 %	384430772
14553	NC_017272	GAG	2	6	549646	549651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14554	NC_017272	CCT	2	6	549693	549698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430772
14555	NC_017272	GCG	2	6	549815	549820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430772
14556	NC_017272	AGG	4	12	549863	549874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14557	NC_017272	CCA	2	6	549879	549884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430772
14558	NC_017272	AAGCCC	2	12	549916	549927	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384430772
14559	NC_017272	GGC	2	6	549946	549951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430772
14560	NC_017272	CTC	2	6	550021	550026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430772
14561	NC_017272	AGG	2	6	550040	550045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14562	NC_017272	GGGGTA	2	12	550060	550071	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384430772
14563	NC_017272	TGG	2	6	550091	550096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430772
14564	NC_017272	GCG	2	6	550109	550114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430772
14565	NC_017272	CCG	2	6	550128	550133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430772
14566	NC_017272	GAG	2	6	550153	550158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14567	NC_017272	ACGGGG	2	12	550247	550258	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384430772
14568	NC_017272	CCT	2	6	550332	550337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430772
14569	NC_017272	GGC	2	6	550365	550370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430772
14570	NC_017272	TGGCCT	2	12	550413	550424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430772
14571	NC_017272	TTC	2	6	550432	550437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430772
14572	NC_017272	AGG	2	6	550529	550534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14573	NC_017272	GAG	2	6	550537	550542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14574	NC_017272	AGG	2	6	550622	550627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
14575	NC_017272	GCC	2	6	550709	550714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430772
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14579	NC_017272	GAG	2	6	550831	550836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430772
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14582	NC_017272	GGCG	2	8	550892	550899	0 %	0 %	75 %	25 %	384430773
14583	NC_017272	GCC	2	6	550941	550946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430773
14584	NC_017272	TGG	2	6	550976	550981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430773
14585	NC_017272	CCA	2	6	551030	551035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430773
14586	NC_017272	TCG	2	6	551095	551100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430773
14587	NC_017272	CAC	2	6	551181	551186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430773
14588	NC_017272	GGGC	2	8	551189	551196	0 %	0 %	75 %	25 %	384430773
14589	NC_017272	TTC	2	6	551207	551212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430773
14590	NC_017272	GGA	2	6	551270	551275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430773
14591	NC_017272	GGT	2	6	551321	551326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430773
14592	NC_017272	CTC	2	6	551346	551351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430773
14593	NC_017272	GTA	2	6	551376	551381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430773
14594	NC_017272	GAG	2	6	551394	551399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430773
14595	NC_017272	GGT	2	6	551442	551447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430773
14596	NC_017272	GC	3	6	551495	551500	0 %	0 %	50 %	50 %	384430773
14597	NC_017272	G	6	6	551524	551529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_017272	GCCCCC	2	12	551532	551543	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
14599	NC_017272	GCC	2	6	551571	551576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430774
14600	NC_017272	GAG	2	6	551645	551650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430774
14601	NC_017272	GAG	2	6	551702	551707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430774
14602	NC_017272	TCTCCG	2	12	551731	551742	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384430774
14603	NC_017272	CCA	2	6	551755	551760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430774
14604	NC_017272	GGA	2	6	551776	551781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430774
14605	NC_017272	TCC	2	6	551787	551792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430774
14606	NC_017272	TCG	2	6	551800	551805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430774
14607	NC_017272	CCT	2	6	551851	551856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430774
14608	NC_017272	CTG	2	6	552047	552052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430774
14609	NC_017272	TCA	2	6	552067	552072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430774
14610	NC_017272	TGG	2	6	552127	552132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430774
14611	NC_017272	GCCC	2	8	552249	552256	0 %	0 %	25 %	75 %	384430774
14612	NC_017272	GCCC	2	8	552277	552284	0 %	0 %	25 %	75 %	384430774
14613	NC_017272	GAG	2	6	552308	552313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430774
14614	NC_017272	GCGG	2	8	552332	552339	0 %	0 %	75 %	25 %	384430774
14615	NC_017272	CCT	2	6	552340	552345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430774
14616	NC_017272	CCG	2	6	552350	552355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430774
14617	NC_017272	G	7	7	552473	552479	0 %	0 %	100 %	0 %	384430774
14618	NC_017272	CGT	2	6	552481	552486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430774
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14620	NC_017272	GTG	2	6	552555	552560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430774
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14738	NC_017272	CCCTCC	2	12	557060	557071	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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14872	NC_017272	AGG	2	6	562026	562031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14873	NC_017272	CAT	2	6	562037	562042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14875	NC_017272	TGG	2	6	562072	562077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14876	NC_017272	TGG	2	6	562114	562119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14877	NC_017272	CTC	2	6	562202	562207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14878	NC_017272	GGC	2	6	562238	562243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14879	NC_017272	CGT	2	6	562258	562263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14880	NC_017272	TCC	2	6	562272	562277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14881	NC_017272	TCCC	2	8	562306	562313	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14882	NC_017272	CGGC	2	8	562356	562363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14883	NC_017272	GGCGAA	2	12	562370	562381	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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14885	NC_017272	GCG	2	6	562404	562409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14886	NC_017272	GCC	2	6	562458	562463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14887	NC_017272	CCT	2	6	562481	562486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14890	NC_017272	G	6	6	562573	562578	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14891	NC_017272	GCT	2	6	562595	562600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14893	NC_017272	AGG	2	6	562678	562683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14894	NC_017272	CCT	2	6	562746	562751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430783
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