MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017272	GGT	2	6	40784	40789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430245
1002	NC_017272	GGA	2	6	40790	40795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430245
1003	NC_017272	GCCCG	2	10	40802	40811	0 %	0 %	40 %	60 %	384430245
1004	NC_017272	GGC	2	6	40813	40818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430245
1005	NC_017272	G	7	7	40835	40841	0 %	0 %	100 %	0 %	384430245
1006	NC_017272	CCT	2	6	40853	40858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430245
1007	NC_017272	GGGCTT	2	12	40875	40886	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384430245
1008	NC_017272	CGCCCT	2	12	40895	40906	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384430245
1009	NC_017272	CAG	2	6	40920	40925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430245
1010	NC_017272	GGT	2	6	40928	40933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430245
1011	NC_017272	AGG	2	6	41026	41031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430245
1012	NC_017272	TGGG	2	8	41049	41056	0 %	25 %	75 %	0 %	384430245
1013	NC_017272	CCT	2	6	41132	41137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430245
1014	NC_017272	GCC	2	6	41232	41237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430245
1015	NC_017272	CTC	2	6	41238	41243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430245
1016	NC_017272	TGGCC	2	10	41251	41260	0 %	20 %	40 %	40 %	384430245
1017	NC_017272	GCCC	2	8	41264	41271	0 %	0 %	25 %	75 %	384430245
1018	NC_017272	TCC	3	9	41275	41283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430245
1019	NC_017272	TGG	2	6	41284	41289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430245
1020	NC_017272	TCC	2	6	41299	41304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430245
1021	NC_017272	G	7	7	41321	41327	0 %	0 %	100 %	0 %	384430245
1022	NC_017272	CTGGG	2	10	41343	41352	0 %	20 %	60 %	20 %	384430245
1023	NC_017272	GGT	2	6	41363	41368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430245
1024	NC_017272	GAG	2	6	41396	41401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430245
1025	NC_017272	GTG	2	6	41462	41467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430246
1026	NC_017272	GTG	2	6	41504	41509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430246
1027	NC_017272	GGCG	2	8	41544	41551	0 %	0 %	75 %	25 %	384430246
1028	NC_017272	GCCCT	2	10	41570	41579	0 %	20 %	20 %	60 %	384430246
1029	NC_017272	GGT	2	6	41596	41601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430246
1030	NC_017272	GTG	2	6	41609	41614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430246
1031	NC_017272	GC	3	6	41633	41638	0 %	0 %	50 %	50 %	384430246
1032	NC_017272	GCC	2	6	41648	41653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430246
1033	NC_017272	CGG	2	6	41723	41728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430246
1034	NC_017272	TCC	2	6	41733	41738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430246
1035	NC_017272	GCC	2	6	41743	41748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430246
1036	NC_017272	GCC	2	6	41765	41770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430246
1037	NC_017272	GCC	2	6	41831	41836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430246
1038	NC_017272	C	6	6	41854	41859	0 %	0 %	0 %	100 %	384430246
1039	NC_017272	CAC	2	6	41971	41976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430246
1040	NC_017272	CCT	2	6	41977	41982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430246
1041	NC_017272	GGC	2	6	41996	42001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430246
1042	NC_017272	G	6	6	42013	42018	0 %	0 %	100 %	0 %	384430246
1043	NC_017272	TGG	2	6	42069	42074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430246
1044	NC_017272	AGG	2	6	42147	42152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430246
1045	NC_017272	CCT	2	6	42166	42171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430246
1046	NC_017272	CGC	2	6	42193	42198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_017272	CGGA	2	8	42267	42274	25 %	0 %	50 %	25 %	384430247
1048	NC_017272	CTC	2	6	42303	42308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430247
1049	NC_017272	TCC	2	6	42310	42315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430247
1050	NC_017272	GGC	2	6	42326	42331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430247
1051	NC_017272	CCT	2	6	42359	42364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430247
1052	NC_017272	TCC	2	6	42367	42372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430247
1053	NC_017272	C	6	6	42391	42396	0 %	0 %	0 %	100 %	384430247
1054	NC_017272	TGG	2	6	42406	42411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430247
1055	NC_017272	CCT	2	6	42422	42427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430247
1056	NC_017272	TGG	2	6	42445	42450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430247
1057	NC_017272	CCT	2	6	42511	42516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430247
1058	NC_017272	CTC	3	9	42522	42530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430247
1059	NC_017272	CGCCCT	2	12	42551	42562	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384430247
1060	NC_017272	CTC	2	6	42573	42578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430247
1061	NC_017272	GCT	2	6	42613	42618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430247
1062	NC_017272	ACCTCC	2	12	42625	42636	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384430247
1063	NC_017272	CCT	2	6	42753	42758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430248
1064	NC_017272	TGG	2	6	42768	42773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430248
1065	NC_017272	CGC	2	6	42832	42837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430248
1066	NC_017272	G	6	6	42861	42866	0 %	0 %	100 %	0 %	384430248
1067	NC_017272	C	6	6	42870	42875	0 %	0 %	0 %	100 %	384430248
1068	NC_017272	ACC	2	6	42896	42901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430248
1069	NC_017272	CCA	2	6	42936	42941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430248
1070	NC_017272	CCA	2	6	42972	42977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430248
1071	NC_017272	CGG	2	6	42984	42989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430248
1072	NC_017272	GGCG	2	8	43002	43009	0 %	0 %	75 %	25 %	384430248
1073	NC_017272	CCT	2	6	43160	43165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430249
1074	NC_017272	GGGCG	2	10	43175	43184	0 %	0 %	80 %	20 %	384430249
1075	NC_017272	G	7	7	43367	43373	0 %	0 %	100 %	0 %	384430249
1076	NC_017272	CAC	2	6	43376	43381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430249
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1081	NC_017272	CTC	2	6	43555	43560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430250
1082	NC_017272	TCC	2	6	43712	43717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430250
1083	NC_017272	GTG	3	9	43738	43746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430250
1084	NC_017272	GGA	2	6	43761	43766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430250
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1089	NC_017272	CCT	2	6	44187	44192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430251
1090	NC_017272	GCCC	2	8	44200	44207	0 %	0 %	25 %	75 %	384430251
1091	NC_017272	GCC	2	6	44224	44229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430251
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1093	NC_017272	ACC	2	6	44254	44259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430251
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1095	NC_017272	GGA	2	6	44271	44276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430251
1096	NC_017272	CCT	2	6	44277	44282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430251
1097	NC_017272	GGA	2	6	44286	44291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430251
1098	NC_017272	CTC	2	6	44296	44301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430251
1099	NC_017272	C	6	6	44328	44333	0 %	0 %	0 %	100 %	384430251
1100	NC_017272	ACC	2	6	44420	44425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430251
1101	NC_017272	G	6	6	44465	44470	0 %	0 %	100 %	0 %	384430251
1102	NC_017272	AGG	2	6	44480	44485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430251
1103	NC_017272	AGG	2	6	44495	44500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430251
1104	NC_017272	GCG	2	6	44530	44535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430251
1105	NC_017272	G	6	6	44563	44568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017272	CCG	2	6	44629	44634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430252
1107	NC_017272	GGA	2	6	44653	44658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430252
1108	NC_017272	GGCCCC	2	12	44701	44712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430252
1109	NC_017272	G	6	6	44773	44778	0 %	0 %	100 %	0 %	384430252
1110	NC_017272	GAA	2	6	44866	44871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430253
1111	NC_017272	CCT	2	6	44877	44882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430253
1112	NC_017272	GGA	2	6	44898	44903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430253
1113	NC_017272	ACC	2	6	44966	44971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430253
1114	NC_017272	GGA	2	6	44997	45002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430253
1115	NC_017272	GGGCGG	2	12	45003	45014	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	384430253
1116	NC_017272	CCT	2	6	45021	45026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430253
1117	NC_017272	CCT	2	6	45034	45039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430253
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1119	NC_017272	GGGC	2	8	45093	45100	0 %	0 %	75 %	25 %	384430253
1120	NC_017272	CCT	2	6	45120	45125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430253
1121	NC_017272	CTT	2	6	45145	45150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430253
1122	NC_017272	GCC	2	6	45194	45199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430253
1123	NC_017272	CCT	2	6	45207	45212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430253
1124	NC_017272	CCT	2	6	45231	45236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430253
1125	NC_017272	CTC	2	6	45256	45261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430253
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1127	NC_017272	GGT	2	6	45273	45278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430253
1128	NC_017272	GCG	2	6	45334	45339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430253
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1134	NC_017272	CCA	2	6	45667	45672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430254
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1207	NC_017272	CCTTAG	2	12	48376	48387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1226	NC_017272	CCGCTA	2	12	49123	49134	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384430258
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1243	NC_017272	ACGTGG	2	12	50105	50116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430260
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1246	NC_017272	G	6	6	50301	50306	0 %	0 %	100 %	0 %	384430260
1247	NC_017272	GGT	2	6	50313	50318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430260
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1250	NC_017272	CCTT	2	8	50531	50538	0 %	50 %	0 %	50 %	384430260
1251	NC_017272	CTT	2	6	50545	50550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430260
1252	NC_017272	GCC	2	6	50551	50556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430260
1253	NC_017272	ACC	2	6	50570	50575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430260
1254	NC_017272	CTT	2	6	50610	50615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430260
1255	NC_017272	CTC	2	6	50647	50652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430260
1256	NC_017272	TGGG	2	8	50653	50660	0 %	25 %	75 %	0 %	384430260
1257	NC_017272	GGCCT	2	10	50734	50743	0 %	20 %	40 %	40 %	384430260
1258	NC_017272	CCT	2	6	50796	50801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430261
1259	NC_017272	TGG	2	6	50813	50818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430261
1260	NC_017272	TCC	2	6	50822	50827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430261
1261	NC_017272	CCT	2	6	50919	50924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430261
1262	NC_017272	CGC	2	6	50958	50963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430261
1263	NC_017272	CTC	3	9	51085	51093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430261
1264	NC_017272	CGC	2	6	51100	51105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430261
1265	NC_017272	GCG	2	6	51114	51119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430261
1266	NC_017272	CTC	2	6	51130	51135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430261
1267	NC_017272	GCG	2	6	51144	51149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430261
1268	NC_017272	GCG	2	6	51176	51181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430261
1269	NC_017272	C	6	6	51239	51244	0 %	0 %	0 %	100 %	384430261
1270	NC_017272	ACG	2	6	51248	51253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430261
1271	NC_017272	G	7	7	51253	51259	0 %	0 %	100 %	0 %	384430261
1272	NC_017272	GGGA	2	8	51269	51276	25 %	0 %	75 %	0 %	384430261
1273	NC_017272	CGC	2	6	51285	51290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430261
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1276	NC_017272	G	7	7	51426	51432	0 %	0 %	100 %	0 %	384430261
1277	NC_017272	GC	3	6	51469	51474	0 %	0 %	50 %	50 %	384430261
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1280	NC_017272	CTC	2	6	51524	51529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430262
1281	NC_017272	GTG	2	6	51572	51577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430262
1282	NC_017272	GCG	2	6	51625	51630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430262
1283	NC_017272	TCC	2	6	51654	51659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430262
1284	NC_017272	TTG	2	6	51683	51688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430262
1285	NC_017272	GGGGC	2	10	51691	51700	0 %	0 %	80 %	20 %	384430262
1286	NC_017272	GGT	2	6	51745	51750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430262
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1289	NC_017272	GGT	2	6	51796	51801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430262
1290	NC_017272	GCCC	2	8	51802	51809	0 %	0 %	25 %	75 %	384430262
1291	NC_017272	GTG	3	9	51818	51826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430262
1292	NC_017272	GCC	2	6	51935	51940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430262
1293	NC_017272	GTG	2	6	52043	52048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430262
1294	NC_017272	AGG	2	6	52074	52079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430262
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1304	NC_017272	GCC	2	6	52444	52449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430263
1305	NC_017272	C	6	6	52448	52453	0 %	0 %	0 %	100 %	384430263
1306	NC_017272	CGA	2	6	52497	52502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430263
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1310	NC_017272	GAG	2	6	52684	52689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430263
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1319	NC_017272	GAG	2	6	53079	53084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430264
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1327	NC_017272	CCT	2	6	53464	53469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430264
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1329	NC_017272	AGG	3	9	53488	53496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430264
1330	NC_017272	CCG	2	6	53534	53539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430264
1331	NC_017272	CTT	2	6	53573	53578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430264
1332	NC_017272	CGG	2	6	53589	53594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430264
1333	NC_017272	GTG	2	6	53643	53648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430264
1334	NC_017272	CCT	5	15	53693	53707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430264
1335	NC_017272	CGC	2	6	53741	53746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430264
1336	NC_017272	AGG	2	6	53804	53809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1337	NC_017272	GGGC	2	8	53841	53848	0 %	0 %	75 %	25 %	384430265
1338	NC_017272	GGA	2	6	53872	53877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430265
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1341	NC_017272	C	7	7	53921	53927	0 %	0 %	0 %	100 %	384430265
1342	NC_017272	TCC	2	6	53928	53933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430265
1343	NC_017272	AGG	2	6	53934	53939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430265
1344	NC_017272	CGG	2	6	53940	53945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430265
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1347	NC_017272	CTT	2	6	53995	54000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430265
1348	NC_017272	GGA	2	6	54010	54015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430265
1349	NC_017272	GGCCC	2	10	54055	54064	0 %	0 %	40 %	60 %	384430265
1350	NC_017272	TCC	3	9	54069	54077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430265
1351	NC_017272	CCG	2	6	54094	54099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430265
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1354	NC_017272	TGG	3	9	54186	54194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430265
1355	NC_017272	AGG	2	6	54225	54230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430265
1356	NC_017272	GAG	2	6	54251	54256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430265
1357	NC_017272	G	7	7	54256	54262	0 %	0 %	100 %	0 %	384430265
1358	NC_017272	TCC	3	9	54264	54272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430265
1359	NC_017272	C	8	8	54301	54308	0 %	0 %	0 %	100 %	384430265
1360	NC_017272	AGG	2	6	54309	54314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430265
1361	NC_017272	TCT	2	6	54411	54416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430265
1362	NC_017272	CTA	2	6	54433	54438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430265
1363	NC_017272	CTC	2	6	54446	54451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430265
1364	NC_017272	GCGG	2	8	54481	54488	0 %	0 %	75 %	25 %	384430265
1365	NC_017272	GGGC	2	8	54491	54498	0 %	0 %	75 %	25 %	384430265
1366	NC_017272	CCGTGG	2	12	54507	54518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430265
1367	NC_017272	CGTGGC	2	12	54544	54555	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430265
1368	NC_017272	GGA	2	6	54568	54573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430265
1369	NC_017272	GGT	2	6	54598	54603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430265
1370	NC_017272	CGC	2	6	54692	54697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430266
1371	NC_017272	GGC	2	6	54722	54727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430266
1372	NC_017272	GCCC	2	8	54755	54762	0 %	0 %	25 %	75 %	384430266
1373	NC_017272	GCC	2	6	54764	54769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430266
1374	NC_017272	CGC	2	6	54773	54778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430266
1375	NC_017272	G	6	6	54781	54786	0 %	0 %	100 %	0 %	384430266
1376	NC_017272	CGC	2	6	54788	54793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430266
1377	NC_017272	TGGG	2	8	54796	54803	0 %	25 %	75 %	0 %	384430266
1378	NC_017272	G	6	6	54801	54806	0 %	0 %	100 %	0 %	384430266
1379	NC_017272	GAG	2	6	54867	54872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430266
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1496	NC_017272	CGGGG	2	10	59250	59259	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1497	NC_017272	AAAG	2	8	59260	59267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_017272	TGG	2	6	59294	59299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_017272	AAC	2	6	59415	59420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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