MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017272	TCC	2	6	529355	529360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430757
14002	NC_017272	CCG	3	9	529367	529375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430757
14003	NC_017272	CGGG	3	12	529396	529407	0 %	0 %	75 %	25 %	384430757
14004	NC_017272	ACG	2	6	529466	529471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430757
14005	NC_017272	GC	3	6	529546	529551	0 %	0 %	50 %	50 %	384430757
14006	NC_017272	CCA	2	6	529724	529729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430757
14007	NC_017272	CAC	2	6	529759	529764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430757
14008	NC_017272	GGA	3	9	529770	529778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430757
14009	NC_017272	CCG	2	6	529815	529820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430757
14010	NC_017272	CGC	2	6	529839	529844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430757
14011	NC_017272	GCG	2	6	529889	529894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_017272	GCC	2	6	529956	529961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430758
14013	NC_017272	GAG	2	6	529979	529984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430758
14014	NC_017272	GGA	2	6	530020	530025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430758
14015	NC_017272	AGG	2	6	530082	530087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430758
14016	NC_017272	GAA	2	6	530092	530097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430758
14017	NC_017272	CCT	2	6	530104	530109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430758
14018	NC_017272	TCG	2	6	530127	530132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430758
14019	NC_017272	CAA	2	6	530146	530151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430758
14020	NC_017272	C	6	6	530163	530168	0 %	0 %	0 %	100 %	384430758
14021	NC_017272	GA	3	6	530229	530234	50 %	0 %	50 %	0 %	384430758
14022	NC_017272	TGG	2	6	530259	530264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430758
14023	NC_017272	GGA	3	9	530305	530313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430758
14024	NC_017272	C	6	6	530381	530386	0 %	0 %	0 %	100 %	384430758
14025	NC_017272	GGT	2	6	530401	530406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430758
14026	NC_017272	CGA	2	6	530479	530484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430758
14027	NC_017272	GGA	2	6	530500	530505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430758
14028	NC_017272	GGGCC	2	10	530527	530536	0 %	0 %	60 %	40 %	384430758
14029	NC_017272	ACC	2	6	530618	530623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430759
14030	NC_017272	G	6	6	530624	530629	0 %	0 %	100 %	0 %	384430759
14031	NC_017272	GGA	3	9	530718	530726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430759
14032	NC_017272	CGCC	2	8	530730	530737	0 %	0 %	25 %	75 %	384430759
14033	NC_017272	AGG	2	6	530741	530746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430759
14034	NC_017272	GCGG	2	8	530763	530770	0 %	0 %	75 %	25 %	384430759
14035	NC_017272	TGG	2	6	530771	530776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430759
14036	NC_017272	CCG	2	6	530777	530782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430759
14037	NC_017272	AGG	2	6	530840	530845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430759
14038	NC_017272	GCC	2	6	530851	530856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430759
14039	NC_017272	CTC	2	6	530866	530871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430759
14040	NC_017272	AGG	2	6	530873	530878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430759
14041	NC_017272	CCT	2	6	531050	531055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430760
14042	NC_017272	G	6	6	531149	531154	0 %	0 %	100 %	0 %	384430760
14043	NC_017272	GAG	3	9	531165	531173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430760
14044	NC_017272	AGG	2	6	531202	531207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430760
14045	NC_017272	GGC	2	6	531278	531283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430760
14046	NC_017272	AAGGGC	2	12	531366	531377	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430760
14047	NC_017272	GGC	2	6	531386	531391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430760
14048	NC_017272	GCC	2	6	531427	531432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430760
14049	NC_017272	AGG	2	6	531478	531483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430760
14050	NC_017272	GAG	3	9	531486	531494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430760
14051	NC_017272	ACC	2	6	531505	531510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430760
14052	NC_017272	AAG	2	6	531584	531589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430761
14053	NC_017272	GGC	2	6	531673	531678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430761
14054	NC_017272	CCG	2	6	531684	531689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430761
14055	NC_017272	GTG	2	6	531734	531739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430761
14056	NC_017272	GAG	2	6	531779	531784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430761
14057	NC_017272	GGC	2	6	531798	531803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430761
14058	NC_017272	CCT	2	6	531817	531822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430761
14059	NC_017272	CACC	2	8	531826	531833	25 %	0 %	0 %	75 %	384430761
14060	NC_017272	G	6	6	531842	531847	0 %	0 %	100 %	0 %	384430761
14061	NC_017272	GGC	2	6	531882	531887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430761
14062	NC_017272	GCC	2	6	531899	531904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430761
14063	NC_017272	TGGAGG	2	12	531906	531917	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384430761
14064	NC_017272	CGC	2	6	531957	531962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430761
14065	NC_017272	GGA	3	9	531973	531981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430761
14066	NC_017272	GCC	2	6	531994	531999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430761
14067	NC_017272	CCA	2	6	532009	532014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430761
14068	NC_017272	ACCTGG	2	12	532017	532028	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384430761
14069	NC_017272	CGGGA	2	10	532094	532103	20 %	0 %	60 %	20 %	384430761
14070	NC_017272	TGG	2	6	532122	532127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430761
14071	NC_017272	CGGAGG	2	12	532149	532160	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384430761
14072	NC_017272	TGG	2	6	532257	532262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430761
14073	NC_017272	GGA	2	6	532276	532281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430761
14074	NC_017272	GGACC	2	10	532390	532399	20 %	0 %	40 %	40 %	384430761
14075	NC_017272	AGGCCC	2	12	532443	532454	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384430761
14076	NC_017272	CCT	2	6	532480	532485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430761
14077	NC_017272	GGGGAA	2	12	532498	532509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430761
14078	NC_017272	GCC	2	6	532518	532523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430761
14079	NC_017272	GCC	2	6	532581	532586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430761
14080	NC_017272	CCG	2	6	532636	532641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430761
14081	NC_017272	AGG	2	6	532644	532649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430761
14082	NC_017272	GAAGCG	2	12	532657	532668	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430761
14083	NC_017272	TGG	2	6	532683	532688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430761
14084	NC_017272	GGT	2	6	532690	532695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430761
14085	NC_017272	ACC	2	6	532718	532723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430761
14086	NC_017272	CTC	2	6	532724	532729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430761
14087	NC_017272	GAG	2	6	532751	532756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430761
14088	NC_017272	GGA	2	6	532759	532764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430761
14089	NC_017272	CTC	2	6	532874	532879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430761
14090	NC_017272	GAGG	2	8	532909	532916	25 %	0 %	75 %	0 %	384430761
14091	NC_017272	GGA	2	6	532948	532953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430761
14092	NC_017272	GTG	2	6	532976	532981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430761
14093	NC_017272	CAA	2	6	533032	533037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430761
14094	NC_017272	GGC	2	6	533047	533052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430761
14095	NC_017272	G	6	6	533086	533091	0 %	0 %	100 %	0 %	384430761
14096	NC_017272	AGG	2	6	533136	533141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430761
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14098	NC_017272	GTCC	2	8	533171	533178	0 %	25 %	25 %	50 %	384430761
14099	NC_017272	CCT	2	6	533220	533225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430762
14100	NC_017272	C	6	6	533226	533231	0 %	0 %	0 %	100 %	384430762
14101	NC_017272	CTTG	2	8	533271	533278	0 %	50 %	25 %	25 %	384430762
14102	NC_017272	GGT	2	6	533280	533285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430762
14103	NC_017272	GGA	2	6	533286	533291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430762
14104	NC_017272	CCT	2	6	533304	533309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430762
14105	NC_017272	CCA	2	6	533322	533327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430762
14106	NC_017272	CTT	2	6	533386	533391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430762
14107	NC_017272	ACCCC	2	10	533409	533418	20 %	0 %	0 %	80 %	384430762
14108	NC_017272	CCCTT	2	10	533424	533433	0 %	40 %	0 %	60 %	384430762
14109	NC_017272	GGTGGG	2	12	533521	533532	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384430763
14110	NC_017272	TCC	2	6	533536	533541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430763
14111	NC_017272	TCC	3	9	533560	533568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430763
14112	NC_017272	G	6	6	533629	533634	0 %	0 %	100 %	0 %	384430763
14113	NC_017272	AGGGCC	2	12	533695	533706	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430763
14114	NC_017272	GGA	2	6	533720	533725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430763
14115	NC_017272	CCT	2	6	533744	533749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430763
14116	NC_017272	CGG	2	6	533760	533765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430763
14117	NC_017272	GGT	2	6	533798	533803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430763
14118	NC_017272	G	6	6	533834	533839	0 %	0 %	100 %	0 %	384430763
14119	NC_017272	GCCC	2	8	533842	533849	0 %	0 %	25 %	75 %	384430763
14120	NC_017272	C	6	6	533847	533852	0 %	0 %	0 %	100 %	384430763
14121	NC_017272	CTC	2	6	533862	533867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430763
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14230	NC_017272	CGCCT	2	10	538350	538359	0 %	20 %	20 %	60 %	384430763
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14233	NC_017272	G	6	6	538609	538614	0 %	0 %	100 %	0 %	384430763
14234	NC_017272	TCGGGG	2	12	538620	538631	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384430763
14235	NC_017272	CTT	2	6	538700	538705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430763
14236	NC_017272	GTGG	2	8	538772	538779	0 %	25 %	75 %	0 %	384430763
14237	NC_017272	CCT	2	6	538838	538843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430763
14238	NC_017272	G	8	8	538862	538869	0 %	0 %	100 %	0 %	384430763
14239	NC_017272	G	6	6	538951	538956	0 %	0 %	100 %	0 %	384430763
14240	NC_017272	G	7	7	538958	538964	0 %	0 %	100 %	0 %	384430763
14241	NC_017272	CGCCT	2	10	538971	538980	0 %	20 %	20 %	60 %	384430763
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14243	NC_017272	GGAGGG	2	12	539057	539068	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	384430763
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14487	NC_017272	CGCC	2	8	547818	547825	0 %	0 %	25 %	75 %	384430770
14488	NC_017272	GGA	2	6	547860	547865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430770
14489	NC_017272	CCT	2	6	547866	547871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430770
14490	NC_017272	AGG	2	6	547874	547879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430770
14491	NC_017272	GGA	2	6	547911	547916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430770
14492	NC_017272	GGC	2	6	547923	547928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430770
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14494	NC_017272	GCC	2	6	547954	547959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430770
14495	NC_017272	CTC	5	15	547960	547974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430770
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