MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017272	GTT	2	6	510039	510044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430734
13502	NC_017272	TCC	2	6	510085	510090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430734
13503	NC_017272	GGC	2	6	510092	510097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430734
13504	NC_017272	TTCC	2	8	510116	510123	0 %	50 %	0 %	50 %	384430734
13505	NC_017272	CCT	2	6	510128	510133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430734
13506	NC_017272	GAT	2	6	510288	510293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430734
13507	NC_017272	GAG	2	6	510297	510302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430734
13508	NC_017272	G	6	6	510393	510398	0 %	0 %	100 %	0 %	384430734
13509	NC_017272	GCCC	2	8	510410	510417	0 %	0 %	25 %	75 %	384430734
13510	NC_017272	C	6	6	510419	510424	0 %	0 %	0 %	100 %	384430734
13511	NC_017272	CTC	2	6	510435	510440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430734
13512	NC_017272	GCG	2	6	510447	510452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430734
13513	NC_017272	GGA	2	6	510482	510487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430734
13514	NC_017272	GCC	2	6	510493	510498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430734
13515	NC_017272	C	7	7	510501	510507	0 %	0 %	0 %	100 %	384430734
13516	NC_017272	AGG	3	9	510523	510531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430734
13517	NC_017272	CTC	2	6	510570	510575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430734
13518	NC_017272	GTC	2	6	510606	510611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430734
13519	NC_017272	GGC	2	6	510659	510664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_017272	GGA	2	6	510741	510746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_017272	AGC	2	6	510761	510766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430735
13522	NC_017272	TGG	2	6	510777	510782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430735
13523	NC_017272	GCG	2	6	510793	510798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430735
13524	NC_017272	G	6	6	510830	510835	0 %	0 %	100 %	0 %	384430735
13525	NC_017272	AAC	2	6	510881	510886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430735
13526	NC_017272	TGG	2	6	510899	510904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430735
13527	NC_017272	GAC	2	6	510926	510931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430735
13528	NC_017272	CACC	2	8	510958	510965	25 %	0 %	0 %	75 %	384430735
13529	NC_017272	TCC	2	6	510972	510977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430735
13530	NC_017272	ACT	2	6	510978	510983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430735
13531	NC_017272	TGG	2	6	511014	511019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430735
13532	NC_017272	AAG	2	6	511034	511039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430735
13533	NC_017272	ACC	2	6	511053	511058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430735
13534	NC_017272	AGC	2	6	511068	511073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430735
13535	NC_017272	GGA	2	6	511075	511080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430735
13536	NC_017272	TGGAGG	2	12	511107	511118	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384430735
13537	NC_017272	GAT	2	6	511147	511152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430735
13538	NC_017272	G	7	7	511172	511178	0 %	0 %	100 %	0 %	384430735
13539	NC_017272	CGG	2	6	511185	511190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430735
13540	NC_017272	CCCCG	2	10	511233	511242	0 %	0 %	20 %	80 %	384430735
13541	NC_017272	ATG	2	6	511253	511258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430735
13542	NC_017272	GGA	2	6	511282	511287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430735
13543	NC_017272	GGA	2	6	511495	511500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430735
13544	NC_017272	GGA	2	6	511525	511530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430735
13545	NC_017272	GTG	2	6	511540	511545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430735
13546	NC_017272	AGC	2	6	511587	511592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430735
13547	NC_017272	GGA	2	6	511597	511602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430735
13548	NC_017272	AGG	2	6	511722	511727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430735
13549	NC_017272	CCG	2	6	511836	511841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430735
13550	NC_017272	G	6	6	511851	511856	0 %	0 %	100 %	0 %	384430735
13551	NC_017272	CTC	2	6	511865	511870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430735
13552	NC_017272	GAG	2	6	511889	511894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430735
13553	NC_017272	CTCAAG	2	12	511922	511933	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384430735
13554	NC_017272	GAA	2	6	511975	511980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430735
13555	NC_017272	CTC	2	6	512024	512029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430735
13556	NC_017272	CCG	2	6	512086	512091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430735
13557	NC_017272	ACG	2	6	512094	512099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430735
13558	NC_017272	ACC	2	6	512162	512167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430735
13559	NC_017272	ACGGTG	2	12	512180	512191	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430735
13560	NC_017272	CGGGAC	2	12	512192	512203	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430735
13561	NC_017272	GGA	2	6	512276	512281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_017272	AGG	2	6	512332	512337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430736
13563	NC_017272	GC	3	6	512355	512360	0 %	0 %	50 %	50 %	384430736
13564	NC_017272	A	6	6	512458	512463	100 %	0 %	0 %	0 %	384430736
13565	NC_017272	AGG	2	6	512493	512498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430736
13566	NC_017272	GCGGGC	2	12	512548	512559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430737
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13568	NC_017272	TGG	2	6	512631	512636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430737
13569	NC_017272	GGA	3	9	512674	512682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430737
13570	NC_017272	GTG	2	6	512698	512703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430738
13571	NC_017272	CCG	2	6	512798	512803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430738
13572	NC_017272	GAG	2	6	512827	512832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430738
13573	NC_017272	CCAAGG	2	12	512906	512917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430738
13574	NC_017272	TGG	3	9	512945	512953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430738
13575	NC_017272	TGG	2	6	512993	512998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430738
13576	NC_017272	ATC	2	6	513040	513045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430738
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13578	NC_017272	GGC	2	6	513141	513146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430738
13579	NC_017272	CCGGGG	2	12	513149	513160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430738
13580	NC_017272	GGA	2	6	513171	513176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430738
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13587	NC_017272	GGC	2	6	513444	513449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430738
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13589	NC_017272	GGT	2	6	513483	513488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430738
13590	NC_017272	GGA	2	6	513557	513562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430738
13591	NC_017272	CTT	2	6	513597	513602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430738
13592	NC_017272	GTG	2	6	513604	513609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430738
13593	NC_017272	GAG	2	6	513658	513663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430738
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13601	NC_017272	GAG	3	9	513911	513919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430739
13602	NC_017272	GGA	2	6	513923	513928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430739
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13607	NC_017272	C	6	6	514109	514114	0 %	0 %	0 %	100 %	384430739
13608	NC_017272	CGG	2	6	514132	514137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430739
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13617	NC_017272	TAT	2	6	514381	514386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_017272	GGAG	2	8	514428	514435	25 %	0 %	75 %	0 %	384430740
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13630	NC_017272	G	6	6	514864	514869	0 %	0 %	100 %	0 %	384430741
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13863	NC_017272	GGC	2	6	523235	523240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430751
13864	NC_017272	GGCCAC	2	12	523394	523405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384430751
13865	NC_017272	ACC	2	6	523572	523577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430751
13866	NC_017272	GTC	2	6	523589	523594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430751
13867	NC_017272	ACC	2	6	523608	523613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430751
13868	NC_017272	TCC	2	6	523614	523619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430751
13869	NC_017272	GCC	2	6	523620	523625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430751
13870	NC_017272	GCC	2	6	523686	523691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430751
13871	NC_017272	TTC	2	6	523692	523697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430751
13872	NC_017272	GAT	2	6	523715	523720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430751
13873	NC_017272	CGGT	2	8	523740	523747	0 %	25 %	50 %	25 %	384430751
13874	NC_017272	GC	3	6	523783	523788	0 %	0 %	50 %	50 %	384430751
13875	NC_017272	CCG	2	6	523801	523806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430751
13876	NC_017272	ATG	2	6	523894	523899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13877	NC_017272	CGC	2	6	523925	523930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430752
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13879	NC_017272	CGGG	2	8	524022	524029	0 %	0 %	75 %	25 %	384430752
13880	NC_017272	CGGGCA	2	12	524081	524092	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430752
13881	NC_017272	GGC	2	6	524108	524113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430752
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13883	NC_017272	GAT	2	6	524177	524182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430752
13884	NC_017272	G	7	7	524240	524246	0 %	0 %	100 %	0 %	384430752
13885	NC_017272	TCC	2	6	524341	524346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430752
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13891	NC_017272	CGC	2	6	524600	524605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430752
13892	NC_017272	AAG	2	6	524622	524627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430752
13893	NC_017272	CGG	2	6	524641	524646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430752
13894	NC_017272	GCG	2	6	524673	524678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430752
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13908	NC_017272	CCGGG	2	10	525350	525359	0 %	0 %	60 %	40 %	384430753
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13914	NC_017272	CCCG	2	8	525673	525680	0 %	0 %	25 %	75 %	384430754
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13918	NC_017272	AGGCTC	2	12	525778	525789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384430754
13919	NC_017272	CA	3	6	525817	525822	50 %	0 %	0 %	50 %	384430754
13920	NC_017272	ACC	2	6	525827	525832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430754
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13922	NC_017272	CCG	2	6	525885	525890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430754
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13926	NC_017272	CCT	2	6	525997	526002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430755
13927	NC_017272	GGA	2	6	526066	526071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430755
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13930	NC_017272	CTC	2	6	526199	526204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430755
13931	NC_017272	CTT	2	6	526406	526411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430755
13932	NC_017272	GGT	2	6	526441	526446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430755
13933	NC_017272	GAA	2	6	526464	526469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13934	NC_017272	ACA	2	6	526471	526476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13935	NC_017272	AGGG	2	8	526583	526590	25 %	0 %	75 %	0 %	384430756
13936	NC_017272	GAG	2	6	526591	526596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430756
13937	NC_017272	GTCCAG	2	12	526609	526620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384430756
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13941	NC_017272	C	6	6	526771	526776	0 %	0 %	0 %	100 %	384430756
13942	NC_017272	GAG	3	9	526801	526809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430756
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13966	NC_017272	AGG	2	6	527762	527767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430756
13967	NC_017272	GAC	2	6	527794	527799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430756
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13972	NC_017272	GGA	2	6	528003	528008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430756
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13975	NC_017272	C	6	6	528070	528075	0 %	0 %	0 %	100 %	384430756
13976	NC_017272	CAC	3	9	528097	528105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430756
13977	NC_017272	GAG	2	6	528121	528126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430756
13978	NC_017272	CAC	2	6	528136	528141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430756
13979	NC_017272	CCCCTC	2	12	528238	528249	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384430756
13980	NC_017272	CTC	2	6	528295	528300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430756
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13982	NC_017272	CTC	3	9	528436	528444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430756
13983	NC_017272	AGG	2	6	528449	528454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430756
13984	NC_017272	GAG	2	6	528463	528468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430756
13985	NC_017272	CTC	2	6	528493	528498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430756
13986	NC_017272	TCC	2	6	528530	528535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430756
13987	NC_017272	GAG	2	6	528676	528681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430756
13988	NC_017272	G	7	7	528727	528733	0 %	0 %	100 %	0 %	384430756
13989	NC_017272	GGACGA	2	12	528738	528749	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430756
13990	NC_017272	GGC	2	6	528865	528870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430756
13991	NC_017272	GGA	2	6	528885	528890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430756
13992	NC_017272	CCA	2	6	528906	528911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430756
13993	NC_017272	G	6	6	528924	528929	0 %	0 %	100 %	0 %	384430756
13994	NC_017272	TG	3	6	529010	529015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13995	NC_017272	AGG	2	6	529055	529060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430757
13996	NC_017272	CGA	2	6	529140	529145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430757
13997	NC_017272	ACT	2	6	529280	529285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430757
13998	NC_017272	CCG	2	6	529298	529303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430757
13999	NC_017272	AGG	2	6	529304	529309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430757
14000	NC_017272	CTT	2	6	529332	529337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430757

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