MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017272	C	7	7	492082	492088	0 %	0 %	0 %	100 %	384430719
13003	NC_017272	ACG	2	6	492240	492245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430719
13004	NC_017272	TCC	2	6	492270	492275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430719
13005	NC_017272	GGA	2	6	492294	492299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430719
13006	NC_017272	CG	3	6	492338	492343	0 %	0 %	50 %	50 %	384430719
13007	NC_017272	G	6	6	492400	492405	0 %	0 %	100 %	0 %	384430719
13008	NC_017272	CTCCC	2	10	492411	492420	0 %	20 %	0 %	80 %	384430719
13009	NC_017272	GAG	2	6	492431	492436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430719
13010	NC_017272	GGT	3	9	492445	492453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430719
13011	NC_017272	GGA	2	6	492481	492486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430719
13012	NC_017272	GGC	2	6	492505	492510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430719
13013	NC_017272	CGTGGC	2	12	492532	492543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430719
13014	NC_017272	CGG	2	6	492640	492645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430719
13015	NC_017272	CCA	2	6	492666	492671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430719
13016	NC_017272	CGTGGA	2	12	492718	492729	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430719
13017	NC_017272	GCCAAG	2	12	492785	492796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430719
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13020	NC_017272	CTT	2	6	492967	492972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430719
13021	NC_017272	GCG	2	6	493015	493020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430719
13022	NC_017272	CGC	2	6	493093	493098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430719
13023	NC_017272	GAG	3	9	493112	493120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430719
13024	NC_017272	CCT	2	6	493123	493128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430719
13025	NC_017272	AGG	2	6	493149	493154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430719
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13027	NC_017272	GGA	2	6	493239	493244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430720
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13029	NC_017272	CGC	2	6	493336	493341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430720
13030	NC_017272	ACC	2	6	493357	493362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430720
13031	NC_017272	GAG	2	6	493411	493416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430720
13032	NC_017272	GCG	2	6	493417	493422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430720
13033	NC_017272	CGC	2	6	493548	493553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430720
13034	NC_017272	ATC	2	6	493585	493590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430720
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13036	NC_017272	GGA	2	6	493619	493624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430720
13037	NC_017272	TGGTCC	2	12	493634	493645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430720
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13042	NC_017272	CAT	2	6	493896	493901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430720
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13052	NC_017272	AGG	2	6	494393	494398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430720
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13056	NC_017272	CTC	2	6	494664	494669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430721
13057	NC_017272	CCT	2	6	494699	494704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430721
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13062	NC_017272	AGCCG	2	10	494891	494900	20 %	0 %	40 %	40 %	384430721
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13069	NC_017272	GAC	2	6	495048	495053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430721
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13087	NC_017272	CCT	2	6	495537	495542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430722
13088	NC_017272	ACC	2	6	495557	495562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430722
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13091	NC_017272	AGGT	2	8	495671	495678	25 %	25 %	50 %	0 %	384430722
13092	NC_017272	CTCC	2	8	495712	495719	0 %	25 %	0 %	75 %	384430722
13093	NC_017272	GCC	2	6	495722	495727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430722
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13100	NC_017272	AGGT	2	8	495917	495924	25 %	25 %	50 %	0 %	384430722
13101	NC_017272	ATA	2	6	495940	495945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_017272	GCC	2	6	495972	495977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_017272	CCT	3	9	495982	495990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13104	NC_017272	CTT	2	6	496033	496038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_017272	ACGCCC	2	12	496068	496079	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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13107	NC_017272	GGC	2	6	496189	496194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_017272	GC	4	8	496229	496236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13109	NC_017272	GGGA	2	8	496251	496258	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_017272	T	6	6	496299	496304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_017272	C	6	6	496354	496359	0 %	0 %	0 %	100 %	384430723
13112	NC_017272	CCG	2	6	496368	496373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430723
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13116	NC_017272	GAG	3	9	496462	496470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430723
13117	NC_017272	C	7	7	496509	496515	0 %	0 %	0 %	100 %	384430723
13118	NC_017272	CTT	2	6	496542	496547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430723
13119	NC_017272	GGT	2	6	496557	496562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430723
13120	NC_017272	GGGGC	2	10	496580	496589	0 %	0 %	80 %	20 %	384430723
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13122	NC_017272	CCCTGG	2	12	496673	496684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430723
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13223	NC_017272	G	7	7	500165	500171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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13225	NC_017272	TGG	2	6	500196	500201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430727
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13230	NC_017272	CCT	2	6	500389	500394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430727
13231	NC_017272	CAC	3	9	500395	500403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430727
13232	NC_017272	CTC	2	6	500426	500431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430727
13233	NC_017272	CAC	2	6	500494	500499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430727
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13235	NC_017272	CAC	2	6	500602	500607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430727
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13237	NC_017272	G	6	6	500639	500644	0 %	0 %	100 %	0 %	384430727
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13239	NC_017272	CGC	3	9	500668	500676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430727
13240	NC_017272	ACACGG	2	12	500703	500714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430727
13241	NC_017272	CGAGG	2	10	500749	500758	20 %	0 %	60 %	20 %	384430727
13242	NC_017272	TCC	2	6	500817	500822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430727
13243	NC_017272	CTA	2	6	500836	500841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430727
13244	NC_017272	TCC	2	6	500862	500867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430727
13245	NC_017272	AGG	2	6	500910	500915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430727
13246	NC_017272	TGGACC	2	12	500955	500966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384430727
13247	NC_017272	ATC	2	6	501062	501067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430727
13248	NC_017272	GCA	2	6	501097	501102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430727
13249	NC_017272	GAA	2	6	501118	501123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430727
13250	NC_017272	CGTGGG	2	12	501220	501231	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384430727
13251	NC_017272	GAT	2	6	501301	501306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430727
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13253	NC_017272	ATC	2	6	501335	501340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430727
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13257	NC_017272	CCT	2	6	501435	501440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13258	NC_017272	CCG	2	6	501450	501455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13259	NC_017272	CCT	2	6	501531	501536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13260	NC_017272	GC	3	6	501551	501556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13261	NC_017272	CCG	3	9	501569	501577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13262	NC_017272	GAG	2	6	501595	501600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13263	NC_017272	C	7	7	501631	501637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13264	NC_017272	TCC	2	6	501642	501647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13265	NC_017272	TGG	3	9	501666	501674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13266	NC_017272	ACG	2	6	501675	501680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13269	NC_017272	GTG	2	6	501746	501751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13270	NC_017272	GAG	2	6	501812	501817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13271	NC_017272	CGG	2	6	501819	501824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13272	NC_017272	GGT	2	6	501829	501834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13273	NC_017272	GTG	2	6	501963	501968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13274	NC_017272	GGC	2	6	502264	502269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430728
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13280	NC_017272	GGGC	2	8	502383	502390	0 %	0 %	75 %	25 %	384430728
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13282	NC_017272	GCG	2	6	502459	502464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430728
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13294	NC_017272	CTT	2	6	503025	503030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430729
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13354	NC_017272	C	6	6	504840	504845	0 %	0 %	0 %	100 %	384430730
13355	NC_017272	CTCC	2	8	504855	504862	0 %	25 %	0 %	75 %	384430730
13356	NC_017272	TGA	2	6	504880	504885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430730
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13359	NC_017272	TA	3	6	505052	505057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13360	NC_017272	CGG	2	6	505279	505284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430731
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13486	NC_017272	TCG	2	6	509545	509550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430734
13487	NC_017272	GAT	2	6	509553	509558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430734
13488	NC_017272	GTG	2	6	509565	509570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430734
13489	NC_017272	TCC	2	6	509614	509619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430734
13490	NC_017272	GGT	2	6	509687	509692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430734
13491	NC_017272	GGT	3	9	509700	509708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430734
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13499	NC_017272	CCA	2	6	509927	509932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430734
13500	NC_017272	G	7	7	509952	509958	0 %	0 %	100 %	0 %	384430734

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