MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017272	GGC	3	9	435019	435027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430661
11502	NC_017272	GGC	2	6	435034	435039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430661
11503	NC_017272	GGC	2	6	435043	435048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430661
11504	NC_017272	TGG	2	6	435129	435134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430661
11505	NC_017272	TGG	2	6	435138	435143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430661
11506	NC_017272	TTC	2	6	435161	435166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430661
11507	NC_017272	CTC	2	6	435253	435258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430661
11508	NC_017272	ACC	2	6	435278	435283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430661
11509	NC_017272	CCG	2	6	435313	435318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430661
11510	NC_017272	CGG	2	6	435410	435415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430661
11511	NC_017272	C	7	7	435477	435483	0 %	0 %	0 %	100 %	384430661
11512	NC_017272	GTA	2	6	435535	435540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430661
11513	NC_017272	GCG	2	6	435611	435616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430661
11514	NC_017272	GGT	2	6	435655	435660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430661
11515	NC_017272	CCGC	2	8	435678	435685	0 %	0 %	25 %	75 %	384430661
11516	NC_017272	CCGC	2	8	435696	435703	0 %	0 %	25 %	75 %	384430661
11517	NC_017272	CCA	2	6	435744	435749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430661
11518	NC_017272	CGT	2	6	435795	435800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430661
11519	NC_017272	CAGG	2	8	435846	435853	25 %	0 %	50 %	25 %	384430661
11520	NC_017272	GCCCC	2	10	435918	435927	0 %	0 %	20 %	80 %	384430661
11521	NC_017272	CCG	2	6	435951	435956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430661
11522	NC_017272	ACC	2	6	436009	436014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430662
11523	NC_017272	CTC	2	6	436032	436037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430662
11524	NC_017272	CCG	3	9	436055	436063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430662
11525	NC_017272	CAC	2	6	436086	436091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430662
11526	NC_017272	CTC	2	6	436107	436112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430662
11527	NC_017272	GGC	2	6	436136	436141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430662
11528	NC_017272	TGG	2	6	436154	436159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430662
11529	NC_017272	AGA	2	6	436184	436189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430662
11530	NC_017272	GAG	2	6	436222	436227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430662
11531	NC_017272	GGCGAT	2	12	436233	436244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430662
11532	NC_017272	CCA	2	6	436304	436309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430662
11533	NC_017272	C	6	6	436327	436332	0 %	0 %	0 %	100 %	384430662
11534	NC_017272	GGC	2	6	436337	436342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430662
11535	NC_017272	CCT	2	6	436346	436351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430662
11536	NC_017272	GGGT	2	8	436363	436370	0 %	25 %	75 %	0 %	384430662
11537	NC_017272	TCG	2	6	436384	436389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430662
11538	NC_017272	CGG	2	6	436408	436413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430662
11539	NC_017272	TCC	2	6	436420	436425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430662
11540	NC_017272	CCG	2	6	436430	436435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430662
11541	NC_017272	GGC	2	6	436476	436481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430662
11542	NC_017272	CCA	3	9	436547	436555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430662
11543	NC_017272	GGC	3	9	436587	436595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430662
11544	NC_017272	CTC	2	6	436596	436601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430662
11545	NC_017272	CTTGGG	2	12	436614	436625	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384430662
11546	NC_017272	GTGCC	2	10	436666	436675	0 %	20 %	40 %	40 %	384430662
11547	NC_017272	TCC	2	6	436714	436719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430662
11548	NC_017272	CCGC	2	8	436740	436747	0 %	0 %	25 %	75 %	384430662
11549	NC_017272	GA	3	6	436750	436755	50 %	0 %	50 %	0 %	384430662
11550	NC_017272	TGA	2	6	436763	436768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430662
11551	NC_017272	CCA	2	6	436817	436822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430662
11552	NC_017272	CGC	2	6	436823	436828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430662
11553	NC_017272	GGT	2	6	436901	436906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430662
11554	NC_017272	GCC	2	6	436915	436920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430662
11555	NC_017272	CCT	2	6	436937	436942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430662
11556	NC_017272	ACC	2	6	437011	437016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430662
11557	NC_017272	GC	3	6	437017	437022	0 %	0 %	50 %	50 %	384430662
11558	NC_017272	CTCC	2	8	437026	437033	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11559	NC_017272	T	6	6	437046	437051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_017272	CCTG	2	8	437093	437100	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11561	NC_017272	TGG	2	6	437175	437180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430663
11562	NC_017272	CGA	2	6	437271	437276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430663
11563	NC_017272	CAT	2	6	437335	437340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430663
11564	NC_017272	CAC	2	6	437374	437379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430663
11565	NC_017272	CAA	2	6	437425	437430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430663
11566	NC_017272	CGGC	2	8	437476	437483	0 %	0 %	50 %	50 %	384430663
11567	NC_017272	CCG	2	6	437490	437495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430663
11568	NC_017272	CTT	2	6	437560	437565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430663
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11572	NC_017272	AAG	2	6	437726	437731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430663
11573	NC_017272	CGC	2	6	437920	437925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430663
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11575	NC_017272	CAG	2	6	438058	438063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430663
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11577	NC_017272	CAG	2	6	438281	438286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430663
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11580	NC_017272	GCG	2	6	438358	438363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430663
11581	NC_017272	CCA	2	6	438381	438386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430663
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11588	NC_017272	GTG	2	6	438587	438592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430663
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11590	NC_017272	AAG	2	6	438701	438706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430663
11591	NC_017272	CTC	2	6	438749	438754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430663
11592	NC_017272	ACC	2	6	438783	438788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430663
11593	NC_017272	AAC	2	6	438797	438802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430663
11594	NC_017272	GCG	2	6	438810	438815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430663
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11598	NC_017272	CTT	2	6	438987	438992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430664
11599	NC_017272	TCA	2	6	439016	439021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430664
11600	NC_017272	AGCTGG	2	12	439052	439063	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430664
11601	NC_017272	CCT	2	6	439140	439145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430664
11602	NC_017272	CCT	2	6	439158	439163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430664
11603	NC_017272	TGG	2	6	439247	439252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430664
11604	NC_017272	TCC	2	6	439265	439270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430664
11605	NC_017272	TCCT	2	8	439342	439349	0 %	50 %	0 %	50 %	384430664
11606	NC_017272	CCTCAT	2	12	439389	439400	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384430664
11607	NC_017272	GGT	2	6	439500	439505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430664
11608	NC_017272	CAC	2	6	439545	439550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430664
11609	NC_017272	CAT	2	6	439575	439580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430664
11610	NC_017272	GTG	3	9	439654	439662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430664
11611	NC_017272	CAT	2	6	439686	439691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430664
11612	NC_017272	CGG	2	6	439710	439715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430664
11613	NC_017272	GGCC	2	8	439740	439747	0 %	0 %	50 %	50 %	384430664
11614	NC_017272	GGT	2	6	439755	439760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430664
11615	NC_017272	TGGCC	2	10	439763	439772	0 %	20 %	40 %	40 %	384430664
11616	NC_017272	C	6	6	439781	439786	0 %	0 %	0 %	100 %	384430664
11617	NC_017272	CGT	2	6	439821	439826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430664
11618	NC_017272	AGG	2	6	439925	439930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430664
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11620	NC_017272	CTG	2	6	440027	440032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430665
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11862	NC_017272	GTA	2	6	449035	449040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430672
11863	NC_017272	CGT	2	6	449058	449063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430672
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11954	NC_017272	GCCCT	2	10	452550	452559	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11955	NC_017272	AG	3	6	452590	452595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11979	NC_017272	CCA	2	6	453598	453603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430677
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11981	NC_017272	GTG	2	6	453662	453667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430677
11982	NC_017272	CGG	2	6	453687	453692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430677
11983	NC_017272	CCT	2	6	453742	453747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430677
11984	NC_017272	CTG	2	6	453794	453799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430677
11985	NC_017272	CACCG	2	10	453803	453812	20 %	0 %	20 %	60 %	384430677
11986	NC_017272	TGC	2	6	453813	453818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430677
11987	NC_017272	AGGA	2	8	453857	453864	50 %	0 %	50 %	0 %	384430677
11988	NC_017272	GAG	2	6	453869	453874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430677
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11990	NC_017272	AGC	2	6	453954	453959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430677
11991	NC_017272	C	7	7	453991	453997	0 %	0 %	0 %	100 %	384430677
11992	NC_017272	TCC	2	6	453999	454004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430677
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11996	NC_017272	CAT	2	6	454153	454158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430677
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11999	NC_017272	CGCC	2	8	454204	454211	0 %	0 %	25 %	75 %	384430677
12000	NC_017272	GCC	2	6	454229	454234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430677

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