MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017272	CCTGC	2	10	380069	380078	0 %	20 %	20 %	60 %	384430596
10002	NC_017272	CCA	2	6	380093	380098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430596
10003	NC_017272	CAC	2	6	380130	380135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430596
10004	NC_017272	C	7	7	380171	380177	0 %	0 %	0 %	100 %	384430596
10005	NC_017272	GGT	2	6	380184	380189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430596
10006	NC_017272	CCT	2	6	380213	380218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430596
10007	NC_017272	CGG	2	6	380219	380224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430596
10008	NC_017272	GCACCC	2	12	380264	380275	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384430596
10009	NC_017272	GCCGAA	2	12	380313	380324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430596
10010	NC_017272	GAA	2	6	380346	380351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430596
10011	NC_017272	GGCA	2	8	380363	380370	25 %	0 %	50 %	25 %	384430596
10012	NC_017272	CAC	2	6	380403	380408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430596
10013	NC_017272	GAG	2	6	380559	380564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430596
10014	NC_017272	CCT	2	6	380600	380605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430596
10015	NC_017272	GCC	2	6	380682	380687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430597
10016	NC_017272	GCG	2	6	380706	380711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430597
10017	NC_017272	CCT	2	6	380782	380787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430597
10018	NC_017272	CCG	2	6	380833	380838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430597
10019	NC_017272	C	6	6	380860	380865	0 %	0 %	0 %	100 %	384430597
10020	NC_017272	GCC	2	6	380898	380903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430597
10021	NC_017272	CGC	2	6	380969	380974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430597
10022	NC_017272	TCC	2	6	381054	381059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_017272	GGT	2	6	381091	381096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430598
10024	NC_017272	CCT	2	6	381100	381105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430598
10025	NC_017272	CTC	2	6	381146	381151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430598
10026	NC_017272	CCT	2	6	381154	381159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430598
10027	NC_017272	GAG	2	6	381164	381169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430598
10028	NC_017272	TCT	2	6	381183	381188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430598
10029	NC_017272	CTC	2	6	381212	381217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430598
10030	NC_017272	GCC	2	6	381346	381351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430598
10031	NC_017272	C	6	6	381350	381355	0 %	0 %	0 %	100 %	384430598
10032	NC_017272	GAC	2	6	381452	381457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430598
10033	NC_017272	GCGG	2	8	381496	381503	0 %	0 %	75 %	25 %	384430598
10034	NC_017272	GGA	2	6	381553	381558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10035	NC_017272	TCC	2	6	381588	381593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10036	NC_017272	GGA	2	6	381595	381600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10037	NC_017272	CTC	2	6	381602	381607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10038	NC_017272	GGTG	2	8	381631	381638	0 %	25 %	75 %	0 %	384430599
10039	NC_017272	ATG	2	6	381684	381689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430599
10040	NC_017272	CTT	3	9	381728	381736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430599
10041	NC_017272	TCC	2	6	381744	381749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10042	NC_017272	GTC	2	6	381857	381862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430599
10043	NC_017272	CTC	2	6	381896	381901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10044	NC_017272	CTC	2	6	381968	381973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10045	NC_017272	CAC	2	6	382061	382066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430599
10046	NC_017272	TCC	2	6	382104	382109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10047	NC_017272	GGGC	2	8	382123	382130	0 %	0 %	75 %	25 %	384430599
10048	NC_017272	GCG	2	6	382206	382211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430599
10049	NC_017272	AGG	2	6	382212	382217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10050	NC_017272	GAG	2	6	382328	382333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10051	NC_017272	CTC	2	6	382346	382351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10052	NC_017272	AGGG	2	8	382353	382360	25 %	0 %	75 %	0 %	384430599
10053	NC_017272	CAC	3	9	382367	382375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430599
10054	NC_017272	AGG	2	6	382401	382406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10055	NC_017272	TGG	2	6	382432	382437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430599
10056	NC_017272	TCG	2	6	382515	382520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430599
10057	NC_017272	GCC	2	6	382523	382528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430599
10058	NC_017272	GAT	2	6	382580	382585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430599
10059	NC_017272	CCT	2	6	382606	382611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10060	NC_017272	CCCACG	2	12	382638	382649	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384430599
10061	NC_017272	CGGAGA	2	12	382672	382683	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430599
10062	NC_017272	GAG	2	6	382721	382726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10063	NC_017272	GAG	2	6	382754	382759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10064	NC_017272	CTT	2	6	382796	382801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430599
10065	NC_017272	CCA	2	6	382819	382824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430599
10066	NC_017272	CCT	2	6	382846	382851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10067	NC_017272	GGCC	2	8	382855	382862	0 %	0 %	50 %	50 %	384430599
10068	NC_017272	GGT	2	6	382874	382879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430599
10069	NC_017272	GGCC	2	8	382939	382946	0 %	0 %	50 %	50 %	384430599
10070	NC_017272	GAA	3	9	382964	382972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430599
10071	NC_017272	AGA	2	6	382975	382980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430599
10072	NC_017272	GAT	3	9	382985	382993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430599
10073	NC_017272	AGG	2	6	383013	383018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10074	NC_017272	TCC	2	6	383067	383072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10075	NC_017272	GGA	2	6	383080	383085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10076	NC_017272	G	6	6	383108	383113	0 %	0 %	100 %	0 %	384430599
10077	NC_017272	GAG	2	6	383183	383188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430599
10078	NC_017272	TCC	2	6	383205	383210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430599
10079	NC_017272	GGT	2	6	383280	383285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430599
10080	NC_017272	GCG	2	6	383429	383434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_017272	CCT	2	6	383488	383493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10082	NC_017272	GAGG	2	8	383521	383528	25 %	0 %	75 %	0 %	384430600
10083	NC_017272	CTC	3	9	383543	383551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10084	NC_017272	GAG	2	6	383576	383581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10085	NC_017272	CAC	2	6	383597	383602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430600
10086	NC_017272	GGA	2	6	383608	383613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10087	NC_017272	CCT	2	6	383659	383664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10088	NC_017272	CTC	2	6	383672	383677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10089	NC_017272	GGC	2	6	383688	383693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430600
10090	NC_017272	TCC	2	6	383718	383723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10091	NC_017272	ACC	2	6	383748	383753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430600
10092	NC_017272	CT	3	6	383763	383768	0 %	50 %	0 %	50 %	384430600
10093	NC_017272	GGA	2	6	383785	383790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10094	NC_017272	C	7	7	383819	383825	0 %	0 %	0 %	100 %	384430600
10095	NC_017272	CCTGG	2	10	383827	383836	0 %	20 %	40 %	40 %	384430600
10096	NC_017272	GCC	2	6	383877	383882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430600
10097	NC_017272	GCC	2	6	383891	383896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430600
10098	NC_017272	G	6	6	383910	383915	0 %	0 %	100 %	0 %	384430600
10099	NC_017272	CTC	2	6	383948	383953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10100	NC_017272	CGC	3	9	383959	383967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430600
10101	NC_017272	GGGGAG	2	12	383984	383995	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	384430600
10102	NC_017272	AGG	2	6	384015	384020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10103	NC_017272	GGC	2	6	384025	384030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430600
10104	NC_017272	GAG	2	6	384038	384043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10105	NC_017272	GGA	2	6	384049	384054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10106	NC_017272	CGC	2	6	384055	384060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430600
10107	NC_017272	CCT	2	6	384073	384078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10108	NC_017272	CCT	2	6	384091	384096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10109	NC_017272	GGA	2	6	384121	384126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10110	NC_017272	GGCCTT	2	12	384136	384147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430600
10111	NC_017272	GGA	3	9	384148	384156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10112	NC_017272	TGG	2	6	384186	384191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430600
10113	NC_017272	CCT	2	6	384202	384207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10114	NC_017272	GAG	2	6	384224	384229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10115	NC_017272	TCC	2	6	384288	384293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430600
10116	NC_017272	GGC	2	6	384307	384312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430600
10117	NC_017272	GAG	2	6	384341	384346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
10118	NC_017272	GAG	2	6	384368	384373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430600
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10120	NC_017272	GCC	3	9	384452	384460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430600
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10229	NC_017272	CACC	2	8	388343	388350	25 %	0 %	0 %	75 %	384430604
10230	NC_017272	GGC	3	9	388520	388528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430604
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10237	NC_017272	CGTGGC	2	12	388888	388899	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430605
10238	NC_017272	CAT	2	6	388990	388995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430605
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10240	NC_017272	CAT	2	6	389074	389079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430605
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10483	NC_017272	GCA	2	6	398391	398396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430617
10484	NC_017272	CCT	2	6	398397	398402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430617
10485	NC_017272	CTC	2	6	398408	398413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430617
10486	NC_017272	GGT	2	6	398455	398460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430617
10487	NC_017272	G	6	6	398466	398471	0 %	0 %	100 %	0 %	384430617
10488	NC_017272	GC	3	6	398495	398500	0 %	0 %	50 %	50 %	384430617
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10491	NC_017272	CCT	2	6	398535	398540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430617
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10499	NC_017272	GCC	2	6	398887	398892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430617
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