MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017272	GGT	2	6	323548	323553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430539
8502	NC_017272	CGC	2	6	323569	323574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430539
8503	NC_017272	CCA	2	6	323601	323606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430539
8504	NC_017272	GAG	2	6	323609	323614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430539
8505	NC_017272	GAA	2	6	323620	323625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430539
8506	NC_017272	GC	3	6	323656	323661	0 %	0 %	50 %	50 %	384430539
8507	NC_017272	GCG	2	6	323692	323697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_017272	GGC	2	6	323701	323706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_017272	TCC	2	6	323737	323742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430540
8510	NC_017272	GGT	2	6	323777	323782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430540
8511	NC_017272	TGG	2	6	323806	323811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430540
8512	NC_017272	AGG	2	6	323908	323913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430540
8513	NC_017272	GGC	2	6	323924	323929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430540
8514	NC_017272	TCCT	2	8	323943	323950	0 %	50 %	0 %	50 %	384430540
8515	NC_017272	CCGG	2	8	324035	324042	0 %	0 %	50 %	50 %	384430540
8516	NC_017272	GGT	2	6	324074	324079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430540
8517	NC_017272	CCT	2	6	324116	324121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430540
8518	NC_017272	CAGGGG	2	12	324123	324134	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384430540
8519	NC_017272	GGT	2	6	324176	324181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430540
8520	NC_017272	TCA	2	6	324190	324195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430540
8521	NC_017272	TCC	2	6	324201	324206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430540
8522	NC_017272	GGGAG	2	10	324271	324280	20 %	0 %	80 %	0 %	384430540
8523	NC_017272	CTC	2	6	324327	324332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430540
8524	NC_017272	GTG	2	6	324333	324338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430540
8525	NC_017272	G	6	6	324349	324354	0 %	0 %	100 %	0 %	384430540
8526	NC_017272	GGA	2	6	324437	324442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430540
8527	NC_017272	GAG	2	6	324444	324449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430540
8528	NC_017272	CGGGAC	2	12	324543	324554	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430540
8529	NC_017272	CGG	2	6	324561	324566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430540
8530	NC_017272	CCT	2	6	324592	324597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430540
8531	NC_017272	ACCC	2	8	324612	324619	25 %	0 %	0 %	75 %	384430540
8532	NC_017272	CCT	2	6	324665	324670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430540
8533	NC_017272	GAG	2	6	324756	324761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430540
8534	NC_017272	TGG	2	6	324790	324795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430540
8535	NC_017272	AGG	2	6	324841	324846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430540
8536	NC_017272	CTC	2	6	324873	324878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430540
8537	NC_017272	CCT	2	6	324893	324898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430540
8538	NC_017272	CTT	2	6	324932	324937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430540
8539	NC_017272	CCT	2	6	325020	325025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8540	NC_017272	GGC	2	6	325044	325049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430541
8541	NC_017272	GCCCC	2	10	325057	325066	0 %	0 %	20 %	80 %	384430541
8542	NC_017272	CCT	2	6	325074	325079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8543	NC_017272	TGCCCG	2	12	325085	325096	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430541
8544	NC_017272	CCT	3	9	325116	325124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8545	NC_017272	TCC	3	9	325190	325198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8546	NC_017272	CCT	2	6	325233	325238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8547	NC_017272	GCC	2	6	325253	325258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430541
8548	NC_017272	TGG	2	6	325379	325384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430541
8549	NC_017272	GGGCC	2	10	325410	325419	0 %	0 %	60 %	40 %	384430541
8550	NC_017272	GGC	2	6	325494	325499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430541
8551	NC_017272	CCT	2	6	325512	325517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8552	NC_017272	CTG	2	6	325522	325527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430541
8553	NC_017272	GAG	2	6	325528	325533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430541
8554	NC_017272	ATC	2	6	325540	325545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430541
8555	NC_017272	TCC	3	9	325556	325564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8556	NC_017272	TGG	2	6	325583	325588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430541
8557	NC_017272	TGG	2	6	325600	325605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430541
8558	NC_017272	GAG	2	6	325636	325641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430541
8559	NC_017272	GCC	3	9	325687	325695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430541
8560	NC_017272	TGG	2	6	325709	325714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430541
8561	NC_017272	GAT	2	6	325749	325754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430541
8562	NC_017272	AGA	2	6	325772	325777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430541
8563	NC_017272	TCT	2	6	325832	325837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430541
8564	NC_017272	GGGGAT	2	12	325848	325859	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384430541
8565	NC_017272	GCC	2	6	325880	325885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430541
8566	NC_017272	TCC	2	6	325886	325891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8567	NC_017272	CTC	3	9	325909	325917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
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8569	NC_017272	CCT	2	6	325932	325937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8570	NC_017272	CTC	3	9	325996	326004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8571	NC_017272	TGA	2	6	326021	326026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430541
8572	NC_017272	CCT	2	6	326058	326063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8573	NC_017272	TCC	2	6	326084	326089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430541
8574	NC_017272	CGC	3	9	326094	326102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430541
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8577	NC_017272	GGC	2	6	326127	326132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430541
8578	NC_017272	G	6	6	326168	326173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_017272	GCC	2	6	326191	326196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430542
8580	NC_017272	GAG	2	6	326210	326215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430542
8581	NC_017272	AGG	2	6	326217	326222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430542
8582	NC_017272	GCC	2	6	326223	326228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430542
8583	NC_017272	CCA	2	6	326311	326316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430542
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8585	NC_017272	GCC	2	6	326404	326409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430542
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8587	NC_017272	CCCCG	2	10	326492	326501	0 %	0 %	20 %	80 %	384430542
8588	NC_017272	AGG	2	6	326526	326531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430542
8589	NC_017272	AGG	2	6	326538	326543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430542
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8593	NC_017272	GCC	2	6	326824	326829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430543
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8598	NC_017272	T	6	6	327078	327083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8602	NC_017272	GGC	2	6	327275	327280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430544
8603	NC_017272	GGC	2	6	327285	327290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430544
8604	NC_017272	AGG	2	6	327299	327304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430544
8605	NC_017272	TGC	2	6	327350	327355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430544
8606	NC_017272	GCCT	2	8	327367	327374	0 %	25 %	25 %	50 %	384430544
8607	NC_017272	CCCT	2	8	327376	327383	0 %	25 %	0 %	75 %	384430544
8608	NC_017272	C	6	6	327404	327409	0 %	0 %	0 %	100 %	384430544
8609	NC_017272	GTG	2	6	327472	327477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430544
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8613	NC_017272	GGGA	2	8	327584	327591	25 %	0 %	75 %	0 %	384430544
8614	NC_017272	GGA	2	6	327600	327605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430544
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8617	NC_017272	G	6	6	327722	327727	0 %	0 %	100 %	0 %	384430544
8618	NC_017272	G	7	7	327761	327767	0 %	0 %	100 %	0 %	384430544
8619	NC_017272	C	6	6	327770	327775	0 %	0 %	0 %	100 %	384430544
8620	NC_017272	CTC	2	6	327778	327783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430544
8621	NC_017272	GAG	2	6	327844	327849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430544
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