MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 49593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_017272	TCCTCG	2	12	306405	306416	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384430519
8003	NC_017272	G	6	6	306433	306438	0 %	0 %	100 %	0 %	384430519
8004	NC_017272	CGC	2	6	306474	306479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430519
8005	NC_017272	GCCC	2	8	306492	306499	0 %	0 %	25 %	75 %	384430519
8006	NC_017272	GCGCAG	2	12	306503	306514	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430519
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8008	NC_017272	CTC	2	6	306521	306526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430519
8009	NC_017272	TTC	2	6	306588	306593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430519
8010	NC_017272	ACC	2	6	306594	306599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430519
8011	NC_017272	CTC	2	6	306601	306606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430519
8012	NC_017272	CGG	2	6	306658	306663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430519
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8014	NC_017272	GCC	2	6	306686	306691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430519
8015	NC_017272	C	6	6	306704	306709	0 %	0 %	0 %	100 %	384430519
8016	NC_017272	CCCG	2	8	306713	306720	0 %	0 %	25 %	75 %	384430519
8017	NC_017272	G	6	6	306731	306736	0 %	0 %	100 %	0 %	384430519
8018	NC_017272	G	7	7	306740	306746	0 %	0 %	100 %	0 %	384430519
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8022	NC_017272	GAG	2	6	306881	306886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430520
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8054	NC_017272	GCG	2	6	308013	308018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430521
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8058	NC_017272	CCCT	2	8	308080	308087	0 %	25 %	0 %	75 %	384430521
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8124	NC_017272	TG	3	6	310118	310123	0 %	50 %	50 %	0 %	384430522
8125	NC_017272	TCC	2	6	310142	310147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430522
8126	NC_017272	C	6	6	310169	310174	0 %	0 %	0 %	100 %	384430522
8127	NC_017272	CTTG	2	8	310203	310210	0 %	50 %	25 %	25 %	384430522
8128	NC_017272	GGA	2	6	310216	310221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430522
8129	NC_017272	CGG	2	6	310242	310247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430522
8130	NC_017272	TGGG	2	8	310253	310260	0 %	25 %	75 %	0 %	384430522
8131	NC_017272	TCT	2	6	310287	310292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430522
8132	NC_017272	CCG	2	6	310293	310298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430522
8133	NC_017272	GGGC	2	8	310299	310306	0 %	0 %	75 %	25 %	384430522
8134	NC_017272	CCT	2	6	310368	310373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430522
8135	NC_017272	GGA	2	6	310432	310437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430522
8136	NC_017272	GGT	2	6	310440	310445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430522
8137	NC_017272	TGCGG	2	10	310449	310458	0 %	20 %	60 %	20 %	384430522
8138	NC_017272	GAGGTG	2	12	310493	310504	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384430522
8139	NC_017272	GAGC	2	8	310507	310514	25 %	0 %	50 %	25 %	384430522
8140	NC_017272	GCTG	2	8	310524	310531	0 %	25 %	50 %	25 %	384430522
8141	NC_017272	GAA	2	6	310532	310537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430522
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8145	NC_017272	CTG	2	6	310711	310716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430522
8146	NC_017272	CGC	2	6	310769	310774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430523
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8148	NC_017272	AGG	2	6	310811	310816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430523
8149	NC_017272	GGA	2	6	310922	310927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430523
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8151	NC_017272	GGA	2	6	311000	311005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430523
8152	NC_017272	GGC	2	6	311048	311053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430523
8153	NC_017272	GAG	2	6	311148	311153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430523
8154	NC_017272	GCGG	2	8	311168	311175	0 %	0 %	75 %	25 %	384430523
8155	NC_017272	CCG	2	6	311224	311229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430523
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8162	NC_017272	CGG	2	6	311350	311355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430523
8163	NC_017272	TCC	2	6	311413	311418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430523
8164	NC_017272	CGGGG	2	10	311496	311505	0 %	0 %	80 %	20 %	384430523
8165	NC_017272	G	6	6	311551	311556	0 %	0 %	100 %	0 %	384430523
8166	NC_017272	CCT	2	6	311588	311593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430523
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8168	NC_017272	TCC	3	9	311632	311640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430523
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8175	NC_017272	CTT	2	6	311933	311938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430524
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8185	NC_017272	GAG	4	12	312163	312174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430525
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8188	NC_017272	GCCCC	2	10	312244	312253	0 %	0 %	20 %	80 %	384430525
8189	NC_017272	GGCCC	2	10	312262	312271	0 %	0 %	40 %	60 %	384430525
8190	NC_017272	GAG	3	9	312283	312291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430525
8191	NC_017272	GAG	4	12	312310	312321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430525
8192	NC_017272	AGG	2	6	312339	312344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430525
8193	NC_017272	C	6	6	312378	312383	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8194	NC_017272	TCC	2	6	312435	312440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430526
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8199	NC_017272	CGATGG	2	12	312574	312585	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430526
8200	NC_017272	GC	3	6	312651	312656	0 %	0 %	50 %	50 %	384430526
8201	NC_017272	CCT	2	6	312727	312732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430526
8202	NC_017272	GTG	2	6	312753	312758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430526
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8212	NC_017272	TCC	2	6	313426	313431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430527
8213	NC_017272	CCT	2	6	313478	313483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430527
8214	NC_017272	CGG	2	6	313489	313494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430527
8215	NC_017272	CCT	2	6	313499	313504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430527
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8218	NC_017272	C	7	7	313542	313548	0 %	0 %	0 %	100 %	384430527
8219	NC_017272	G	6	6	313583	313588	0 %	0 %	100 %	0 %	384430527
8220	NC_017272	CCG	2	6	313617	313622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430527
8221	NC_017272	CGGAGG	2	12	313627	313638	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384430527
8222	NC_017272	CT	3	6	313692	313697	0 %	50 %	0 %	50 %	384430527
8223	NC_017272	G	6	6	313753	313758	0 %	0 %	100 %	0 %	384430527
8224	NC_017272	AGG	2	6	313759	313764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430527
8225	NC_017272	CCG	2	6	313808	313813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430527
8226	NC_017272	CCA	2	6	313946	313951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430527
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8228	NC_017272	TCC	3	9	314018	314026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430528
8229	NC_017272	GGA	2	6	314058	314063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430528
8230	NC_017272	GCC	2	6	314099	314104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430528
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8232	NC_017272	CCG	2	6	314228	314233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430528
8233	NC_017272	CCT	2	6	314426	314431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430529
8234	NC_017272	TCC	2	6	314464	314469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430529
8235	NC_017272	GAG	2	6	314493	314498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430529
8236	NC_017272	CCA	2	6	314501	314506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430529
8237	NC_017272	GAG	2	6	314511	314516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430529
8238	NC_017272	ACG	2	6	314542	314547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430529
8239	NC_017272	CCG	3	9	314558	314566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430529
8240	NC_017272	AGG	2	6	314599	314604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430529
8241	NC_017272	GAG	2	6	314649	314654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430529
8242	NC_017272	C	6	6	314667	314672	0 %	0 %	0 %	100 %	384430529
8243	NC_017272	GTC	2	6	314703	314708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430529
8244	NC_017272	CGCC	2	8	314721	314728	0 %	0 %	25 %	75 %	384430529
8245	NC_017272	AGG	2	6	314731	314736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430529
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8494	NC_017272	TCA	2	6	323262	323267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430539
8495	NC_017272	CCAG	2	8	323286	323293	25 %	0 %	25 %	50 %	384430539
8496	NC_017272	CCA	2	6	323295	323300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430539
8497	NC_017272	ACCA	2	8	323345	323352	50 %	0 %	0 %	50 %	384430539
8498	NC_017272	AGG	2	6	323399	323404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430539
8499	NC_017272	GCGG	2	8	323512	323519	0 %	0 %	75 %	25 %	384430539
8500	NC_017272	CTT	2	6	323528	323533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430539

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